钱彬彬
- 作品数:16 被引量:22H指数:2
- 供职机构:中国科学院植物研究所更多>>
- 发文基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 一种产生p-羟基肉桂酸的基因工程菌株及其构建方法与应用
- 本发明涉及一种产生p‑羟基肉桂酸的基因工程菌株及其构建方法与应用。所述产生p‑羟基肉桂酸的基因工程菌株可以以葡萄糖为原料发酵生产p‑羟基肉桂酸,工艺简单,效率高,成本低,能够克服植物提取法所面临的植物资源生长周期长、与中...
- 汪仁李宜奎钱彬彬李洁李晓丹徐晟夏冰
- 石蒜科植物忽地笑细胞色素P450还原酶2及其编码基因与应用
- 本发明涉及细胞色素P450还原酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的细胞色素P450还原酶2,其具有良好的辅酶专一性,可以协助细胞色素P450酶发挥催化活性以氧化修饰其底物合成产物。本发明还揭示了编码所...
- 汪仁李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟程丽夏冰
- 植物CPR基因密码子偏好性及聚类分析被引量:16
- 2017年
- 细胞色素P450还原酶(cytochrome P450 reductase,CPR)在植物的生长、发育、天然产物的合成和抵御外界刺激的过程中发挥重要作用。本研究通过利用12种植物的36个CPR基因,运用Codon W软件分析密码子的偏好性指标,并分别运用SPSS和MEGA5.0软件进行密码子偏好性和基因聚类分析。结果显示,单子叶植物和双子叶植物CPR基因的有效密码子数(effective number of codons,ENC)范围分别为52.92~58.17和46.85~53.58,密码子偏好性较弱。全部CPR基因位点在ENC绘图中均偏离ENC期望曲线,其密码子偏好性主要是受自然选择压力的影响。单子叶植物和双子叶植物CPR基因对同义密码子的偏好性存在差异;同种植物不同CPR基因的密码子偏好性也不同。在基于基因同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)的聚类中,单子叶植物CPR基因和双子叶植物CPR基因分别聚为一支,更接近于12种植物的传统系统分类,反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的重要补充。在基于基因编码序列(coding sequence,CDS)的系统进化树中,同种植物的CPR基因分别聚到两个支上,一定程度上反映了CPR基因的分类和功能。本研究结果从密码子偏好性和蛋白质水平上说明同种植物的不同CPR基因存在功能与进化差异,为植物CPR基因的分类与演化、功能预测与表达以及植物育种研究奠定了基础。
- 程丽李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟夏冰汪仁
- 关键词:密码子偏好性聚类分析
- 忽地笑CYP98A的分子克隆与表达分析被引量:6
- 2018年
- 利用RACE技术从忽地笑(Lycoris aurea(L’Hér.)Herb.)花葶中克隆获得细胞色素P450酶98A亚家族蛋白编码基因LaCYP98A。该基因cDNA全长1 794 bp,开放阅读框为1 518 bp,编码含有505个氨基酸残基的LaCYP98A蛋白。LaCYP98A具有细胞色素P450酶特征性的亚铁血红素结合结构域和半胱氨酸残基组成的活性中心。LaCYP98A与拟南芥、大豆等其他植物CYP98A氨基酸序列的一致性在60%以上,且具有CYP450的所有特征模序。LaCYP98A定位于植物细胞的内质网,其N-端29个氨基酸对于其亚细胞定位具有重要的作用。利用pET表达系统,通过截掉其N-端内质网定位区域,可以实现LaCYP98A在大肠杆菌中的诱导表达。本研究为LaCYP98A的功能鉴定和植物细胞色素P450的原核表达及其催化的次级代谢产物的异源合成奠定了基础。
- 钱彬彬李宜奎李洁程丽夏冰汪仁
- 关键词:忽地笑分子克隆亚细胞定位原核表达
- 一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法
- 本发明公开了一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法,属于氨基酸衍生物生产技术领域。本发明包括:利用含有由人工密码子优化得到的四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因组装而成的基因簇的大肠杆菌,进行发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸,包括活化培养、...
- 李宜奎汪仁钱彬彬 李洁李杨
- 一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法
- 本发明公开了一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法,属于氨基酸衍生物生产技术领域。本发明包括:利用含有由人工密码子优化得到的四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因组装而成的基因簇的大肠杆菌,进行发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸,包括活化培养、...
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- 一种反式肉桂酸-4-羟化酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及反式肉桂酸‑4‑羟化酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的反式肉桂酸‑4‑羟化酶,其具有良好的底物专一性和区域选择性,可以催化反式肉桂酸的4位C的羟基化生成对‑香豆酸。本发明还揭示了编码所述反...
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- 四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因及其应用
- 本发明公开了一种四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因及其应用,属于基因工程和化合物生物技术生产领域。本发明所公开的四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因,是经密码子和mRNA空间结构等优化的人工合成的多核苷酸,可以通过可操作的方式与各种基...
- 汪仁李宜奎钱彬彬 李洁李杨
- 一种对香豆酸-3-羟化酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及对香豆酸‑3‑羟化酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的对香豆酸‑3‑羟化酶,其具有良好的底物专一性和区域选择性,可以催化对香豆酸的3位C的羟基化生成咖啡酸。本发明还揭示了编码所述对香豆酸‑3...
- 汪仁李宜奎钱彬彬徐晟李晓丹程丽夏冰
- 忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因的分子克隆与原核表达
- 2018年
- [目的]克隆忽地笑[Lycoris aurea (L’Hér.) Herb.]α-葡萄糖苷酶2编码基因。[方法]基于忽地笑的转录组数据库,分析功能注释为α-葡萄糖苷酶2的基因片段,通过设计特异性定量PCR扩增引物分析其在各组织中的表达丰度,利用RACE (rapid-amplification of c DNA ends)技术从高丰度组织中克隆获得忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因。[结果]忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因Lau Agl2 c DNA全长3 185 bp,开放阅读框为2 961 bp,编码含有986个氨基酸残基的Lau Agl2蛋白质。Lau Agl2蛋白质氨基酸序列具有α-葡萄糖苷酶Ⅱ特征性的保守结构域和天冬氨酸残基组成的活性中心,还具有一些蛋白质糖基化的潜在位点(N-X-S/T共有序列)。Lau Agl2蛋白质与油棕、陆地棉等其他植物的α-葡萄糖苷酶2的氨基酸序列一致性为73.0%以上。利用p ET表达系统,可以在大肠杆菌中实现Lau Agl2蛋白质的诱导表达。[结论]成功从忽地笑花葶和花瓣中克隆到α-葡萄糖苷酶2编码基因Lau Agl2并在大肠杆菌中对Lau Agl2进行了异源表达,为Lau Agl2蛋白质的功能鉴定及其在忽地笑种子萌发与生长发育中的作用研究奠定了基础。
- 李宜奎李洁程丽钱彬彬汪仁
- 关键词:忽地笑分子克隆原核表达