陈小兵
- 作品数：4 被引量：19H指数：3
- 供职机构：上海海洋大学食品学院更多>>
- 发文基金：上海市人才发展基金上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程生物学更多>>
- 洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点被引量：4
- 2014年
- 利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域（小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道）的古菌群落多样性组成不存在明显的区别;利用定量PCR的方法对3个不同样品中的古菌16S rRNA基因拷贝进行计数,发现3个不同海域的古菌16S rRNA基因拷贝数的数量关系为：大洋山海域（（1.69±0.19）×106 copies/mL）＜中间航道（（2.17±0.20）×106 copies/mL）＜小洋山港口区（（2.42±0.22）× 106 copies/mL）,这说明洋山深水港3个不同海域的古菌群落组成是一致的,只是在数量上略有差异,为对该海域古菌的更深入调查研究提供了便利和数据基础.洋山深水港海域表层海水的古菌16S rRNA基因文库分析表明,古菌由三大门类组成：广古菌门（Euryarchaeota）、泉古菌门（Crenarchaeota）和奇古菌门（Thaumarchaeota）.广古菌门所占比例约为26.8％,泉古菌门约为33.0％,奇古菌门约为40.2％.广古菌门含有2个类群,分别是Mathanobacteriales（10.3％）和Marine Group Ⅱ（16.5％）;泉古菌门含有1个类群,为Unidentified Crenarchaeotic Group（33.0％）;奇古菌门含有1个类群,为Marine Group Ⅰ （40.2％）.结果显示,Mathanobacteriales类群和Marine Group Ⅱ类群的比例失调,这可能预示着洋山深水港海域存在油污污染及外来微生物物种入侵的风险.
- 孙国伟肖劲洲陈小兵王洪明龚超文潘迎捷王永杰
- 关键词：洋山深水港RRNA基因古菌多样性
- 中华绒螯蟹肠道核心菌群初探
- 在中国，中华绒螯蟹是极受欢迎的美食，近几年大闸蟹的人工养殖产量逐年快速增长，成为水产经济养殖重要组成部分。但随着水产养殖集约化的提高，抗生素不断滥用，导致环境污染，病害加重，新的抗菌方法或者替代品急需被研制出来以减少抗生...
- 陈小兵
- 关键词：中华绒螯蟹高通量测序
- 西藏开菲尔粒中酵母菌的分离与初步鉴定被引量：10
- 2015年
- 西藏开菲尔粒（俗称藏灵菇）是由多种乳酸菌（间或少量醋酸菌）和酵母菌共生而成一种外形酷似菜花的白色或乳黄色团状聚合体,是目前已知的唯一可用于酸奶制作的天然野生菌种资源。采用扫描电镜、分离培养、26S rRNA基因测序与序列分析、荧光原位杂交（FISH）相结合的技术方法,对西藏开菲尔粒中的酵母菌进行了分离培养、鉴定和形态观察。结果显示：西藏开菲尔粒中酵母菌多为球形（2.0~5.0μm）或椭圆形（1.0~3.0×2.0~4.0μm）;从西藏开菲尔粒中分离出的16株酵母菌分属于酿酒酵母属（Saccharomyces）、克鲁维酵母属（Kluyveromyces）、亚罗酵母属（Yarrowia）这3个属中的4个种,其中3株是酿酒酵母菌（Saccharomyces cerevisiae）,8株为马克斯克鲁维酵母菌（Kluyveromyces marxianus）,3株为解脂亚罗酵母菌（Yarrowia lipolytica）。
- 卢曼陈小兵王兴兴潘迎捷王永杰
- 关键词：RRNAFISH扫描电镜
- 养殖中华绒螯蟹肠道内优势细菌群组成分析被引量：5
- 2014年
- 采用荧光染色计数法对养殖中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肠道内微生物进行定量分析。结果表明肠道内细菌数量为(2.5±0.9)×106/μL。同时采用分离培养与16S rDNA基因克隆测序相结合的方法对其进行多样性分析,旨在揭示其中可培养细菌的组成结构。结果发现,分离自养殖中华绒螯蟹肠道内的49株代表性细菌均属于γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria),其中假单胞菌属(Pseudomonas)、气单胞菌属(Aeromonas)和肠杆菌科(Enterobacteriales)为优势菌群。
- 狄盼盼陈小兵孙国伟肖劲洲潘迎捷
- 关键词：中华绒螯蟹肠道微生物优势菌群克隆测序
