沈月全
- 作品数:7 被引量:2H指数:1
- 供职机构:中国科学院生物物理研究所更多>>
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- 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物结合的晶体学
- 2000年
- 与辅酶不同,辅酶类似物ADP-ribose和SNAD与D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的结合不表现协同性.用共晶方法和座滴汽相扩散技术培养出中国南海龙虾(Palinurus versicolor)GAPDH与ADP-ribose和SNAD复合物的晶体.X射线衍射数据分析表明它们的空间群均为C2,并具有类似晶胞参数,分别为 α= 15.280 nm, b= 10.035 nm, c= 12.831 nm, β=110.28°和α=15.341 nm,b=10.051 nm,c=12.844nm,β=110.48°.估算不对称单位合1个分子即4个亚基.与GAPDH全酶和酶蛋白晶体比较,属于不同晶型.这个结果提示着辅酶类似物的结合产生了比较大的酶构象变化,而且这个构象变化不同于辅酶结合引起的构象变化.旋转函数计算结果表明,这两种辅酶类似物复合物的四聚体也具有明显的222分子对称性.它们的结构分析并与全酶和酶蛋白比较将为了解酶的协同性机理提供一些有益的线索.
- 沈月全王兆捷宋时英周筠梅林政炯
- 关键词:磷酸脱氢酶龙虾GAPDH晶体学
- D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶的结构和功能人肌肌酸激酶的结构和功能
- D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)在磷酸和辅酶(NAD<'+>)存在的条件下,催化甘油醛-3磷酸(GAP)经过氧化磷酸化生成1,3-二磷酸甘油酸.它还是一个别构蛋白,对于NAD<'+>的结合,不同来源的GAPDH表...
- 沈月全
- 关键词:甘油醛-3-磷酸脱氢酶肌酸激酶GAPDH复合物晶体结构辅酶
- 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶四方晶型结构被引量:1
- 2000年
- 用座滴汽相扩散法培养出龙虾 (Palinurusversicolor)D 甘油醛 3 磷酸脱氢酶(holo GAPDH)的四方型晶体 ,空间群为P42 12 ,晶胞参数为a =1 5 .49nm ,c =8 0 3nm ,不对称单位含两个亚基 .应用分子置换法测定了 0 .34nm分辨率晶体结构 .最后的晶体学Rfree和R因子分别为 0 2 74和 0 2 6 2 ,与标准键长和键角的均方根偏差分别为 0 0 0 2nm和 2 33°.不对称单位的两个亚基不仅三维结构相似而且平均温度因子也接近 ,这一结果说明以前报道的C2晶型中亚基平均温度因子的显著差别很可能是由于两个亚基处于不同的晶体学环境引起的 ,进一步支持了holo GAPDH分子具有良好的 2 2 2对称性 .
- 沈月全宋时英林政炯
- 关键词:磷酸脱氢酶龙虾晶体结构GAPDH
- SNAD+-GAPDH的分子不对称性
- D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)发挥其催化作用时,辅酶NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)是不可缺少的氢受体,同时不同来源的GAPDH与NAD的结合时表现出不同的协同性.辅酶类似物在结构上与NAD类似,但与GAPDH结...
- 宋时英沈月全张雅群林政炯
- 文献传递
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶三维结构与功能
- 宋时英李军沈月全林政炯邹承鲁周筠梅张发明高义贵王兆捷许义斌梁树坚
- 该项成果测定了中国南海龙虾尾肌甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)及其修饰物、衍生物和复合物的中等或高分辨率三种晶型共10种晶体结构。holo-GAPDH和apo-GAPDH结构研究提供了第一个高分辨率肌肉型GAPDH结...
- 关键词:
- 关键词:GAPDH晶体结构
- 劳埃晶体学时代的到来被引量:1
- 2001年
- 近年来 ,人们对古老的劳埃衍射技术重新产生了浓厚的兴趣。这主要是因为世界各地新的同步辐射光源的建成;各种先进的插入件,诸如波形器(wiggler)、波荡器(undulator)的飞速发展 ;以及利用这类光源通过时间分辨晶体学来研究分子结构动态变化的前景。在过去的十年中 ,理论研究已经阐明了多波长衍射几何学的特征 ,在很大程度上加深了我们对劳埃法的认识。劳埃数据处理方法及其软件开发也因此有所创新。曾在相当长的时间内限制这项技术应用的劳埃数据处理中的大部分问题现在已经得到解决 ;同步辐射光源 ,束线光学器件及X射线探测器等方面也都取得了显著的进步。静态劳埃实验得到的结构因子振幅在质量上已同单波长数据相当。晶体中反应易于启动的时间分辨劳埃实验已经开始在一系列生物分子体系中得到成功的实践。由此得到的关于结构动力学的信息是任何其它传统的衍射方法所无能为力的。这些静态的及时间分辨的实验说明了劳埃法已经开始走向成熟 ,并指明了今后发展的方向 ,即对晶体的镶嵌度和劳埃衍射点的相应能量宽度的正确处理、扩散散射的考虑、时间分辨实验中低浓度瞬态中间物结构的测定等等。
- REN ZhongDominique BourgeoisJohn R.HelliwellKeith MoffatVukicaSrajerBarry L.Stoddard沈月全杨晓静任匡一顾茵任重
- 关键词:生物分子
- 劳埃晶体学时代的到来
- 2002年
- 任重Dominique BourgeoisJohn R.HelliwellKeith MoffatVukica SrajerBarry L.Stoddard沈月全杨晓静任匡一顾茵
- 关键词:蛋白质晶体学