李发根
- 作品数：54 被引量：150H指数：8
- 供职机构：中国林业科学研究院热带林业研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学经济管理医药卫生更多>>
- 尾叶桉和细叶桉STS标记连锁图谱构建及生长性状QTL定位研究
- 尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(E.tereticornis)是全球范围内重要的人工林用材树种。随着分子标记技术的发展，利用分子标记进行遗传图谱构建和QTL定位已成为国际林木基因组研究的热点，...
- 李发根
- 关键词：尾叶桉细叶桉STS标记生长性状QTL定位
- 文献传递
- 细叶桉(Eucalyptustereticornis)早期生长的SSR标记关联分析被引量：2
- 2016年
- 本研究基于巨桉全基因组的108个SSR标记（44个基因SSRs和64个EST-SSRs）,通过对细叶桉9个群体的78株样品的初步关联分析和242株样品的关联验证,利用一般线性模型和混合线性模型共检测到与细叶桉9月生树高（H9）、30月生树高（H30）和30月生胸径(H30)显著关联的标记分别为2个、3个和4个。除1个标记（Embra227）同时与H30和H30显著关联外,不同性状的关联标记均不相同。单个标记对表型变异的解释率为10.3%34.6%。与H9、H30和D30关联的最大增效等位片段的效应值分别为0.67 m、1.64 m和1.97 cm,最大减效等位片段的效应值分别为-0.72 m、-1.94 m和-1.87 cm。H9、H30和H30的平均增效效应最大的关联标记分别为EUCe SSR1070（0.41 m,26.8%）、EUCe SSR1136（0.73 cm,12.3%）和EUCe SSR906（1.48 cm,25.3%）,平均减效效应最大的关联标记分别为EUCe SSR1070（-0.25 m,16.3%）、Embra227（-1.06 m,17.2%）和Embra227（-1.15 cm,17.7%）。这为桉树分子育种提供了有潜力的标记资源。
- 宋志姣宋志姣翁启杰周长品李发根李梅卢万鸿卢万鸿罗建中
- 关键词：SSR标记
- 黔西南桉树无性系对比试验被引量：8
- 2009年
- 对174个桉树无性系在黔西南的生长进行研究，测定性状包括7月生树高以及20月生和34月生的树高、胸径和材积，结果表明：无性系间的差异在各生长性状上均达极显著水平；性状广义遗传力为0．21～0．46，表明早期生长受低到中等程度的遗传控制；生长性状间表型相关均达极显著水平。初选出6个优良的尾叶桉×细叶桉杂种无性系，34月生保存率和平均单株材积均不低于对照DH32—29，为当地无性系中试提供了备选材料。
- 周家维李发根李梅吴坤明吴菊英甘四明
- 关键词：桉树无性系
- 一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法
- 本发明提供了一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法，属于全基因组重测序技术领域，包括利用限制性内切酶MspI和MseI对基因组DNA进行酶切，将接头序列分别连接到酶切产物上，得到连接产物；将连接产物进行等质量混合，...
- 李发根甘四明贾翠蓉翁启杰周长品朱显亮
- 基于SSR标记的古茶树(Camellia sinensis)遗传关系分析被引量：3
- 2020年
- 本研究利用30个SSR标记,结合已有的128个茶树品种指纹,对福建省园岭林场的4株古茶树和1株铁观音进行了遗传关系分析。结果表明,30个SSR标记共产生了124个等位片段,每个标记的等位片段数1~9个;多态性信息量较高,平均为0.507。遗传聚类分析表明,铁观音品种‘Tieguanyin2’与Fujian组的‘Tieguanyin’、‘Jinmudan’、‘Mingke1’和‘Zimudan’等遗传距离较近,属于铁观音品种。4株古茶树(YL01,YL02,YL03和YL04)间遗传距离较近,属于Fujian组,推测为八仙茶古茶树品种。本研究的5株茶树与已知的128个茶树品种间没有直接的亲子关系。YL02、YL03和YL04聚类较近,不匹配位点数较少,可能来源于共同的亲本。DNA分子指纹检测表明,8对核心SSR标记可对所有参试茶树进行有效的鉴别,这为古茶树的品种鉴定和产权保护提供了有效的分子证据。
- 周长品甘四明李发根翁启杰张照远马锦林
- 关键词：SSR标记
- KingFisher Flex核酸纯化系统上树木叶片DNA的提取方法被引量：3
- 2017年
- 以桉树4种/杂种的叶片为材料,比较了5种磁珠试剂盒在King Fisher Flex核酸纯化系统上自动提取的DNA得率和纯度,初步选出了2种较好的试剂盒。比较了King Fisher Flex上不同的洗涤速度,最优为Medium。初选的2种试剂盒所提的DNA均可有效用于PCR扩增,表明DNA纯度均较好,确定得率最高的为最优试剂盒。对比手动的改良CTAB法(DNA得率19.0μg/g,OD_(260)/OD_(280)为1.97,OD_(260)/OD_(230)为2.03),本研究优化的方法可显著提高DNA得率(103.6μg/g)且DNA纯度相似(OD_(260)/OD_(280)为1.93,OD_(260)/OD_(230)为1.89)。优化的方法可有效用于马占相思、银中杨、降香黄檀、思茅松、马尾松和短枝木麻黄叶片的DNA提取。这对树木分子生物学研究的高通量DNA提取有重要的应用价值,对非木本植物的DNA提取和其他基于磁珠法的纯化系统亦可提供有益的方法参考。
- 杨合宇李发根翁启杰李梅陈升侃姬红霞周长品甘四明
- 关键词：DNA提取FLEX
- 一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法
- 本发明提供了一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法，包括以下步骤：(1)配制PCR反应体系：取1.0μL 10×buffer、dNTP 25～50μM、MgCl<Sub>2</Sub>2.0mM、前向引物0....
- 甘四明李发根翁启杰李梅周长品于晓丽
- 尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位被引量：4
- 2021年
- 【目的】生长和木材基本密度是桉树的重要经济性状,挖掘其候选功能基因可为桉树遗传改良提供参考。【方法】以尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(Eucalyptustereticornis) F1全同胞子代试验林为研究对象,测定其8年生树高、胸径和木材基本密度,开展表型遗传分析。筛选极端表型个体,利用测序分型(GBS)开发SNP标记进行关联分析。挖掘与树高、胸径和木材基本密度关联的SNP位点,并进行候选基因初步定位。【结果】尾细桉F1子代树高、胸径与木材基本密度间的表型变异系数为7.51%~26.19%,生长性状与木材基本密度显著正相关。利用GBS获得了覆盖全基因组的15 185个SNP位点,关联分析共鉴定111个与生长和木材基本密度显著关联的SNP,其中2号染色体上检测到强烈的生长性状关联信号。定位40个与生长和木材基本密度相关候选基因,共富集在52个GO terms,基因功能注释分析表明其功能主要与植物抗逆性、生物与非生物胁迫、转录因子家族等相关。【结论】本研究获得了一批与尾细桉生长和材性性状关联的SNP位点和候选基因,并进行了树高、胸径及木材基本密度候选基因初步定位,挖掘的与抗逆性相关的基因可能在树木的生长和木材形成中发挥重要作用。
- 朱显亮周长品贾翠蓉翁启杰李发根
- 关键词：测序分型表型性状候选基因
- 一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用
- 本发明提供了一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用，属于SNP标记技术领域。采用本发明提供的70个SNP标记组合极大提高对无性系检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平，可有效应用于桉树无性系鉴定，快速甄别假冒和错乱的...
- 李发根周长品甘四明翁启杰何佳悦
- 文献传递
- 林木分子生物学研究:进展及其应用
- 本文对林木分子生物学研究的进展及其在林业生产中的应用进行了综述.内容包括:(1)林木分子生物学的研究对象、主要技术和研究历史;(2)全球范围内开展的林木分子生物学项目;(3)林木分子生物学技术在林业生产中的应用;(4)我...
- 甘四明李发根白嘉雨
- 关键词：分子生物学林业生产林木
- 文献传递
