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朱乾坤

作品数：16 被引量：29H指数：3
供职机构：西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
相关领域：生物学农业科学医药卫生文化科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 15篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 9篇生物学
  • 5篇农业科学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇文化科学

主题

  • 9篇石斛
  • 9篇铁皮石斛
  • 6篇生物信息
  • 6篇生物信息学
  • 6篇基因
  • 4篇转录
  • 3篇转录因子
  • 3篇基因表达
  • 2篇生物信息学分...
  • 2篇胁迫
  • 2篇萌发
  • 2篇萌发率
  • 2篇克隆
  • 2篇基因家族
  • 2篇家族
  • 1篇大学生
  • 1篇植物
  • 1篇生物胁迫
  • 1篇生物学
  • 1篇生物学功能

机构

  • 16篇西南交通大学

作者

  • 16篇朱乾坤
  • 11篇王万军
  • 4篇廖海
  • 4篇周嘉裕
  • 3篇宋涛
  • 3篇李娟娟
  • 2篇朱梦丽
  • 2篇邹嘉欣
  • 2篇冯沛春
  • 1篇李遂焰
  • 1篇黄宇
  • 1篇范高韬
  • 1篇黄新河
  • 1篇曾颖苹
  • 1篇吕楠
  • 1篇张子凤

传媒

  • 3篇北方园艺
  • 2篇生物技术
  • 2篇植物生理学报
  • 1篇生物技术通讯
  • 1篇福建农业学报
  • 1篇西北农业学报
  • 1篇广西植物
  • 1篇生物工程学报
  • 1篇分子植物育种
  • 1篇生物信息学
  • 1篇基因组学与应...

年份

  • 1篇2024
  • 1篇2023
  • 6篇2022
  • 2篇2015
  • 3篇2014
  • 2篇2013
  • 1篇2012
共 16 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
铁皮石斛甘露糖结合凝聚素的分子建模与对接研究
2013年
本文通过序列分析获得了铁皮石斛甘露糖结合凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖结合位点(50-58AA,81-89AA,116-124AA)。通过同源建模建立了DOL三维结构模型,DOL呈中空的三棱柱结构,三棱柱的三个侧面主要由β折叠构成,三个侧面各有一个甘露糖结合部位。甘露糖与DOL的分子对接和动力学分析表明,结合位点50-58AA和81-89AA对甘露糖的结合要强于116-124AA,在与甘露糖结合的过程中发挥关键作用的氨基酸残基为Gln81,Asp83,Asn85和Tyr89。研究结果有助于进一步开展凝集素抗病机理及凝集素相关药物研究。
朱梦丽朱乾坤邹嘉欣冯沛春范高韬王万军
关键词：甘露糖结合凝集素铁皮石斛同源建模分子对接
铁皮石斛人工种子包衣技术研究被引量：13
2012年
以铁皮石斛未萌发原球茎、萌发原球茎为繁殖体,利用蔗糖、淀粉、ABA、NAA、活性炭、多菌灵、海藻酸钠设计了36种人工胚乳并研究它们对铁皮石斛人工种子萌发及生长状态的影响,筛选出适宜的繁殖体和胚乳配方,在此基础上进行包衣制作。结果表明:以萌发原球茎为繁殖体的人工种子萌发率和成活率较高。适宜的人工胚乳组合为蔗糖3.0%、ABA 1.0mg/L、活性炭浓度0.5%、多菌灵3.0%、海藻酸钠3.0%。在铁皮石斛人工种子外层制作包衣,自然条件下可获得较高的萌发率和成活率。
曾颖苹朱乾坤王万军
关键词：铁皮石斛人工种子包衣萌发率
铁皮石斛膜结合转录因子NTL家族全基因组鉴定及表达分析被引量：1
2022年
NTL(NAC with transmembrane motif like)是普遍存在于单子叶和双子叶植物中的膜结合转录因子,在调控植物生长发育、逆境胁迫应答中发挥重要作用。NTL在石斛属(Dendrobium)植物中的生物学功能仍未知。本文在铁皮石斛(D.officinale)全基因组水平鉴定出7个NTL。利用生物信息学手段对DoNTL家族成员进行跨膜结构和系统进化分析,并预测蛋白质的二、三级结构以及蛋白质保守基序。通过逆转录PCR分析了DoNTL对不同胁迫的响应以及在根、茎、叶中的表达情况。结果显示,DoNTL基因在根、茎、叶中均有表达。胁迫处理下,NaCl诱导了NTL1、2、3、4、7的表达,抑制了NTL5的表达;脱落酸(ABA)诱导了NTL1、2、3、4的表达,抑制了NTL5的表达;聚乙二醇(PEG)诱导了NTL1、2、3、4、7的表达;高温抑制了NTL3、7的表达;低温诱导了NTL1、4的表达,抑制了NTL3的表达。表明DoNTL广泛参与非生物胁迫。这些结果为后续研究NTL在铁皮石斛生长发育过程中的功能提供数据支持。
胡浩聂聪龙小琴何基泽杨乐王万军朱乾坤
关键词：铁皮石斛基因表达胁迫处理
转录因子WRKY71对拟南芥根系发育的影响被引量：2
2022年
WRKY家族是拟南芥中最大的转录因子家族之一,为探究其中WRKY71在拟南芥根系生长发育过程中的调控作用,本研究利用WRKY71突变体exb1、过表达株系exb1-D及WRKY71-EAR融合子株系EXB1-SRDX,通过对其幼苗表型分析发现,突变体与野生型无明显差异,WRKY71过表达株系萌发率显著降低了50.6%,WRKY71-EAR融合子株系根毛平均数量、根毛平均长度、主根平均直径及平均鲜重比野生型分别增加了4.6%、118.4%、1.8%、16%,而过表达株系则呈相反趋势,分别显著减少了50.2%、48.5%、17.8%、17.6%。以上结果表明突变体中仍然存在与WRKY71功能冗余的同源基因,WRKY71过表达抑制幼苗早期发育,进而阻碍植株生物量累积,而WRKY71-EAR融合子则能够显著增加拟南芥幼苗早期的生物量。本文为进一步研究WRKY71及同源基因的生物学功能奠定了重要基础。
陈凤颖龙小琴聂聪何基泽杨乐胡浩王万军朱乾坤
关键词：拟南芥萌发率根毛主根鲜重
铁皮石斛SPL膜结合(STM)转录因子的全基因组鉴定及表达分析
2023年
SPL转录因子广泛参与植物生长发育、胁迫响应等过程。目前,没有关于铁皮石斛SPL膜结合(SPL with transmembrane motif)转录因子即STM转录因子的研究。为了探究STM转录因子在铁皮石斛生长发育及胁迫响应等方面的作用,该文在铁皮石斛全基因组水平鉴定出4个STM转录因子,并对DoSTM基因家族成员进行生物信息学分析,又利用逆转录PCR研究了DoSTM在不同组织部位及不同逆境处理下的表达情况。结果表明:(1)DoSTM1-4为亲水蛋白,均具有SBP保守结构域和一些激素响应位点。(2)4个DoSTM在根茎叶中均有表达,DoSTM 2在叶中的相对表达量最低;DoSTM 1/3/4的相对表达水平均无明显差异。(3)DoSTM 1-4在低温、高温、干旱胁迫下的相对表达水平都有显著变化,DoSTM 1/3/4的表达量降低最为明显,故推测DoSTM与植物体内激素响应、温度变化响应及抗旱性有关。这些结论为后续进一步开展铁皮石斛STM转录因子的研究提供了参考。
杨乐聂聪龙小琴何基泽颜超越朱乾坤王万军
关键词：铁皮石斛基因鉴定功能分析
AtNAC1转录因子的分子建模和铁皮石斛NAC家族基因的克隆及表达分析
NAC是植物特有的一类转录因子家族，功能涉及植物的生长发育、信号转导、植物抗逆等多种生理过程。拟南芥AtNAC1转录因子参与植物生长素信号转导途径，在调节侧根生长发育中发挥重要作用。AtNAC1作为转录因子，通过识别并结...
朱乾坤
关键词：铁皮石斛基因表达分子克隆
铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析被引量：1
2022年
多糖是药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)的主要成分之一。鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶(rhamnogalacturonⅠrhamnosyltransferase,RRT)在Ⅰ型鼠李半乳糖醛酸聚糖的合成中起重要作用。利用生物信息学在全基因组水平鉴定出4个铁皮石斛RRT家族基因(DoRRT1、DoRRT2、DoRRT3、DoRRT4),通过逆转录定量PCR检测该基因家族在不同组织和胁迫下的表达情况。结果表明:在系统发育上DoRRT1、DoRRT3被聚为一组,DoRRT2、DoRRT4被聚为一组;DoRRT蛋白均为亲水蛋白质,可定位于高尔基体;DoRRT蛋白的α-螺旋和无规卷曲较多;4个DoRRT蛋白均有O-FucT保守结构域;组织表达显示DoRRT1、DoRRT2、DoRRT4在根、茎、叶中均有表达,且在地上部的转录水平较高;胁迫表达表明DoRRT2、DoRRT4在高温胁迫下表达显著下调,DoRRT2在PEG模拟干旱条件下表达显著下调,说明DoRRT2、DoRRT4参与非生物胁迫响应。以上结果为深入研究DoRRT的生物学功能提供数据支撑。
聂聪龙小琴何基泽孙语钒赵欣宇王万军朱乾坤
关键词：铁皮石斛生物信息学分析
决明巴豆酰辅酶A羧化酶基因的克隆、序列分析以及组织差异表达
2015年
通过RACE克隆得到了决明MCCase的cDNA,利用生物信息学进行系统分析,并利用荧光定量PCR对决明MCCase进行了差异表达分析。结果表明:决明MCCase全长1 269bp,编码423个氨基酸的蛋白质,为偏酸性不稳定蛋白质,定位于线粒体或细胞质中。决明MCCase与拟南芥的MCCase同源性最高。MCCase上有一个保守的功能结构域,与乙酰CoA羧化酶显示出较高的相似性,并在该结构域内发现了4个高度保守的氨基酸基序,可能在催化过程中发挥关键作用。MCCase在不同组织中存在差异表达,在根与胚轴中显示出高表达,在其它组织中表达量低,这可能与光和糖类抑制MCCase的表达有关。
刘祖碧李娟娟朱乾坤宋涛周嘉裕廖海
关键词：决明基因克隆生物信息学基因表达
Kunitz蛋白酶抑制剂基因的密码子偏好性分析被引量：2
2014年
目的:分析豆科植物的Kunitz蛋白酶抑制剂(KTI)基因密码子偏好性,确定最适模式植物与外源表达系统。方法:运用Codon W等程序分析密码子偏好性,并用决明KTI基因验证分析结果的可信度。通过聚类分析,确定研究KTI基因功能的最适模式植物,比较决明KTI基因与酵母和大肠杆菌的基因组密码子偏好性,选择最优外源表达系统。结果:KTI基因对以A或U结尾的密码子偏好性强。豆科与茄科植物聚为一簇,表明烟草是研究KTI基因功能的最适模式植物。决明KTI基因和大肠杆菌、酵母基因组对比,有较大密码子使用频率差异的各有28、24个,表明酵母是最优外源表达系统。结论:确定研究KTI基因功能的最佳模式植物是烟草,酵母是最优外源表达系统,对基因改良与育种具有指导意义。
李娟娟黄宇刘祖碧朱乾坤宋涛周嘉裕廖海
关键词：密码子偏好性聚类分析
合成生物学与国际遗传工程机器大赛对培养大学生双创思维与能力的影响被引量：3
2022年
合成生物学是21世纪前沿交叉学科,是现代生物学最具发展空间的领域之一。随着合成生物学的迅速发展,国际基因工程机器大赛(International Genetically Engineered Machine,iGEM)应运而生。iGEM竞赛项目基于合成生物学学科基础,应用现代生物学技术手段,立足解决社区和身边的实际生物相关问题。近年来,随着参赛团队的不断增加,iGEM竞赛得到了广泛的关注与发展。本文基于合成生物学发展概况,通过对iGEM竞赛2018–2020年获奖项目情况进行分析,并结合西南交通大学iGEM团队的参赛经历,剖析iGEM竞赛在培养大学生双创思维和能力中的重要意义和实现途径。
简甜甜李遂焰廖海周嘉裕朱乾坤黄新河
关键词：合成生物学创新创业
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