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王兆捷
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4
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供职机构:
中国科学院生物物理研究所
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相关领域:
生物学
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合作作者
宋时英
中国科学院生物物理研究所
林政炯
中国科学院生物物理研究所
沈月全
中国科学院生物物理研究所
周筠梅
中国科学院生物物理研究所
张发明
中国科学院生物物理研究所
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1篇
2000
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甘油醛-3-磷酸脱氢酶三维结构与功能
宋时英
李军
沈月全
林政炯
邹承鲁
周筠梅
张发明
高义贵
王兆捷
许义斌
梁树坚
该项成果测定了中国南海龙虾尾肌甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)及其修饰物、衍生物和复合物的中等或高分辨率三种晶型共10种晶体结构。holo-GAPDH和apo-GAPDH结构研究提供了第一个高分辨率肌肉型GAPDH结...
关键词:
关键词:
GAPDH
晶体结构
P. versicolor D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物的晶体学研究
王兆捷
关键词:
辅酶
晶体结构
甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物ATP及底物磷酸结合特性的晶体学研究
1998年
气相扩散共晶生长法培养出P.versicolor龙虾肌ATP-D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(ATP-GAPDH)的晶体。用同步辐射X光源-磷光储屏-Weissenberg照相机系统收集了一套2.0分辨率的衍射数据。用同晶差值傅立叶法解析了其结构。精化后的结构模型最终R因子为0.197,与标准键长、键角的均方根偏差为0.016°和3.20°。PvATP-GAPDH结构总体上和Pvapo-GAPDH相似。ATP分子的占有率较低,并表现出一定程度的无序性,提示ATP与酶蛋白结合的稳定性较低,表明NAD+的尼克酰胺核苷部分与蛋白质分子的作用在辅酶与蛋白质的稳定结合中起关键作用。ATP-GAPDH中每个亚基只有一个磷酸结合位点(Pi)。认为无机磷酸结合位点Pi的形成不依赖于NAD+,而底物磷酸结合位点PS的形成则依赖于NAD+的存在。
王兆捷
宋时英
林政炯
关键词:
晶体结构
ATP
龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物结合的晶体学
2000年
与辅酶不同,辅酶类似物ADP-ribose和SNAD与D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的结合不表现协同性.用共晶方法和座滴汽相扩散技术培养出中国南海龙虾(Palinurus versicolor)GAPDH与ADP-ribose和SNAD复合物的晶体.X射线衍射数据分析表明它们的空间群均为C2,并具有类似晶胞参数,分别为 α= 15.280 nm, b= 10.035 nm, c= 12.831 nm, β=110.28°和α=15.341 nm,b=10.051 nm,c=12.844nm,β=110.48°.估算不对称单位合1个分子即4个亚基.与GAPDH全酶和酶蛋白晶体比较,属于不同晶型.这个结果提示着辅酶类似物的结合产生了比较大的酶构象变化,而且这个构象变化不同于辅酶结合引起的构象变化.旋转函数计算结果表明,这两种辅酶类似物复合物的四聚体也具有明显的222分子对称性.它们的结构分析并与全酶和酶蛋白比较将为了解酶的协同性机理提供一些有益的线索.
沈月全
王兆捷
宋时英
周筠梅
林政炯
关键词:
磷酸脱氢酶
龙虾
GAPDH
晶体学
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