吴奇涵
- 作品数：25 被引量：41H指数：4
- 供职机构：复旦大学生殖与发育研究院更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金国家自然科学基金上海市“科技创新行动计划”更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学化学工程更多>>
- Cyclin H基因启动子区-1 SNP对转录活性的影响被引量：1
- 2008年
- 目的探讨CCNH基因启动子区-1SNP位点碱基变异对CCNH基因转录活性的影响。方法通过PCR和定点突变技术,构建了含CCNH基因基础启动子及-1G突变启动子,用双荧光素酶报告系统观察此SNP对CCNH基因启动子转录活性的影响。结果在AD293细胞中,-1G突变启动子活性比CCNH基础启动子活性低26%(P<0.05)。结论-1T→G碱基变异可显著降低CCNH基因启动子转录活性。
- 陈佩林陈鑫郑红霞吴奇涵
- 关键词：SNP
- 巣式PCR法扩增EGFR基因外显子19片段的方法
- 本发明涉及分子生物学领域，公开了一种用巣式PCR法扩增中EGFR基因外显子19片段的方法。步骤包括：(1)第一轮PCR扩增，以血浆DNA或石蜡切片DNA为模板，扩增25～35个循环，所用的引物为：C19F和C19R；(2...
- 蔡燕燕吴奇涵顾海英
- 巢式PCR法扩增EGFR基因外显子19片段的方法
- 本发明涉及分子生物学领域，公开了一种用巢式PCR法扩增中EGFR基因外显子19片段的方法。步骤包括：（1）第一轮PCR扩增，以血浆DNA或石蜡切片DNA为模板，扩增25～35个循环，所用的引物为：C19F和C19R；（2...
- 蔡燕燕吴奇涵顾海英
- 文献传递
- 一种与晚期非小细胞肺癌患者铂类化疗毒副作用相关的miRNA标志物及其应用
- 本发明涉及一种与晚期非小细胞肺癌患者铂类化疗毒副作用相关的miRNA标志物及其应用和相关试剂盒，该标志物为hsa-mir-196a2 rs11614913，可用于检测或预测晚期非小细胞肺癌患者铂类化疗毒副作用，为此类病患...
- 吴奇涵詹晓莹
- 利用基因芯片对一高保守基因进行肿瘤相关分析被引量：2
- 2002年
- 本文对大规模人类cDNA测序过程中获得的一条高保守基因进行了初步功能研究 ,生物信息学研究发现该基因在人类、小鼠、果蝇、拟南芥和裂殖酵母中都有很高的保守性 ,其他分析预测该基因可能具有肿瘤相关性。RT -PCR分析表明 ,该基因在成人和胎儿组织中广谱表达。利用基因芯片分析该基因在 7例肝癌、5例胰腺癌、2例喉癌和 2例肺癌中表达情况 ,结果证实了该基因的肿瘤相关性 ,并且提示该基因在不同肿瘤类型中可能处于不同的地位。
- 程超周宗祥徐明赵炜徐坚曾立黄燕吴奇涵戴建锋应康谢毅毛裕民
- 关键词：基因芯片结构域
- 用抑制性差减杂交构建As_2O_3诱导的NB4细胞凋亡相关基因文库
- 2009年
- 目的:构建三氧化二砷(As2O3)诱导的急性早幼粒细胞白血病细胞株NB4细胞凋亡相关基因文库。方法:用含4μmol·L-1As2O3和正常培养基培养NB4细胞24h,抽提总RNA,经逆转录酶合成双链cDNA,分别以砷诱导凋亡组和对照组作为tester和driver,进行双向抑制性差减杂交(suppress-ion subtractive hybridization,SSH),筛选As2O3诱导的NB4细胞凋亡相关基因,将差异表达基因进行PCR扩增并与pGEM-Teasy克隆载体连接,转化DH5α大肠杆菌,经蓝白斑筛选获得白色阳性克隆,PCR扩增出未知基因片段。结果:成功构建了分别代表在NB4细胞中表达上调和下调的基因文库。结论:经双向抑制性差减杂交获得了NB4细胞差异表达基因文库,为克隆NB4细胞凋亡相关基因奠定了基础。
- 狄春红顾少华谭晓华仙玲玲吴奇涵杨磊
- 关键词：白血病NB4细胞三氧化二砷抑制性差减杂交凋亡
- 黑素皮质1型受体基因的SNP及其应用
- 本发明涉及遗传学领域，提供人黑素皮质素1型受体(melanocortin1 receptor，MC1R)基因CDS区第421位和第497位的单核苷酸多态性(SNP)及应用。通过对MC1R基因单核苷酸多态性进行广泛而深入的...
- 郑红霞蔡燕燕顾海英吴奇涵
- 文献传递
- CYP1A1基因Ile462Val多态位点在吸烟人群中与肺癌易感性显著相关被引量：1
- 2011年
- 利用meta分析的方法探讨吸烟人群中CYP1A1基因多态位点与肺癌易感性的关系.获取1986年至2010年2月pubmed等数据库中有关CYP1A1基因Ile462Val和Msp1位点多态性与肺癌易感性关系的研究结果,统计对应的吸烟者或非吸烟者的研究数据,运用RevMan4.2软件对各研究原始结果进行统计处理,计算合并OR值及95%可信区间.按照纳入标准,最终入选文献共有29篇病例对照研究,吸烟者中Ile462Val位点与肺癌发生显著相关,基因型Val/Val+Ile/Val比Ile/Ile的合并OR值为1.29(95%CI∶1.03,1.63),P<0.05,而该位点在非吸烟者中及Msp1位点在两种人群的分析结果均不具统计学意义.上述结果提示,对目前相关研究结果的Meta分析显示,吸烟者中CYP1A1基因Ile462Val位点多态性与肺癌易感性之间存在一定相关性.
- 蔡燕燕谭晓明郑红霞顾海英詹晓莹吴奇涵
- 关键词：肺癌CYP1A1基因多态性META分析
- 帕金森病易感基因的筛选
- 谢惠君汤国梅郝怡鑫陈丽珊郑惠民任大明丁素菊徐玲赵晓萍兰和魁吴帅王荫榆蔡建英汪晓华崔毅林大宇管阳太吴奇涵
- 对该单位关于帕金森病（Parkinson's Disease， PD）的研究总结如下：在国内外首次发现DBH基因TaqI多态A2等位基因、A2/A2基因型和PD之间存在正关联；指出A2M基因MboI多态V等位基因及V/I...
- 关键词：
- 关键词：帕金森病易感基因
- 人类基因组miRNA转录调控区保守性DNA序列生物信息学分析被引量：1
- 2009年
- MicroRNA(miRNA)的表达调控方式一直是一个有争议的问题,为了研究miRNA潜在的转录调控特点,本文通过Sanger网站miRNA数据库获得人类miRNA的信息,并建立miRNA相关信息数据库,用MEME和Wordspy两个软件对其上游2000bp序列进行保守性分析,得到保守性的DNA序列(motif),用TESS软件分析保守性DNA序列,预测其转录因子结合情况。通过比较位于基因间、反义链和内含子中的三类不同miRNA转录调控区的保守性和自主转录能力的差异,结果发现位于基因间、反义链上的miRNA上游调控区的保守性比位于内含子的miRNA高,在miRNA的转录调控区存在RNA聚合酶Ⅱ类型的转录因子结合位点,miRNA还表现出自身独特的转录调控方式。通过分析,我们还得到了miRNA表达调控中一些重要的转录因子以及独特的调控序列。本研究结果为miRNA转录调控机制的进一步研究提供了理论依据。
- 郑红霞窦同海蔡燕燕詹晓莹沈逢焘吴奇涵
- 关键词：MIRNA转录调控保守序列
