沈懿珍
- 作品数:6 被引量:4H指数:1
- 供职机构:东华大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金上海市人才发展基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于协同智能的膜蛋白相互作用及其网络特性的研究
- 2011年
- 膜蛋白及其相互作用网络已经成为现在生物信息学领域研究的一个新方向。本文提出了一种基于协同智能的膜蛋白相互作用及其网络的研究方法。这里所说的协同智能指的是谱分析、模糊K近邻(KNN)算法等方法的集成。我们将生物系统看作是一系列的计算组件,这些组件之间在外界环境下相互作用可以根据要求构造出膜蛋白相互作用网络。基于以上所提出的方法,可以更加深入地发现膜蛋白相互作用及其网络具有一定的动态和集成特性,比如小世界网络、无标度分布以及分层模块结构。这些性质类似于其他已经得到广泛研究过的蛋白质相互作用及其网络。针对这些膜蛋白相互作用及其网络特性的研究将有助于以后更深入开展一些相关生物和药物的研究。
- 沈懿珍丁永生郝矿荣
- 关键词:谱分析小世界网络
- 一种多功能电子表
- 本实用新型涉及一种多功能电子表,包括电子表,所述的电子表中设有卡槽;所述的卡槽中装有U盘;所述的电子表内部嵌有相互独立的网上银行动态口令芯片和交通卡;所述的U盘与所述的网上银行动态口令芯片连接。本实用新型因在电子表中融入...
- 徐晶晶丁永生程丽俊王伟沈懿珍熊昌慧
- 文献传递
- 基于伪氨基酸组成的G蛋白偶联受体超家族的识别被引量:4
- 2010年
- G蛋白偶联受体(GPCRs)是人体内最大的蛋白质受体家族,在制药业中起到很大作用。G蛋白偶联受体的功能和其超家族、子家族的分类密切相关,然而目前其空间结构却很难用实验方法获得。因此,如何用计算的方法预测G蛋白偶联受体的家族和超家族是生物信息学和蛋白质科学中重要的研究内容。根据Chou提出的伪氨基酸离散模型框架,使用近似熵的概念表示G蛋白序列附加特征,构造一种新的蛋白序列表示方法。采用FKNN(模糊K近邻)分类器作为预测工具,从最新的G蛋白数据抽取全部数据,经过去除同源性处理后,构成低同源性的新测试数据集。Jackknife测试结果验证了此方法的有效性。与之前的研究结果相比,取得了最高的预测精度。结果表明,此方法处理G蛋白偶联受体有很高的实用价值。
- 顾全丁永生张同亮沈懿珍
- 关键词:G蛋白偶联受体近似熵
- 基于协同智能的蛋白质相互作用及其网络研究
- 膜蛋白在生物体中担负着多种多样的功能,大部分膜蛋白在药物设计、运转蛋白和免疫识别等方面起着关键的作用;膜蛋白同时也是重要的药物标靶。膜蛋白相互作用,尤其是螺旋膜蛋白相互作用,是所有蛋白质相互作用中的重要部分。各种组织中近...
- 沈懿珍
- 关键词:蛋白质基因调控网络模型药物靶点
- 文献传递
- 一种核集成优化分类方法
- 本发明公开了一种基于核函数集成整体参数优化分类方法,涉及模式识别分类技术。此方法包括数据预处理、核函数选择、样本特征提取、样本分类、优化分类模型参数、预测六个模块。工作流程是:用户将数据的分类请求和分类数据提交给系统,系...
- 丁永生程丽俊郝矿荣胡一帆沈懿珍任龙
- 文献传递
- 基因网络仿真系统的研究
- 分子生物学的深入发展揭示了复杂的生命现象是大量基因相互作用的结果,因此基因网络作为一种系统的、定量的研究方法正在受到重视。基因网络仿真系统,旨在探索基因之间的相互调控关系,对某一物种或组织中全部基因的表达关系进行整体性研...
- 沈懿珍丁永生边涛
- 关键词:基因网络基因调控模糊聚类仿真系统
- 文献传递