史小超
- 作品数:18 被引量:56H指数:5
- 供职机构:南京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:南京市医学科技发展项目江苏省卫生厅预防医学科研基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 一起细菌性痢疾暴发疫情的病原检测及脉冲场电泳应用研究
- 目的:分析引起一起细菌性痢疾暴发疫情的宋内氏志贺菌菌株生化特征、抗生素抗性、毒力基因携带情况,并用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型、了解遗传相关性。方法:对该起疫情中分离的6株宋内氏志贺菌用K-B法进行药敏试验;用...
- 程婷婷史小超丁洁洪镭谢国祥
- 关键词:细菌性痢疾病原检测脉冲场电泳毒力基因
- 文献传递
- 2019—2020年南京市腹泻病例中的沙门菌分子分型及耐药性被引量:8
- 2022年
- 目的 对2019-2020年南京市哨点医院腹泻患者中分离到的沙门菌进行病原学分析,了解南京市腹泻患者沙门菌的血清型、分子分型特征及耐药特点。方法 采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对81株沙门菌进行分子分型,酶切电泳图谱导入BioNumerics软件进行聚类分析,并利用微量肉汤稀释法进行耐药性检测。结果 81株沙门菌有22个血清型,主要为鼠伤寒沙门菌及肠炎沙门菌,PFGE电泳后产生的条带具有多样性;药敏结果显示,沙门菌对氨苄西林的耐药率最高,达85.1%,多重耐药率达64.2%。结论 南京市分离自腹泻病例的沙门菌耐药状况严重,耐药谱分布呈多样性,应持续开展沙门菌耐药及病原学监测。
- 余艳王璇葛藤斯佳丽史小超王燕何敏
- 关键词:沙门菌脉冲场凝胶电泳病原学药敏实验
- PCR快速检测在细菌质控考核盲样鉴定中的应用被引量:4
- 2017年
- 目的:对多重PCR和荧光PCR两种核酸检测方法在多项目质控样本中的检测应用进行初步评价。方法:同时采用三种方法对多项目盲样质控样本进行检测,包括多重PCR、荧光PCR及传统的国标方法。结果:食源性致病菌盲样(W-B11)中采用多重PCR、荧光PCR均检出金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌核酸阳性,培养法同步分离并鉴定为金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌,三种方法检测结果一致。结论:PCR法结合培养法对于多项目质控样本中病原菌快速初筛分离具有重要意义,可减少传统培养法漏检的可能性,提高检测效率。
- 王炜江晓金萍叶艳华史小超张洪英谢国祥丁洁
- 关键词:聚合酶链反应
- 南京市腹泻患者副溶血弧菌毒力基因及其耐药性分析
- 2023年
- 目的分析南京市哨点医院急性腹泻患者副溶血弧菌携带的毒力基因及抗生素耐药性。方法收集2018—2021年哨点医院腹泻患者的肛拭子标本1805份,分离鉴定出74株副溶血弧菌,用PCR方法检测其毒力基因tlh、tdh、trh,并用微量肉汤法检测分离菌株的抗生素耐药性。用IBM SPSS 20软件进行统计分析,差异比较采用χ^(2)检验。结果74株副溶血弧菌tlh基因均为阳性,其中5.41%的菌株tdh(+)trh(+),86.49%的菌株tdh(+)trh(-),8.11%的菌株tdh(-)trh(-),三者差异有统计学意义(χ^(2)=141.243,P<0.001)。抗生素药敏试验结果显示100.00%的副溶血弧菌菌株对头孢唑啉耐药,21.62%的菌株对氨苄西林耐药,菌株普遍对三代头孢类抗生素(头孢噻肟、头孢他啶)及磺胺类、氨基糖苷类、四环素类等常用抗生素敏感,敏感率达90.00%以上。对硫霉素类抗生素(亚胺培南)的敏感率为100.00%。结论南京市腹泻患者粪便来源的副溶血弧菌毒力基因的携带率高,对常用抗生素较敏感,对一代头孢类抗生素(头孢唑啉)耐药严重。
- 张韶华江晓叶艳华史小超金萍雍玮王燕龚红瑾王炜程婷婷
- 关键词:副溶血弧菌腹泻毒力基因耐药性
- 急性胃肠炎暴发中GI.5[P4]型诺如病毒的遗传进化分析被引量:2
- 2021年
- 近年来,南京市急性胃肠炎暴发呈上升趋势,主要是由GII型诺如病毒(norovirus,NoV)引起,GI型较为少见。本研究通过对南京市输入性病例和本地性暴发急性胃肠炎疫情中GI.5[P4]型NoV进行遗传进化分析,为本地疫情控制和处置提供科学依据。对两起暴发疫情采集的18份样本进行荧光定量RT⁃PCR检测,并对NoV阳性样本部分聚合酶区和衣壳蛋白区进行一步法RT⁃PCR扩增、测序,结合参考株进行序列比对和进化树分析。18份样本中,GI型NoV阳性5份,其中4份扩增出条带,其N/S区域序列与2016⁃2018年已公布的GI.5[P4]同源性高达99.0%以上。其部分聚合酶区同1987年之后检出的GI.P4进化距离较近,变异不大。部分衣壳蛋白区在2003⁃2013年发生较为明显的进化,形成新的簇,期间在2008年又继续进化,慢慢趋于稳定。这是南京市首次在输入性病例和本地暴发疫情中均检出同源性极高的GI.5[P4],该NoV虽然在聚合酶区和衣壳蛋白区并没有发生较大进化,但是通过重组已在亚洲地区人群特别是中国多个城市导致了急性胃肠炎流行。因此,该型病毒株将是本市今后监测的重点。
- 王璇江晓史小超程婷婷张韶华丁洁
- 关键词:诺如病毒急性胃肠炎暴发基因型别
- 传统细菌培养法与荧光PCR法分离公共场所嗜肺军团菌结果比较被引量:8
- 2014年
- 目的:对公共场所环境样本(水、土壤、气溶胶)进行嗜肺军团菌监测,掌握南京市公共场所中军团菌的污染情况和菌型分布。方法:对12家商场、医院中央空调系统采集水样(冷却水、景观水、淋浴水、自来水),土壤类样品(背景土、花卉土、风管积尘、景观土),采用传统细菌培养法及荧光PCR法进行嗜肺军团菌的分离鉴定。结果:12家单位共采样234份(水样88份、土壤146份),传统细菌培养法检出嗜肺军团菌9份(主要类型为Lp1型),检出率为3.85%;而实时荧光PCR法检出47份阳性(主要类型为Lp1型),检出率为20.08%。两者检出阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:南京市公共场所存在嗜肺军团菌污染,荧光PCR法总检出率明显高于传统细菌培养法,荧光PCR方法较培养法灵敏性较好。
- 金萍江晓叶艳华何敏史小超
- 关键词:嗜肺军团菌荧光PCR法公共场所
- 全省疾病预防控制系统传染病防治技能竞赛盲样检测考核结果分析
- 目的:通过采用实时荧光PCR法和培养法对竞赛盲样样品中食源性致病菌的分离鉴定,建立了针对多项目质控样品检测的快速准确方法.
方法:2014年江苏省疾病预防控制中心组织的传染病防治技能竞赛中给出的盲样考核样品,依...
- 江晓程婷婷叶艳华史小超金萍王炜丁洁
- 关键词:传染病食源性致病菌
- 一起细菌性痢疾暴发疫情的病原检测及分子分型被引量:2
- 2012年
- 目的:分析引起一起细菌性痢疾暴发疫情的宋内氏志贺菌菌株生化特征、抗生素抗性、毒力基因携带情况,并用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型、了解遗传相关性。方法:对该起疫情中分离的6株宋内氏志贺菌用K-B法进行药敏试验;用PCR方法检测其四种毒力基因携带情况;用XbaI酶切进行PFGE分子分型,结果用BioNumerics软件UPGMA方法进行聚类分析,观察菌株是否为同源株。结果:6株分离株对诺氟沙星、头孢噻肟、头孢噻吩、阿莫西林均敏感,对氨苄西林、庆大霉素、萘啶酸均耐药;6株菌均携带ipaH基因、均不携带set1基因,其中5株携带ial基因,其中3株携带sen基因;经XbaI酶切后产生同种带型,带型之间的相似性系数≥97.6%。结论:宋内氏志贺菌是引发此次疫情的病原,多重耐药,含毒力基因。菌株间遗传关系紧密,来自同一克隆群。
- 程婷婷史小超丁洁洪镭谢国祥
- 关键词:宋内氏志贺菌PFGE毒力基因
- 2019年南京市儿童猩红热病原学及分子分型特征研究被引量:1
- 2022年
- 目的对2019年南京市儿童猩红热病例进行病原学检测,了解病原学诊断特征及化脓性链球菌的emm分型特点,为临床诊断提供依据。方法收集2019年南京市2所医院(南京江北人民医院和东南大学附属中大医院)的儿童猩红热临床诊断病例77份咽拭子,细菌管及病毒管各1份。细菌管利用传统的平板划线分离方法检测,利用质谱仪对分离的所有菌株进行鉴定,对每株化脓性链球菌进行PCR扩增emm基因;病毒管用荧光定量PCR仪进行肠道病毒检测。结果77份咽拭子共分离出60株链球菌,其中化脓性链球菌15株。15株化脓性链球菌中,共鉴定出2种基因型,其中emm1型10株,占66.7%(10/15);emm12型5株,占33.3%(5/15)。缓症链球菌分离出23株,占38.3%(23/60);口腔链球菌分离出17株,占28.3%(17/60),血链球菌及副血链球菌分离出5株,占11.6%(5/60)。77例临床诊断为猩红热咽拭子病毒管中,鉴定出5份样品为肠道病毒通用型阳性,检出率为6.5%(5/77),其中4份为肠道病毒71型(EV71),1份为柯萨奇病毒A16型(CA16);5份样品中均未检测到链球菌。结论南京市2家哨点医院的样本分离到的化脓性链球菌emm基因型较为集中,主要以emm1和emm12为主。
- 余艳史小超王璇斯佳丽杜雪飞
- 关键词:化脓性链球菌猩红热分子分型
- 一起由金黄色葡萄球菌混合感染引起食物中毒的检测与分析被引量:1
- 2022年
- 目的利用多种手段对一起疑似金黄色葡萄球菌食物中毒事件进行病原学检测,为疫情控制和临床治疗提供更详实的科学依据。方法对一起食物中毒的生物样本进行分离,对分离到的菌株采用飞行质谱仪和血浆凝固酶实验进行鉴定,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)和PCR方法进行肠毒素型别和肠毒素基因检测。对分离到的菌株进行药敏检测,并采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)法对菌株进行分子分型,分析菌株之间的相关性。结果本次食物中毒共采集12份标本,分离到12株菌株,经鉴定均为金黄色葡萄球菌。肠毒素基因检测结果显示,12株均携带SEE基因,其中4株同时携带SEA基因,该4株菌均检出A+E型肠毒素。药敏结果显示,该12株菌均对青霉素耐药。PFGE显示该12株菌分为2个带型,每个带型的同源性均为100%。结论结合流行病学调查可初步判定此次食物中毒为2株不同的金黄色葡萄球菌菌株引发的混合感染。
- 余艳赵上瑛杜雪飞乔梦凯史小超王璇斯佳丽
- 关键词:金黄色葡萄球菌食物中毒肠毒素脉冲场凝胶电泳