周嘉裕 作品数:118 被引量:363 H指数:10 供职机构: 西南交通大学生命科学与工程学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 四川省应用基础研究计划项目 中央高校基本科研业务费专项资金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 农业科学 文化科学 更多>>
“创新能力培养”驱动下生物化学实践教学的改革 被引量:4 2015年 生物化学是生物类本科专业的必要基础课程,生物化学实践教学是生物化学课程的重要组成部分,对提高学生的创新能力至关重要。课程组结合近年来生物化学实践教学的改革,从实践教学体系、教学内容、教学方法、考核方式等方面做阐述和经验总结。 廖海 李遂焰 周嘉裕 李萍关键词:生物化学 实践教学 药用植物学教学质量提升实践 被引量:2 2016年 目的提高药用植物学课程的教学质量及学生的创新能力。方法改革理论教学模式,开展创新研究性实验教学,强化药用植物学实习与科研教学结合。结果新的教学模式能激发学生的学习兴趣,提升学生的学习主动性与整体性,有利于学生实际工作能力的培养。结论新的教学模式可作为提升药用植物学教学质量的一种模式借鉴。 周嘉裕 廖海关键词:药用植物学 实践教学 教学质量 决明苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因家族的全基因组分析 2023年 利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从决明(Senna tora)等不同物种中筛选获得26条PAL(苯丙氨酸解氨酶)序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,决明PAL基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成,且6个PAL成员被分为3个亚类。决明PAL基因家族成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;含有较高的Ala、Ser和Leu残基;存在16种不同的保守基序,其中motif12(含有催化关键序列Ala-Ser-Gly)在所有PAL成员中均出现;启动子区含有较多的光反应、植物激素响应与逆境胁迫响应元件。进一步的GO、转录组与Pearson分析也强化了以上分析结果,即决明PAL基因家族成员多集中在叶、茎和花等易感受光的组织,参与抗旱与抗菌等生物学过程呈现多样化的特点。以上分析结果将为决明PAL基因的后续功能研究及抗逆功能基因筛选提供理论基础。 赵咏洋 陈维嘉 丁静峰 敖以恒 冯傲 周嘉裕关键词:基因家族 HPLC法测定不同胁迫条件下川芎根中阿魏酸的含量 被引量:5 2017年 目的测定不同胁迫条件下川芎根中阿魏酸的含量。方法 HPLC法,依利特Hypersil ODS2(4.6mm×200mm,5μm),流动相0.1%的磷酸-甲醇(66:34)等度洗脱,流速1m L/min,检测波长为323nm,柱温30℃。结果阿魏酸进样量在0.3~2.0μg时线性关系良好,r=0.9995,平均回收率为98.3%,RSD为2.1%。对不同胁迫条件下川芎根中阿魏酸的含量测定结果表明,川芎盐胁迫组中的阿魏酸含量最高,干旱胁迫组次之,低温胁迫组最少,但均高于空白组。结论盐、干旱、低温三种胁迫方式均能使川芎根中阿魏酸蓄积。 朱建全 向缅 孙梦杰 许洁云 廖海 周嘉裕关键词:川芎 阿魏酸 HPLC 棉铃虫类胰蛋白酶的生物信息学分析 被引量:1 2013年 对棉铃虫(Helicoverpa armigera L.)肠道内7种类胰蛋白酶的氨基酸序列进行了生物信息学分析。结果表明,棉铃虫7种类胰蛋白酶理化性质相近,含有丰富的Ala、Cys、Gly与Thr,均为可溶性蛋白酶,不稳定性较高。类胰蛋白酶分子中不存在跨膜结构域,含有特定的磷酸化位点,主要分布在细胞外基质与内质网中。棉铃虫类胰蛋白酶属于胰蛋白酶超家族成员,具有较高的氨基酸序列同源性,分子中含有保守的必需氨基酸残基,参与维持蛋白酶的空间结构及行使催化功能。分子进化研究表明类胰蛋白酶Ⅲ与类胰蛋白酶Ⅵ进化关系较近,而类胰蛋白酶Ⅰ和类胰蛋白酶Ⅱ在进化关系上更为接近。无规卷曲结构是类胰蛋白酶二级结构中的主要结构元件。 龙婷 雷洁萍 宋涛 和丽然 周嘉裕 廖海关键词:ARMIGERA 类胰蛋白酶 生物信息学 HPLC测定决明不同组织中大黄酚和橙黄决明素含量 被引量:1 2017年 为了测定决明不同组织中大黄酚和橙黄决明素的含量。分别收集了决明种子、根、茎、花、叶、果荚、子叶、胚轴、愈伤与不定根等组织,利用回流提取法提取大黄酚与橙黄决明素,高效液相色谱法(HPLC)进行含量测定。采用依利特反相色谱柱,以大黄酚和橙黄决明素为指标,以乙腈-0.1%磷酸水为流动相进行梯度洗脱,流速1 m L/min,检测波长为284 nm,柱温30℃。结果表明:大黄素型蒽醌类化合物在决明中的分布具有明显的组织特异性,其中,决明种子、胚轴、不定根、子叶与愈伤组织中含有大黄酚与橙黄决明素,决明根中仅含有大黄酚,其余组织不含有大黄酚与橙黄决明素,其余总蒽醌含量依次为子叶>不定根>愈伤组织>胚轴>根>花。决明种子成熟过程中,大黄酚的含量呈现"波浪式上升"的趋势,峰值出现在11月下旬;而橙黄决明素的含量呈现"先上升后下降"的趋势,峰值出现在11月中旬。由于大黄酚与橙黄决明素的含量在决明不同成熟时期分别出现峰值,建议采收11月下旬的决明种子以获得大黄酚,采收11月中上旬的决明种子以获得较多的橙黄决明素。 邓银 靳学 张娴 朱建全 向缅 谭艳 廖海 周嘉裕关键词:HPLC 大黄酚 橙黄决明素 决明胰蛋白酶抑制剂的同源建模与定点突变 被引量:1 2021年 决明胰蛋白酶抑制剂(Cassia obtusifolia trypsin inhibitor,CoTI)是植物Kunitz蛋白酶抑制剂家族的一个成员,对胰蛋白酶具有较强的抑制活性。利用同源建模预测CoTI的三维模型,发现其形成了β-三叶草型三维结构,由底部的β-桶与顶部的盖子区域组成。通过氨基酸序列和三维模型比对,发现CoTI含有一个保守的Trp114残基,该残基位于盖子区域,与β-桶的Leu98和Ser137形成氢键,其侧链伸向Barrel,和Val68、Leu98、Phe100等形成疏水作用,推测其在β-三叶草型三维结构的形成与稳定中发挥重要作用。使用定点突变技术将Trp114残基突变为Ala残基后,相比于野生型CoTI,CoTI Trp114Ala突变体对牛胰蛋白酶和菜青虫中肠类胰蛋白酶的抑制活性分别下降63.4%和62.0%,证明Trp114残基对发挥CoTI抑制活性的重要性。结果为CoTI的结构-功能研究及相关的应用奠定理论基础。 李超林 张田 邹萌 廖海 周嘉裕关键词:决明 胰蛋白酶抑制剂 同源建模 定点突变 一种快速鉴定伊犁贝母的特异性核酸探针、方法及用途 本发明提供一种快速鉴定伊犁贝母的特异性核酸探针、方法及用途,属中药材来源品种鉴定技术领域。本发明首次发现以该Taqman探针为核心的Taqman荧光定量PCR方法能够特异性鉴定伊犁贝母,仅有伊犁贝母显示阳性结果,其它贝母... 周嘉裕 廖海 王微微 李冉郡 张田 邹萌 罗定文献传递 Kunitz蛋白酶抑制剂基因的密码子偏好性分析 被引量:2 2014年 目的:分析豆科植物的Kunitz蛋白酶抑制剂(KTI)基因密码子偏好性,确定最适模式植物与外源表达系统。方法:运用Codon W等程序分析密码子偏好性,并用决明KTI基因验证分析结果的可信度。通过聚类分析,确定研究KTI基因功能的最适模式植物,比较决明KTI基因与酵母和大肠杆菌的基因组密码子偏好性,选择最优外源表达系统。结果:KTI基因对以A或U结尾的密码子偏好性强。豆科与茄科植物聚为一簇,表明烟草是研究KTI基因功能的最适模式植物。决明KTI基因和大肠杆菌、酵母基因组对比,有较大密码子使用频率差异的各有28、24个,表明酵母是最优外源表达系统。结论:确定研究KTI基因功能的最佳模式植物是烟草,酵母是最优外源表达系统,对基因改良与育种具有指导意义。 李娟娟 黄宇 刘祖碧 朱乾坤 宋涛 周嘉裕 廖海关键词:密码子偏好性 聚类分析 大学生科研训练计划在生物与药学类人才培养中的作用与思考 被引量:1 2020年 大学生科研训练计划(Student Research Training Program,简称SRTP)旨在为本科生提供科研训练机会,增强学生的创新意识和科研能力,已成为培养本科创新人才的重要环节。本文介绍西南交通大学生命科学与工程学院近年来组织、管理与实施SRTP所开展的工作,并结合"药用植物资源与分子生物学"研究团队开展SRTP的基本情况,阐述SRTP对生物与药学专业学生培养的作用。然而,由于SRTP的诸多现有问题,也提出强化专业实验室建设等设想与建议,从而促进本科培养体系、SRTP支撑体系与输出成果的平衡与良性发展。 廖海 周嘉裕 李遂焰