孙谦 作品数:15 被引量:121 H指数:7 供职机构: 中南大学湘雅医院 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
血脂异常人群ApoE和SLCO1B1基因多态性及相关性研究 被引量:25 2017年 目的分析湘雅医院血脂异常人群中ApoE和(SLCO1B1)基因型频率分布特征,探究ApoE和SLCO1B1基因型与各项血脂指标的相关性,为防治动脉粥样硬化性疾病提供依据。方法收集湘雅医院2016年6月~2017年4月共87例血脂异常人群三酰甘油(triglyceride,TG)、总胆固醇(total cholesterol,TC)、低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)数据,采用PCR荧光探针法检测87例血脂异常人群的ApoE和SLCO1B1基因型,分析基因频率分布特征并比较各基因型间各项血脂指标的差异。结果87例血脂异常人群ApoE各基因型频率为:E2/E2型1.15%,E2/E3型13.79%,E2/E4型1.15%,E3/E3型56.32%,E3/E4型26.44%和E4/E4型1.15%,各等位基因频率分布以E3占比最高,为76.44%,E2与E4分别为8.62%和14.94%。E4表型组TC和LDL-C浓度大于E2,E3组,3组表型TG,TC,LDL-C,HDL-C浓度水平差异无统计学意义。SLCO1B1各基因型频率为:*1a/*1a型6.90%,*1a/*1b型36.78%,*1a/*15型13.79%,*1b/*1b型26.44%和*1b/*15型16.09%,各单体型频率分布以*1b占比最高,为52.87%,*1a与*15分别为32.18%和14.94%,未检测到*5型。SLCO1B1各组TG,TC,LDL-C和HDL-C浓度水平差异无统计学意义。结论 ApoE基因型频率分布不均,其多态性与血脂水平可能存在相关性;SLCO1B1基因频率分布存在种族差异性,其多态性与血脂水平不相关。临床医师可以根据ApoE和SLCO1B1基因型合理选择用药剂量,以防治冠状动脉粥样硬化性疾病。 孙谦 周辉 郭丽娜关键词:APOE基因 血脂异常 多态性 分枝杆菌快速鉴定方法学比较及其耐药研究 孙谦 刘文恩 张嵘 张艳 柯文鸿 柳正卫关键词:耐药 胶体金免疫层析法 文献传递 湘雅医院临床分离鲍曼不动杆菌耐药变迁及临床分布特征 被引量:6 2017年 目的回顾性分析中南大学湘雅医院2015年分离的鲍曼不动杆菌的临床分布特点及耐药情况,并分析其对常用抗生素的十年耐药变迁,为指导临床合理选用抗生素及控制感染提供理论指导。方法收集2015年湘雅医院临床分离鲍曼不动杆菌534株,按标本种类、科室、年龄分布及药敏结果分析鲍曼不动杆菌的临床分布特点及耐药性;同时与2006年和2011年湘雅医院鲍曼不动杆菌耐药情况进行比较。结果呼吸道标本中鲍曼不动杆菌分离率为76.78%,61岁以上感染患者分离率为37.83%,重症监护室、呼吸内科、神经内科及神经外科四个科室合计分离率为57.87%。2015年10种抗生素中对鲍曼不动杆菌抗菌活性最好的是头胞哌酮/舒巴坦,耐药率为3.02%;其余9种抗生素均有不同程度的耐药,耐药率50%~85%。十年间上升幅度最大的是妥布霉素和亚胺培南,2006年耐药率分别为1.87%和11.70%,2015年分别上升至69.85%和80.53%,左氧氟沙星和头孢吡肟十年间耐药率也增长较快,升高幅度分别为58.81%和55.98%。结论2015年湘雅医院临床分离鲍曼不动杆菌主要来源于呼吸道标本,主要分布在ICU,感染人群主要是老年患者。近10年来鲍曼不动杆菌对常用抗生素耐药率显著升高,尤其是头孢类和碳青霉烯类抗生素。随着泛耐药及多重耐药菌株逐渐增多,应加强对鲍曼不动杆菌耐药性监测及合理选用抗菌药物。 孙谦 刘培 屈青云关键词:鲍曼不动杆菌 耐药变迁 抗菌药物 用MALDI-TOF MS技术快速鉴定临床分离棒状杆菌属细菌 被引量:10 2012年 目的评价基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴定临床分离的非白喉棒状杆菌的价值。方法收集本院58株非白喉棒状杆菌,用MALDI-TOF MS和16S rRNA基因测序两种方法进行鉴定和比较。用MALDI-Biotyper软件构建不同棒状杆菌MALDI-TOF MS蛋白系统发育树。结果 58株非白喉棒状杆菌中,54株MALDI-TOF MS与16S rRNA基因测序鉴定结果一致,包括34株纹带棒状杆菌(Corynebacterium straitum)、11株杰氏棒状杆菌(C.jeikeium)、3株C.resistens、2株解葡萄糖苷棒状杆菌(C.glucuronolyticum)、2株黏金色棒状杆菌(C.aurimucosum)和2株无枝菌酸棒状杆菌(C.amycolatum)。4株16S rRNA基因测序无法鉴定到种的菌株中,MALDI-TOF MS鉴定为2株产黏棒状杆菌(C.mucifaciens)、1株C.singulare和1株假白喉棒状杆菌(C.commune)。结论 MALDI-TOF MS可将棒状杆菌属细菌快速、准确地鉴定到种。 徐志江 周宏伟 孙谦 胡燕燕 陈功祥 张嵘关键词:棒状杆菌属 质谱 RRNA 四种碳青霉烯类抗生素筛选金属酶方法的比较 被引量:7 2011年 目的 以EDTA为金属酶抑制剂,比较4种碳青霉烯类抗生素对金属酶筛选的效果.方法 从浙江大学附属第二医院收集产金属β内酰胺酶革兰阴性杆菌30株(16株肠杆菌科细菌和14株非发酵菌)、产KPC肠杆菌科9株和产OXA鲍曼不动杆菌10株,用双纸片金属酶筛查试验分析IPM、MEM、PAN和ETP在加入EDTA前后抑菌环直径的变化.结果 当以抑菌环直径差值≥5 mm为假定判读标准时,PAN组的敏感度相对较高[66.7% (20/30)],其次为MEM组[63.3% (19/30)]和IPM组[60.0% (18/30)],ETP组最差[43.3% (13/30)];当以抑菌环直径差值≥4 mm为假定判读标准时,MEM组和PAN组的敏感度达到80.0% (24/30).以抑菌环直径差值≥3 mm为假定判读标准时,IPM组和MEM组的敏感度达到90.0% (27/30),而PAN组和ETP组的敏感度为83.3% (25/30);在这3类假定判读标准下,4种抗生素的特异度均达到100%.用金属酶筛查试验筛选16株产金属酶的肠杆菌科细菌,当以5 mm为假定判读标准时,PAN组的敏感度最高[75.0% (12/16)];以4mm为假定判读标准时,PAN组的敏感度高达93.8% (15/16),远高于IPM组[75.0% (12/16)]、MEM组[68.8% (11/16)]和ETP组[68.8% (11/16)].结论 以EDTA为抑制剂的金属酶筛查试验,操作简便快捷,特异性高.不推荐使用ETP来筛查金属酶,对于革兰阴性杆菌的金属酶筛选可选择以≥4 mm为判读标准的MEM或PAN纸片;对于肠杆菌科细菌的金属酶筛选试验可选择以≥4 mm为判读标准的PAN纸片;而对于非发酵菌的金属酶筛查试验,不推荐使用PAN. 胡燕燕 周宏伟 孙谦 蔡加昌 陈功祥 张嵘关键词:细菌蛋白质类 Β内酰胺酶类 依地酸 微生物敏感性试验 嗜麦芽窄食单胞菌新型突变喹诺酮耐药基因Smqnr及其分布 被引量:1 2011年 目的描述新型突变喹诺酮耐药基因Smqnr及其在嗜麦芽窄食单胞菌的分布,初步探讨Smqnr基因与喹诺酮抗生素耐药之间的关系。方法嗜麦芽窄食单胞菌的鉴定采用VITEK全自动细菌鉴定和药敏系统,采用标准琼脂稀释法测定替加环素、氯霉素、头孢他啶、复方磺胺甲嚼唑、替卡西彬克拉维酸、左氧氟沙星、莫西沙星7种抗生素对442株嗜麦芽窄食单胞菌的最低抑菌浓度(MIC)。聚合酶链反应(PCR)扩增全长Smqnr基因,测序后采用DNAMAN软件比对序列之间的差异,并构建系谱树分析不同Srnqnr基因之间亲缘性关系。结果嗜麦芽窄食单胞菌对7种抗菌药物有不同程度的耐药,且在5%~50%之间变动,左氧氟沙星的抗菌活性较好,耐药率仅为6.11%(27/442),抗菌活性最好的药物为莫西沙星,耐药率为5.88%(25/442),442株嗜麦芽窄食单胞菌中114株检测到Smqnr基因,检出率为25.79%(114/442),包括11种已发现的Srnqnr和20种新型突变的Smqnr基因(Smqnr28~47),新型突变的Smqnr基因是由于部分碱基发生突变导致相应的219位翻译氨基酸位点发生改变。耐药株Smqnr基因检出率为42.30%(11/26),中介株Smqnr基因检出率为34.37%(11/32),敏感株检出率23.95%(92/384),敏感株中MIC为0.125μg/ml的嗜麦芽窄食单胞菌Srnqnr基因检出率最高,为37.78%。结论Smqnr基因编码区高度多态,新型突变的Smqnr基因是由于部分碱基发生突变导致相应的219位翻译氨基酸位点发生改变所致。Smqnr基因在嗜麦芽窄食假单胞菌中的检出率较高,分布也存在较大差异。 孙谦 张嵘 喻华 李轶 胡云健 沈强 李国雄 曹俊敏 杨伟 王琴 周宏伟 胡燕燕关键词:嗜麦芽窄食单胞菌 喹诺酮类 突变 产KPC-2型碳青霉烯酶奇异变形杆菌分子流行病学研究 被引量:5 2012年 目的探讨重症监护病房(ICU)出现的对碳青霉烯类敏感性降低的奇异变形杆菌的分子流行病学及耐药机制。方法收集2010年8—10月,从浙江大学医学院附属第二医院2个ICU病房分离到对碳青霉烯类耐药或敏感性降低的19株奇异变形杆菌。通过脉冲场凝胶电泳分析菌株之间的同源性。采用药物敏感性试验、接合试验、质粒图谱分析、特异性聚合酶链反应(PCR)扩增和序列分析等技术研究细菌对碳青霉烯类耐药的分子机制。结果19株奇异变形杆菌均对碳青霉烯类耐药或敏感性降低,对头孢菌素类耐药或敏感。19株奇异变形杆菌共分为3个克隆株,克隆A14株,克隆B4株(2株亚克隆B1,2株亚克隆B2),克隆C1株。14株克隆A的酶切条带完全相同,克隆B的2个亚克隆之间仅相差1条条带。接合试验使受体菌大肠埃希菌对碳青霉烯类和头孢菌素类抗生素敏感性明显降低。克隆A和亚克隆B2的菌株含相对分子质量约45000bp的质粒,而亚克隆B1的接合子Jzr69则含相对分子质量约54000bp的质粒,克隆C菌株接合失败。特异性PCR扩增、序列分析及质粒DNA电泳图谱证实该19株奇异变形杆菌均产KPC-2型碳青霉烯酶。结论产KPC-2型碳青霉烯酶奇异变形杆菌在医院ICU病房流行,存在克隆传播现象。 张嵘 胡燕燕 孙谦 蔡加昌 周宏伟 陈功祥关键词:变形杆菌 疾病暴发流行 Β内酰胺酶类 HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌的应用研究 被引量:7 2011年 目的采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌,评价其优缺点。方法收集浙江、安徽等地74株临床非结核分枝杆菌,采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌,并用16SrRNA基因测序方法对其进行比较和评价。结果74株非结核分枝杆菌HAIN基因分型试剂盒鉴定结果为:31株胞内分枝杆菌,12株脓肿分枝杆菌,8株偶发分枝杆菌,6株堪萨斯分枝杆菌,5株鸟分枝杆菌,3株耻垢分枝杆菌,2株草分枝杆菌,2株瘰疬分枝杆菌,1株戈登分枝杆菌,另外有4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属,不能鉴定到种。8株结核分枝杆菌鉴定准确。与16S rRNA基因测序相比较,HAIN基因分型试剂盒除了4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属以外,其余70株非结核分枝杆菌均能鉴定到种,鉴定符合率为94.59%;并且它能进一步区分脓肿分枝杆菌和龟分枝杆菌,以及堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌。如果单纯鉴定HAIN基因分型试剂盒菌株范围之内的临床最常见非结核分枝杆菌菌株,鉴定符合率为100%。结论HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌时间短、操作简单、结果准确,可在临床推广使用。 张嵘 方玉才 孙谦 张艳 柯文鸿 柳正卫 周宏伟 胡燕燕 陈功祥关键词:非结核分枝杆菌 多重耐药鲍曼不动杆菌对替加环素耐药状况分析 被引量:30 2011年 目的 了解多重耐药鲍曼不动杆菌对临床常用抗生素及新药替加环素的耐药状况.方法 收集2008-2009年浙江省4所教学医院的602株临床分离鲍曼不动杆菌,采用琼脂稀释法检测其对13种临床常用抗生素的敏感性,以及对多黏菌素B和替加环素的敏感性.同时,采用PFGE技术对24株多重耐药鲍曼不动杆菌进行同源性分析,以确定菌株间的亲缘关系.结果 浙江省4家教学医院2008-2009年分离的鲍曼不动杆菌主要来自于呼吸道标本,2009年达到277株(86.0%),血液标本数量从2008年的15株(5.4%)下降到2009年的5株(1.5%),而其他标本无明显变化.鲍曼不动杆菌对临床常用的13种抗生素均有不同程度的耐药,耐药率35.0%~85.0%.与2008年相比,除左氧氟沙星和妥布霉素耐药率分别下降0.9%和9.0%以外,2009年其余抗生素耐药率均有不同程度地上升,头孢曲松和头孢吡肟耐药率增加了近10.0%,对碳青霉烯类抗生素亚胺培南和美罗培南的耐药率分别达到74.2%(239/602)和70.8%(228/602).鲍曼不动杆菌对替加环素显示了很高的耐药率,耐药率达到78.9%(475/602),而多黏菌素B耐药率仅为3.7%(22/602).PFGE分型显示2008-2009年24株鲍曼不动杆菌有6个克隆型,其中A型最常见,占50%.结论 鲍曼不动杆菌对替加环素的耐药加大了院内感染控制的难度,临床应加强控制,防止多重耐药菌的传播. 孙谦 周宏伟 胡燕燕 陈功祥关键词:鲍氏不动杆菌 米诺环素 比较MALDI-TOF MS直接涂片法与蛋白提取法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的应用研究 被引量:5 2015年 目的比较基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)直接涂片法和蛋白提取法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的差异。方法收集118株临床分离经VITEK全自动细菌仪鉴定为洋葱伯克霍尔德菌群菌株,采用MALDI-TOF MS直接涂片法和蛋白提取法进一步分析基因型,同时比较两种鉴定方法之间的优缺点。结果 118株洋葱伯克霍尔德菌群经MALDI-TOF MS两种方法只是鉴定结果分数有所差异,鉴定结果一致,分别为:93株Burkhoderia cencepacia(基因型Ⅲ型),11株多嗜伯克霍尔德菌(基因型Ⅱ型),10株洋葱伯克霍尔德菌(基因型I型),3株越南伯克霍尔德菌(基因型V型),1株吡咯伯克霍尔德菌(基因型Ⅸ型)。MALDI-TOF MS直接涂片法鉴定分数均值2.126,仅9株(7.62%)鉴定结果不可信(分值<1.700),准确鉴定至种(t≥2.300)与准确鉴定至属(t≥1.700)的比例分别为38.98%和92.38%;MALDI-TOF MS蛋白提取法仅2株(1.69%)鉴定结果不可信,准确鉴定至种(t≥2.300)与准确鉴定至属(t≥1.700)的百分比均高于直接涂片法,分别为44.92%和98.31%;但是不同分值分组间准确鉴定至种(分值≥2.300)、鉴定至属(分值≥1.700),两种方法差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 MALDI-TOF MS可快速准确地鉴定洋葱伯克霍尔德菌群至基因型,临床标本鉴定时首选MALDI-TOF MS直接涂片法,对于鉴定结果不可信的菌株可进一步采用蛋白提取法鉴定。 孙谦 屈青云 胡燕燕 周宏伟关键词:直接涂片法