胡燕燕 作品数:40 被引量:175 H指数:8 供职机构: 浙江大学医学院附属第二医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 浙江省自然科学基金 浙江省医药卫生科学研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 经济管理 社会学 更多>>
嗜麦芽窄食单胞菌新型突变喹诺酮耐药基因Smqnr及其分布 被引量:1 2011年 目的描述新型突变喹诺酮耐药基因Smqnr及其在嗜麦芽窄食单胞菌的分布,初步探讨Smqnr基因与喹诺酮抗生素耐药之间的关系。方法嗜麦芽窄食单胞菌的鉴定采用VITEK全自动细菌鉴定和药敏系统,采用标准琼脂稀释法测定替加环素、氯霉素、头孢他啶、复方磺胺甲嚼唑、替卡西彬克拉维酸、左氧氟沙星、莫西沙星7种抗生素对442株嗜麦芽窄食单胞菌的最低抑菌浓度(MIC)。聚合酶链反应(PCR)扩增全长Smqnr基因,测序后采用DNAMAN软件比对序列之间的差异,并构建系谱树分析不同Srnqnr基因之间亲缘性关系。结果嗜麦芽窄食单胞菌对7种抗菌药物有不同程度的耐药,且在5%~50%之间变动,左氧氟沙星的抗菌活性较好,耐药率仅为6.11%(27/442),抗菌活性最好的药物为莫西沙星,耐药率为5.88%(25/442),442株嗜麦芽窄食单胞菌中114株检测到Smqnr基因,检出率为25.79%(114/442),包括11种已发现的Srnqnr和20种新型突变的Smqnr基因(Smqnr28~47),新型突变的Smqnr基因是由于部分碱基发生突变导致相应的219位翻译氨基酸位点发生改变。耐药株Smqnr基因检出率为42.30%(11/26),中介株Smqnr基因检出率为34.37%(11/32),敏感株检出率23.95%(92/384),敏感株中MIC为0.125μg/ml的嗜麦芽窄食单胞菌Srnqnr基因检出率最高,为37.78%。结论Smqnr基因编码区高度多态,新型突变的Smqnr基因是由于部分碱基发生突变导致相应的219位翻译氨基酸位点发生改变所致。Smqnr基因在嗜麦芽窄食假单胞菌中的检出率较高,分布也存在较大差异。 孙谦 张嵘 喻华 李轶 胡云健 沈强 李国雄 曹俊敏 杨伟 王琴 周宏伟 胡燕燕关键词:嗜麦芽窄食单胞菌 喹诺酮类 突变 产KPC-2型碳青霉烯酶奇异变形杆菌分子流行病学研究 被引量:5 2012年 目的探讨重症监护病房(ICU)出现的对碳青霉烯类敏感性降低的奇异变形杆菌的分子流行病学及耐药机制。方法收集2010年8—10月,从浙江大学医学院附属第二医院2个ICU病房分离到对碳青霉烯类耐药或敏感性降低的19株奇异变形杆菌。通过脉冲场凝胶电泳分析菌株之间的同源性。采用药物敏感性试验、接合试验、质粒图谱分析、特异性聚合酶链反应(PCR)扩增和序列分析等技术研究细菌对碳青霉烯类耐药的分子机制。结果19株奇异变形杆菌均对碳青霉烯类耐药或敏感性降低,对头孢菌素类耐药或敏感。19株奇异变形杆菌共分为3个克隆株,克隆A14株,克隆B4株(2株亚克隆B1,2株亚克隆B2),克隆C1株。14株克隆A的酶切条带完全相同,克隆B的2个亚克隆之间仅相差1条条带。接合试验使受体菌大肠埃希菌对碳青霉烯类和头孢菌素类抗生素敏感性明显降低。克隆A和亚克隆B2的菌株含相对分子质量约45000bp的质粒,而亚克隆B1的接合子Jzr69则含相对分子质量约54000bp的质粒,克隆C菌株接合失败。特异性PCR扩增、序列分析及质粒DNA电泳图谱证实该19株奇异变形杆菌均产KPC-2型碳青霉烯酶。结论产KPC-2型碳青霉烯酶奇异变形杆菌在医院ICU病房流行,存在克隆传播现象。 张嵘 胡燕燕 孙谦 蔡加昌 周宏伟 陈功祥关键词:变形杆菌 疾病暴发流行 Β内酰胺酶类 HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌的应用研究 被引量:7 2011年 目的采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌,评价其优缺点。方法收集浙江、安徽等地74株临床非结核分枝杆菌,采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌,并用16SrRNA基因测序方法对其进行比较和评价。结果74株非结核分枝杆菌HAIN基因分型试剂盒鉴定结果为:31株胞内分枝杆菌,12株脓肿分枝杆菌,8株偶发分枝杆菌,6株堪萨斯分枝杆菌,5株鸟分枝杆菌,3株耻垢分枝杆菌,2株草分枝杆菌,2株瘰疬分枝杆菌,1株戈登分枝杆菌,另外有4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属,不能鉴定到种。8株结核分枝杆菌鉴定准确。与16S rRNA基因测序相比较,HAIN基因分型试剂盒除了4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属以外,其余70株非结核分枝杆菌均能鉴定到种,鉴定符合率为94.59%;并且它能进一步区分脓肿分枝杆菌和龟分枝杆菌,以及堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌。如果单纯鉴定HAIN基因分型试剂盒菌株范围之内的临床最常见非结核分枝杆菌菌株,鉴定符合率为100%。结论HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌时间短、操作简单、结果准确,可在临床推广使用。 张嵘 方玉才 孙谦 张艳 柯文鸿 柳正卫 周宏伟 胡燕燕 陈功祥关键词:非结核分枝杆菌 多重耐药鲍曼不动杆菌对替加环素耐药状况分析 被引量:30 2011年 目的 了解多重耐药鲍曼不动杆菌对临床常用抗生素及新药替加环素的耐药状况.方法 收集2008-2009年浙江省4所教学医院的602株临床分离鲍曼不动杆菌,采用琼脂稀释法检测其对13种临床常用抗生素的敏感性,以及对多黏菌素B和替加环素的敏感性.同时,采用PFGE技术对24株多重耐药鲍曼不动杆菌进行同源性分析,以确定菌株间的亲缘关系.结果 浙江省4家教学医院2008-2009年分离的鲍曼不动杆菌主要来自于呼吸道标本,2009年达到277株(86.0%),血液标本数量从2008年的15株(5.4%)下降到2009年的5株(1.5%),而其他标本无明显变化.鲍曼不动杆菌对临床常用的13种抗生素均有不同程度的耐药,耐药率35.0%~85.0%.与2008年相比,除左氧氟沙星和妥布霉素耐药率分别下降0.9%和9.0%以外,2009年其余抗生素耐药率均有不同程度地上升,头孢曲松和头孢吡肟耐药率增加了近10.0%,对碳青霉烯类抗生素亚胺培南和美罗培南的耐药率分别达到74.2%(239/602)和70.8%(228/602).鲍曼不动杆菌对替加环素显示了很高的耐药率,耐药率达到78.9%(475/602),而多黏菌素B耐药率仅为3.7%(22/602).PFGE分型显示2008-2009年24株鲍曼不动杆菌有6个克隆型,其中A型最常见,占50%.结论 鲍曼不动杆菌对替加环素的耐药加大了院内感染控制的难度,临床应加强控制,防止多重耐药菌的传播. 孙谦 周宏伟 胡燕燕 陈功祥关键词:鲍氏不动杆菌 米诺环素 国产MALDI-TOF MS系统Smart MS 5020对临床微生物的鉴定性能评估 被引量:1 2022年 目的评估珠海迪尔Smart MS 5020型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及其2630种数据库(以下简称Smart MS 5020系统)对临床微生物的鉴定能力。方法共纳入2016—2020年浙江大学医学院附属第二医院留存的临床分离菌株913株,覆盖18个属52个种或复合群。采用直接涂抹法进行鉴定,比对仪器为德国布鲁克Biotyper MS系统及其DB2969数据库(以下简称Biotyper MS),对于两台质谱仪不一致的鉴定结果,采用16S rRNA扩增测序作为判定的金标准。针对复合群(鲍曼不动杆菌复合群、阴沟肠杆菌复合群以及肺炎克雷伯菌复合群),采用二代测序的鉴定结果作为金标准,统计学方法采用卡方检验。选取13株室内质控菌株作为重复性评估的检测样本,每株菌在Smart MS 5020系统上平行检测3次,判断其鉴定结果的一致性。结果对913株临床菌株,Biotyper MS系统种水平鉴定准确率为100%(913/913,95%CI:99.48%~99.58%),Smart MS 5020系统种水平鉴定准确率为99.78%(911/913,95%CI:99.12%~99.20%),2株表皮葡萄球菌鉴定为柯氏葡萄球菌;在临床微生物的鉴定能力方面,2种方法差异无统计学意义(P>0.05)。重复性评估结果显示,Smart MS 5020系统对13株室内质控菌株的鉴定结果完全一致。结论Smart MS 5020系统对临床常见微生物有很好的鉴定能力,包括复合群的鉴定能准确鉴定到复合群,对一些难区分菌如嗜血杆菌、链球菌等均能准确鉴定,但对复合群内具体种的细分能力有限,需要结合分子生物学、血清学或其他补充实验来准确鉴定。 金丽 黄永禄 李佳萍 蒋陈晨 周宏伟 张嵘 胡燕燕关键词:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 细菌 酵母菌 比较MALDI-TOF MS直接涂片法与蛋白提取法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的应用研究 被引量:5 2015年 目的比较基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)直接涂片法和蛋白提取法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的差异。方法收集118株临床分离经VITEK全自动细菌仪鉴定为洋葱伯克霍尔德菌群菌株,采用MALDI-TOF MS直接涂片法和蛋白提取法进一步分析基因型,同时比较两种鉴定方法之间的优缺点。结果 118株洋葱伯克霍尔德菌群经MALDI-TOF MS两种方法只是鉴定结果分数有所差异,鉴定结果一致,分别为:93株Burkhoderia cencepacia(基因型Ⅲ型),11株多嗜伯克霍尔德菌(基因型Ⅱ型),10株洋葱伯克霍尔德菌(基因型I型),3株越南伯克霍尔德菌(基因型V型),1株吡咯伯克霍尔德菌(基因型Ⅸ型)。MALDI-TOF MS直接涂片法鉴定分数均值2.126,仅9株(7.62%)鉴定结果不可信(分值<1.700),准确鉴定至种(t≥2.300)与准确鉴定至属(t≥1.700)的比例分别为38.98%和92.38%;MALDI-TOF MS蛋白提取法仅2株(1.69%)鉴定结果不可信,准确鉴定至种(t≥2.300)与准确鉴定至属(t≥1.700)的百分比均高于直接涂片法,分别为44.92%和98.31%;但是不同分值分组间准确鉴定至种(分值≥2.300)、鉴定至属(分值≥1.700),两种方法差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 MALDI-TOF MS可快速准确地鉴定洋葱伯克霍尔德菌群至基因型,临床标本鉴定时首选MALDI-TOF MS直接涂片法,对于鉴定结果不可信的菌株可进一步采用蛋白提取法鉴定。 孙谦 屈青云 胡燕燕 周宏伟关键词:直接涂片法 耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌对利奈唑胺的耐药机制及分子流行病学研究 被引量:8 2012年 目的研究耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRCoNS)临床分离株对利奈唑胺的耐药机制及分子流行病学。方法2011年3—8月我院分离到17株对利奈唑胺耐药的MRCoNS,包括10株头状葡萄球菌、4株科氏葡萄球菌、2株溶血葡萄球菌和l株松鼠葡萄球菌。用E-test法测定抗生素对细菌的最低抑菌浓度(MIC);脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株之间的同源性;PCR扩增和序列分析研究细菌对利奈唑胺耐药的分子机制。结果9株利奈唑胺MIC值为〉256斗g/ml的头状葡萄球菌为同一克隆株,MIC值为4μg/ml的另1株头状葡萄球菌为密切相关菌株。4株利奈唑胺MIC值为〉256μg/ml的科氏葡萄球菌为同一克隆株。松鼠葡萄球菌利奈唑胺MIC值为64μg/ml,2株溶血葡萄球菌分别为4μg/ml和6μg/ml。对23SrRNA基因第5功能区和驴基因进行PCR扩增和测序发现,9株利奈唑胺MIC值为〉256μg/ml的头状葡萄球菌的23SrRNA基因第5功能区存在常见G2576T突变和一个未报道过的C2104T突变;松鼠葡萄球菌存在G2576T突变;除松鼠葡萄球菌外,其余16株菌株均携带驴基因。结论首次报道在国内分离到利奈唑胺耐药的葡萄球菌临床菌株。MRCoNS对利奈唑胺耐药与23SrRNA基因第5功能区碱基突变和携带驴基因相关。利奈唑胺耐药MRCoNS在我院有克隆传播现象。 蔡加昌 周宏伟 胡燕燕 张嵘 陈功祥关键词:葡萄球菌 利奈唑胺 RRNA 基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱仪检测KPC型碳青霉烯酶的研究 被引量:10 2012年 目的用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱仪(matrix—assisted laser desorption/ion-ization time—of-flight mass spectrometry,MALDI—TOFMS)比较产KPC型碳青霉烯酶肠杆菌科细菌在不同药物浓度下水解厄他培南的能力。方法收集浙江大学医学院附属第二医院临床分离的19株单产KPC肠杆菌科细菌,包括10株奇异变形杆菌,3株产气肠杆菌,2株黏质沙雷菌,2株弗劳地柠檬酸杆菌,1株肺炎克雷伯菌,1株阴沟肠杆菌;杭州市中医院分离的7株产KPC摩根摩根菌,以及上述7株摩根摩根菌和部分奇异变形杆菌(4株)的大肠埃希菌转移接合子。用MALDI.TOFMS检测产KPC肠杆菌科细菌水解厄他培南的能力。结果当厄他培南浓度为0.1g/L时,37株单产KPC型碳青霉烯酶的肠杆菌科细菌在1.5h内全部水解厄他培南,质谱图显示厄他培南所呈现的3个峰全部消失,灵敏度高达100%;当厄他培南浓度为0.3g/L时,1.5h组水解厄他培南的灵敏度为70.3%(26/37),2.5h组为89.2%(33/37),3.5h组为94.6%(35/37);当厄他培南浓度为0.5g/L时,1.5h组水解厄他培南的灵敏度为48.6%(18/37),2.5h组为83.8%(31/37),3.5h组为94.6%(35/37)。两独立样本非参数检验统计显示:厄他培南0.1g/L组与0.3g/L、0.5g/L组之间的水解时间差异有统计学意义,而0.3g/L与0.5g/L组之间的水解时间差异无统计学意义;细菌组内数据统计显示,除奇异变形杆菌组与大肠埃希菌组之间差异有统计学意义外,其他各细菌组之间差异没有统计学意义。结论MALDI—TOFMS操作简便,可快速检测产KPC型碳青霉烯酶的肠杆菌科细菌,敏感率高,假阳性率低,适合微生物检验中用于产KPC型碳青霉烯酶的检测,推荐使用0.1g/L的厄他培南作为水解底物来检测产KPC型肠杆菌科细菌。 胡燕燕 孙谦 蔡加昌 周宏伟 陈功祥 张嵘关键词:厄他培南 MALDI-TOF MS 肠杆菌科细菌 KPC 傅里叶红外光谱技术对金黄色葡萄球菌分型能力的评估 2022年 目的评估傅里叶红外光谱技术(FTIR)对金黄色葡萄球菌快速分型的能力。方法收集21株金黄色葡萄球菌,使用FTIR检测这些菌株在900/cm~1200/cm区域的红外吸收光谱,对菌株的同源性进行分析。同时对菌株进行全基因组测序(WGS),分析各菌株的多位点序列分型(MLST)、spa分型以及核心基因组的单核苷酸多态性(SNP)分型。并以WGS的SNP分型结果作为金标准,评估FTIR与其他分型方法对金黄色葡萄球菌的分型能力差异;同时对2种培养基(血平板和MH平板)的FTIR结果进行评估。结果分离自血平板的金黄色葡萄球菌的FTIR结果与WGS分型方法的一致性最好。FTIR的分辨率与WGS方法相当,高于MLST和spa分型方法。结论FTIR对金黄色葡萄球菌的区分能力具有较高准确性,且操作简便快速,大大缩短了分型结果的周转时间,同时成本低廉,具有良好的临床推广前景。 郑淑芳 韩璧桦 孙城涛 陈家炜 张嵘 胡燕燕关键词:傅里叶红外光谱 金黄色葡萄球菌 含氯消毒剂在烧伤与创面修复科物表定植碳青霉烯耐药肠杆菌目的时空效应分析 被引量:1 2023年 碳青霉烯类抗生素耐药的肠杆菌目细菌(carbapenemresistant enterobacteriales,CRE)是急需研发新抗生素的重要病原菌[1],CRE的传播具有速度快、范围广等特点,给临床治疗和感染防控带来了严峻挑战。为了尽可能切断CRE菌株从环境到患者的传播路径,对患者周围环境中CRE菌株的监测和及时消毒显得尤为重要。 金丁萍 胡燕燕 韩春茂 夏一兰 杨晓煊 王朦朦 陆群关键词:碳青霉烯类抗生素 含氯消毒剂 创面修复 肠杆菌