顾全
- 作品数:8 被引量:6H指数:2
- 供职机构:东华大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金上海市人才发展基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生理学自动化与计算机技术更多>>
- 基于近似熵的伪氨基酸组成预测蛋白质亚核定位被引量:1
- 2008年
- 了解真核细胞中细胞核内蛋白质的定位情况对于新发现蛋白质的功能注释具有重要意义。随着蛋白质数据库中蛋白质序列数量的急速增加,采用计算方法来预测蛋白质亚核定位已经成为蛋白质科学领域研究的热点。根据Chou提出的伪氨基酸组成离散模型,提出了一种新的蛋白质亚核定位预测方法。计算蛋白质序列的近似熵作为附加特征构建伪氨基酸组成,表示蛋白质序列特征,AdaBoost分类算法作为预测工具。与已报道的亚核定位预测方法的性能相比,这种方法具有更高的准确率。
- 张同亮丁永生顾全孙登宽
- 关键词:近似熵ADABOOST分类器
- 基于集成智能的膜蛋白受体结构与功能研究
- 蛋白质是生命的物质基础,凡乎任何生物过程都与蛋白质发生某种联系。目前蛋白质序列数量的激增,急需要开发快速、准确的计算工具预测蛋白质的功能。因此,在蛋白质组学方面,生物信息学也得到很大发展,很多智能算法和服务器都已经得到开...
- 顾全
- 关键词:集成分类器半监督学习复杂网络
- 文献传递
- 系统参数完全未知的一个新超混沌系统自适应修正投影同步
- 2008年
- 基于Lyapunov稳定性原理,在驱动系统和响应系统参数完全未知的情况下,设计自适应控制器和参数更新准则,使得两个不同或相同混沌系统同步,并能辨识出系统参数,同时可以通过调节控制增益和自适应增益来调整同步速度和参数辨识速度.作为该方法的应用,对超混沌Chen系统和一个新的超混沌系统实现了修正投影同步.数值仿真证明了所提方法的正确性.
- 唐漾方建安庄梅玲顾全
- 关键词:自适应控制参数辨识超混沌系统
- G蛋白偶联受体超类的识别方法及其Web服务系统
- 本发明涉及一种G蛋白偶联受体超类的识别方法及其Web服务系统,所述的方法采用G蛋白偶联受体样本的一阶签名模型来表示G蛋白偶联受体样本;采用离散二进制粒子群算法来提取G蛋白偶联受体样本的有效特征;采用基于模糊神经网络的集成...
- 丁永生顾全
- 文献传递
- 基于伪氨基酸组成的G蛋白偶联受体超家族的识别被引量:4
- 2010年
- G蛋白偶联受体(GPCRs)是人体内最大的蛋白质受体家族,在制药业中起到很大作用。G蛋白偶联受体的功能和其超家族、子家族的分类密切相关,然而目前其空间结构却很难用实验方法获得。因此,如何用计算的方法预测G蛋白偶联受体的家族和超家族是生物信息学和蛋白质科学中重要的研究内容。根据Chou提出的伪氨基酸离散模型框架,使用近似熵的概念表示G蛋白序列附加特征,构造一种新的蛋白序列表示方法。采用FKNN(模糊K近邻)分类器作为预测工具,从最新的G蛋白数据抽取全部数据,经过去除同源性处理后,构成低同源性的新测试数据集。Jackknife测试结果验证了此方法的有效性。与之前的研究结果相比,取得了最高的预测精度。结果表明,此方法处理G蛋白偶联受体有很高的实用价值。
- 顾全丁永生张同亮沈懿珍
- 关键词:G蛋白偶联受体近似熵
- G蛋白偶联受体超类的识别方法及其Web服务系统
- 本发明涉及一种G蛋白偶联受体超类的识别方法及其Web服务系统,所述的方法采用G蛋白偶联受体样本的一阶签名模型来表示G蛋白偶联受体样本;采用离散二进制粒子群算法来提取G蛋白偶联受体样本的有效特征;采用基于模糊神经网络的集成...
- 丁永生顾全
- 文献传递
- 基于硬件扫描的LED显示系统
- 本系统是针对LED显示系统而进行研究的,详述了LED汉字显示屏的制作原理,方案选择与具体的实现过程。在硬件设计方面,由地发生器给出列选通信号,按顺序依次对列进行扫描,配合每列的数据输出,实现LED发光。主控制系统采用单片...
- 顾全丁永生
- 关键词:LED显示屏地址发生器字模提取单片机控制
- 文献传递
- 使用伪氨基酸和集成分类器预测凋谢蛋白亚细胞定位被引量:2
- 2009年
- 预测凋谢蛋白质亚细胞定位是生物信息学和蛋白质科学中重要的研究内容。基于Chou的伪氨基酸组成概念,用近似熵表示蛋白质序列的附加特征,组成新的伪氨基酸组成表示序列特征。将蛋白质序列看作短时间序列,近似熵能够区分不同亚细胞定位中序列的复杂度。结合多个模糊K近邻分类器(基本分类器)的集成分类器作为预测工具。以不同维数的伪氨基酸组成向量,作为每个基本分类器的输入数据。3个常用的数据集用来测试算法的性能,Jackknife测试结果表明新算法有效和实用。有望发展成为亚细胞定位研究的有用工具。
- 魏蓉赵艳君张同亮顾全
- 关键词:近似熵集成分类器