孙玉合 作品数:79 被引量:530 H指数:13 供职机构: 中国农业科学院烟草研究所 更多>> 发文基金: 国家烟草专卖局基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 自动化与计算机技术 更多>>
绒毛状烟草和林烟草全长cDNA文库构建及EST序列分析 2018年 表达序列标签(EST)广泛应用于基因功能研究和分子标记开发。以普通烟草两个二倍体祖先种绒毛状烟草(Nicotiana tomentosiformis, TT)和林烟草(Nicotiana sylvestris, SS)多个组织为试验材料,使用CloneMiner cDNA文库构建方法构建了均一化全长c DNA文库,测序并进行序列拼接、功能注释、进化分析和标记开发。绒毛状烟草和林烟草均一化全长c DNA文库容量分别为0.72×106和1.12×106pfu/mL,重组率分别约为94%和93%,插入片段平均长度为1.4kb。测序获得20 953条EST序列,拼接为10 504个unigenes。与普通烟草EST序列混合拼接,产生34 450条contigs,123 511条singletons,烟草异源四倍体中T和S基因与绒毛状烟草、林烟草之间的相似性远高于两个二倍体祖先种之间。预测获得104 915个编码序列,其中73 670个序列包含功能结构域,81%unigenes在番茄中具有同源基因。鉴定了11 869个微卫星位点(SSR)和25 209个单核苷酸多态性位点(SNP)。这些数据信息对于烟草基因功能研究和分子育种具有重要价值。 孙榕 陈明丽 解敏敏 孙玉合 龚达平关键词:烟草 CDNA文库 SSR 一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法和材料 本发明提供了一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法,所述方法包括以下步骤:S1、将转基因烟草进行播种、育苗和移栽,并进行打顶;所述转基因烟草的基因组中插入有外源核酸;所述外源核酸包括化学诱导型启动子和致死基因;S2、在打顶后... 吕婧 代常波 陈雅琼 丁安明 高晓明 孙玉合文献传递 烟草细胞质雄性不育系tab1-CMS特异性分子标记及其应用 本发明属于植物基因工程领域,涉及烟草细胞质雄性不育系tab1‑CMS特异性分子标记及其应用。本发明筛选得到了烟草tab1‑CMS品种的特异性分子标记,利用其可快速、准确地鉴定烟草tab1‑CMS品种,本发明对丰富烟草不育... 李凤霞 刘艳芳 刘志文 杨爱国 孙玉合文献传递 高等植物钾转运蛋白 本文以模式植物拟南芥中克隆和鉴定的钾通道和转运体为基础,全面介绍了高等植物中钾转运体系家族,包括Shaker通道、KCO通道、KUP/HAK/KT转运体、HKT转运体和其它转运体.同时,分析了在高等植物中存在多种钾吸收和... 刘贯山 王元英 孙玉合关键词:烟草品质 烟叶钾含量 文献传递 烟草NtRAX基因的克隆和序列分析 被引量:1 2012年 根据GenBank中拟南芥RAX基因序列,在烟草EST数据库中进行Blastp检索,获得与之同源性较高的蛋白质序列,选取同源性最高的蛋白质序列所对应的核酸序列,设计引物,获得中间片段,再运用中间片段设计引物,应用RACE方法获得其5′和3′末端cDNA序列,将获得的3段序列拼接,结合全长克隆测序验证,获得一个新的普通烟草基因,将其命名为NtRAX(NCBI登录号为JQ228591)。NtRAX的cDNA全长为1112 bp,5′端非编码区96 bp,3′端非编码区62 bp,编码区长度为954 bp,编码317个氨基酸,预测的分子量是35.42 KDa。对该基因进行序列分析和功能预测,得出该基因属于MYB基因家族,是具有转录激活活性的烟草腋芽分生组织形成的调控基因。 高晓明 张泽坤 王卫锋 刘贯山 李凤霞 崔萌萌 孙玉合关键词:烟草 腋芽 基因 烟草TILLING技术体系的建立及NtPhyB基因的筛选 被引量:1 2014年 定向诱导基因组局部突变技术(Targeting Induced Local Lesions In Genomes,TILLING)是一种新近发展起来的高通量检测点突变的反向遗传学方法。本研究首次将TILLING技术用于EMS处理的烟草突变体筛选中,通过对正反向荧光引物使用量的摸索,确定了10μL PCR体系中IRDye-700标记的正向引物(1μM)适用量为0.32~0.64μL,IRDye-800标记的反向引物(1μM)适用量1.12~1.6μL;对异源双链CELⅠ酶切体系实验表明,10μL PCR产物中加入0.6μL CEL I酶,1.5μL 10× Buffer酶切效果最好。从而建立并优化了适用于普通烟草基因组研究的TILLING技术体系。在此基础上,以NtPhyB为目标基因,在1000份0.6% EMS诱变的M2突变体中进行筛选,共得到13个突变体,该基因突变频率约为1/94 kb。本试验建立的TILLING筛选体系能够快速、高效地筛选任意已知序列基因的突变体,对烟草功能基因组研究具有重要意义。 宗鹏 李凤霞 王倩 刘贯山 龚达平 陈雅琼 孙玉合关键词:功能基因组学 烟草 化学诱变 突变体 抗二氯喹啉酸烟草材料的筛选与鉴定 2022年 为获得抗二氯喹啉酸的烟草育种材料,本研究通过叶面喷施不同浓度二氯喹啉酸,研究受药害烟株叶面积变化规律和烟草药害等级情况,确定喷施二氯喹啉酸对烟草苗期药害的临界浓度及适宜观测时间,并对烟草EMS突变体材料进行规模化筛选鉴定。结果表明,喷施处理引起烟草药害的临界浓度为0.5 mg/L,超出临界值浓度,烟草叶片会出现明显药害症状;为获得较高抗性的突变体材料,以1 mg/L为最适施药浓度,在药害症状明显时(施药后14 d)进行观测,获得了多个对二氯喹啉酸高抗、中抗及敏感的突变体材料。对高抗材料QR-19的杂交一代株系抗性分析显示,该材料对二氯喹啉酸的抗性可能受隐性基因控制。本研究为解析烟草对二氯喹啉酸等激素型除草剂的抗药性机理及除草剂抗性育种奠定了材料基础。 李冰洁 王李先秋 宋青松 徐沛雯 吕婧 崔萌萌 孙玉合 代常波关键词:二氯喹啉酸 烟草 抗性筛选 四种细胞质来源的烟草不育系线粒体SSR位点差异 被引量:7 2011年 采用线粒体SSR(mtSSR)方法对普通烟草4种不育类型的不育系、不育胞质来源的烟草野生种和保持系进行线粒体位点差异分析,探讨mtSSR位点差异与胞质不育的关系。在烟草线粒体基因组上检索到24个能重复稳定扩增出片段的mtSSR,对烟草属植物的这些mtSSR分析结果显示,普通烟草种内mtSSR较为保守,多态性比率仅10.5%;4种不育类型的各自不育系与保持系、不育胞质上存在多个差异位点,在Nta(sua.)S类型中差异位点在线粒体编码基因orf138a、orf138c以及orf102~orf210的基因间区;在Nat(gla.)S类型中,差异位点在线粒体orf138a、orf138c两个编码基因以及nad2~sdh3、rps12~orf125b、orf116~orf101b、orf102~orf210的4个基因间区;在Nta(rep.)S类型中,差异位点在线粒体编码基因orf190以及orf104c~orf202的基因间区;在Nta(rus.)S类型中,差异位点在线粒体编码基因orf137以及rps12~orf125b的基因间区。这些位点差异可能与各自的雄性不育有关。另外,mtSSR引物TMS20在Nat(sua.)S、Nat(gla.)S、Nat(rep.)S和Nat(rus.)S类型的雄性不育系中分别扩增出了184、172、212和225bp的片段,表明可用该引物区分4种烟草CMS类型。 李凤霞 杨爱国 崔萌萌 龚达平 王卫锋 孙玉合关键词:烟草 线粒体DNA SSR 烤烟几种化学成分的QTL初步分析 被引量:24 2008年 以含137个株系的烤烟DH群体(G-28×NC2326)及其亲本为材料,在以前作图数据的基础上,新增23个标记。将这些标记数据合并起来构建了包括11个ISSR标记和158个RAPD标记、由27个连锁群组成的烤烟分子标记遗传连锁图,覆盖长度2094.6cM,相邻标记间的平均图距为15.95cM。利用4个环境下的试验数据进行了总糖、烟碱、氧化钾3种烟叶化学成分的QTL初步分析,共检测到7个加性效应QTL和9对加加上位性效应QTL,其中3个加性QTL和3对上位性QTL存在QTL与环境互作效应(QE)。表明在烤烟总糖、烟碱、氧化钾的遗传控制中除加性效应外,上位性效应也具有重要作用。对于烟碱、氧化钾检测到加性QTL与环境互作效应,对于总糖、氧化钾检测到上位性QTL与环境互作效应,利用这些与环境具有互作效应的QTL进行标记辅助选择时宜考虑特定的环境条件。 肖炳光 卢秀萍 焦芳蝉 李永平 孙玉合 郭兆奎关键词:烤烟 遗传连锁图 化学成分 QTL分析 上位性 影响烟草香气物质合成代谢途径关键酶基因的研究进展 被引量:5 2014年 文章详细叙述了与植物香气物质合成有关的3类主要合成代谢途径,并分别归纳苯丙烷代谢途径、异戊二烯代谢途径和生物碱合成途径中催化主要中间产物形成的关键酶基因功能与表达模式,重点阐述关键酶基因在烟草中的最新研究进展,提出目前除了在基因水平上进行表达水平调控、转基因作物改良之外,烟草中亟待进行更为深入的蛋白水平研究和代谢网络互作分析。通过上述分析,对下一步利用代谢工程改良烟草香气品质及其在农业生产领域的应用前景进行了展望。 吕婧 刘贯山 晁江涛 孙玉合关键词:烟草 香气 代谢途径