陈蕾
- 作品数：2 被引量：19H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析被引量：15
- 2016年
- ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用。本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析。目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子。亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号。转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础。
- 孙亭亭张磊陈乐龚达平王大伟陈雅琼陈蕾孙玉合
- 关键词：普通烟草系统进化基因表达
- 烟草BRANCHED1-Like基因的克隆及表达分析被引量：4
- 2015年
- TCP转录因子家族CYC/TB1簇中成员BRC1在调控植物侧枝发育的过程中发挥重要作用。本研究利用电子克隆结合RT-PCR方法从普通烟草(Nicotiana tabacum)中克隆获得4个Nt BRC1-Like基因,分别命名为Nt BRC1-Like1、Nt BRC1-Like2、Nt BRC1-Like3和Nt BRC1-Like4。4条基因的CDS序列长度分别为1140 bp、1062 bp、987 bp和1041 bp,分别编码由379、353、328和346个氨基酸组成的蛋白,这4个蛋白与CYC/TB1簇中其他成员具有较高相似性。蛋白质保守结构域分析表明,4个Nt BRC1-Like基因编码的蛋白除具有TCP核心结构域外,还具有CYC/TB1簇蛋白特有的R结构域。系统进化树分析表明,Nt BRC1-Like蛋白都是TCP家族CYC/TB1簇中的成员,且4个Nt BRC1-Like蛋白可以被分成2组,Nt BRC1-Like1和Nt BRC1-Like4为一组,Nt BRC1-Like2和Nt BRC1-Like3为另一组。荧光定量PCR分析发现,4个烟草Nt BRC1-Like基因的表达呈现明显的组织特异性,且其表达模式可分为2种:Nt BRC1-Like1和Nt BRC1-Like4的表达模式相似,在腋芽中有极高的表达;Nt BRC1-Like2和Nt BRC1-Like3的表达模式十分相似,在叶和腋芽中的表达量都显著高于其他组织。推测烟草BRC1基因可能存在类似番茄BRC1基因在功能上保守与进化的情况。
- 陈雅琼孙亭亭陈蕾丁安明陈涣孙玉合
- 关键词：烟草基因克隆基因表达分析
