宁文锋
- 作品数：6 被引量：22H指数：3
- 供职机构：中南大学湘雅二医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学建筑科学更多>>
- 人STK11基因核心启动子区域初步界定
- PJ综合征(Peutz-Jeghers syndrome)是一种常染色体显性遗传疾病。其疾病基因STK11(又称为LKBl)于1998年被克隆，定位于19p13.3，包括10个外显子，其中的9个为编码区，从端粒向着丝粒方...
- 宁文锋
- 关键词：STK11基因生物信息学启动子转录起始位点转录调控
- 文献传递
- Peutz-Jeghers综合征患者中STK11基因启动子区序列多态性分析被引量：3
- 2007年
- 目的:探讨STK11基因启动子-1543～-1160区域序列变化与Peutz-Jeghers综合征(PJS)的关系。方法:采用PCR产物直接测序的方法,对15例PJS患者和42例正常个体的STK11基因启动子区进行序列分析。结果:发现STK11基因启动子区的1个新的单核苷酸多态性(SNP)位点(-1275)G/T;该位点GG,GT,TT这3种基因型在患者和正常对照者中的频率分布分别为53.3%,26.7%,20%和33.3%,64.3%,2.4%,PJS患者组GG基因型和TT基因型频率均高于正常对照组,而GT基因型低于正常对照组,差异有统计学意义(χ2=8.521,P<0.05)。结论:STK11基因(-1275)G/T是1个新的SNP,该SNP基因型与PJS发生的关系有待进一步研究。
- 易鑫姚茂金王永俊汤建光宁文锋王向平周世权李陈捷汪斐夏昆施小六
- 关键词：STK11基因启动子
- 人STK11基因启动子区域的克隆被引量：4
- 2006年
- 通过生物信息学分析,预测人STK11基因可能的转录起始位点和重要的调控区域．以此为基础,构建含人STK11基因上游序列缺失片段的pGL3重组载体,瞬时转染L-02和HeLa两种细胞系,通过检测荧光素活性分析缺失片段的启动活性．结果显示各缺失片段在两株细胞中均有启动活性;当3′端固定在-918时,5′端由-1943——1425的移位对启动活性无明显影响,提示这一区间内不存在重要的顺式作用元件;将5′端固定在—1943时,随着3′端向5′的缩短(—918→—1039→—1160),启动活性明显增强(活性pGL3-1943A>pGL3-1943B>pGL3-1943C),提示—1160——1039和—1039——918的区间分别存在负性顺式作用元件,同时提示核心启动子的3′端位于—1160的5′末端．在pGL3-1322(—1322——918)亦观察到启动活性,提示核心启动子的5′端应该位于—1322的3′末端．因此,人STK11基因的核心启动子位于—1322——1160之间．
- 宁文锋王永俊姚茂金汤建光汪斐周世权李陈捷施小六
- 关键词：STK11基因生物信息学启动子顺式作用元件转录起始位点
- COX-2和HER-2在结直肠癌中的表达及其意义被引量：13
- 2007年
- 为研究COX-2和HER-2在结直肠癌中的表达及其临床意义以及两者的相互关系,笔者采用免疫组化法检测123例结直肠腺癌及其中的25例淋巴结转移灶组织、12例远癌肠黏膜组织、15例结直肠腺瘤性息肉组织COX-2和HER-2的表达情况。结果示,COX-2在远癌组织、腺瘤性息肉、腺癌中的高表达率分别为0%,33.3%,81.3%,三者差异有统计学意义(P<0.001);腺癌中COX-2的高表达与Dukes分期、淋巴结转移和浸润层次有关;HER-2的高表达在腺癌(67.5%)与腺瘤性息肉(80.0%)之间差异无统计学意义,但均高于远癌肠黏膜(33.3%)(P<0.05);HER-2的胞膜高表达与浸润层次有关;在淋巴结转移灶中COX-2和HER-2具有相关性(χ2=3.949,P<0.05,c=0.3693)。提示COX-2在正常组织、腺瘤性息肉及腺癌中的表达逐步上调;COX-2可能是结直肠癌发生的早期事件;COX-2的高表达及HER-2胞膜的高表达均与肿瘤侵袭性增高有关。
- 汪斐莫烨周世权陈森林宁文锋姚茂金王永俊施小六
- 关键词：COX-2
- p53对STK11的转录调控研究被引量：2
- 2007年
- PJ综合征(Peutz-Jeghers syndrome)是一种常染色体显性遗传疾病.其致病基因所编码的蛋白质为一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STK11).STK11可以激活AMPK,p53等多条信号通路.文中在克隆了STK11的基本启动子区域基础上,用生物信息学分析预测该区域内可能存在p53结合位点和Sp1结合位点.EMSA结果证实了信息学分析的预测.Sp1结合位点核心碱基定点突变后,其PGL3重组突变体质粒萤光素酶活性下降1.9倍;p53结合位点核心碱基的定点突变后,PGL3重组突变体质粒萤光素酶活性下降14.6倍,均有统计学意义.利用内源表达STK11的L02细胞株,瞬时转染pcDNA3.1-myc-his-B(-)-p53,经Real-time PCR和Western blotting检测发现,p53过表达可以上调STK11的表达,因此p53对STK11的表达有正反馈调节放大作用.
- 姚茂金王永俊沈宏伟汤建光王向平周世权宁文锋汪斐施小六
- 关键词：STK11P53转录调控
- PJ综合征疾病基因STK11/LKB1转录调控的生物信息学分析
- 2005年
- 目的 初步了解STK11/LKB1的转录起始位点信息 ,分析其可能的候选启动子区段 ,为以后进行STK11/LKB1的转录调控研究作准备。方法 通过检索网上数据库资料 ,获得STK11/LKB1的转录本信息 ;运用MethPrimer和FirstEF两种程序 ,对包含STK11/LKB1基因“第一外显子”、“第一内含子”及其 5’UTR区上游的gDNA片段序列 ,分别进行CpG岛分析和第一外显子预测 ;利用PromoterInspector等预测程序 ,对STK11/LKB1的启动子进行预测。结果 目前已知的STK11/LKB1转录本中 ,5’UTR区最长的序列为BC0 0 7981(GenBank登录号 ) ;STK11/LKB1基因属于典型的CpG岛相关基因 ,现有的“第一外显子”之 5’上游已不再有外显子 ,已有的 5’UTR区基本已基本接近STK11/LKB1的转录起始位点 ;在BC0 0 7981的 5’上游约 2 0 0bp到 40 0bp内很可能存在有启动子。结论 STK11/LKB1已有的 5’UTR区基本已基本接近STK11/LKB1的转录起始位点 ,在BC0 0 7981的 5’上游数百bp内很可能能找到具有启动活性的区段从而有利于进行下一步的转录调控研究。实验明确其真实的转录起始位点应已相对容易。
- 王永俊施小六姚茂金宁文锋周世权莫烨汤建光
- 关键词：LKB1第一外显子转录调控疾病基因生物信息学分析
