李宜奎
- 作品数:32 被引量:22H指数:2
- 供职机构:中国科学院植物研究所更多>>
- 发文基金:江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生生物学更多>>
- 一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法
- 本发明公开了一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法,属于氨基酸衍生物生产技术领域。本发明包括:利用含有由人工密码子优化得到的四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因组装而成的基因簇的大肠杆菌,进行发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸,包括活化培养、...
- 李宜奎汪仁钱彬彬 李洁李杨
- 一种α-葡萄糖苷酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及α‑葡萄糖苷酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的α‑葡萄糖苷酶,其具有良好的转葡萄糖基活性,可以产生α‑葡萄糖苷物质。本发明还揭示了编码所述α‑葡萄糖苷酶的多核苷酸,表达所述α‑葡萄糖苷酶的...
- 汪仁李宜奎李洁周佳宇王松凤
- 一种反式肉桂酸-4-羟化酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及反式肉桂酸‑4‑羟化酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的反式肉桂酸‑4‑羟化酶,其具有良好的底物专一性和区域选择性,可以催化反式肉桂酸的4位C的羟基化生成对‑香豆酸。本发明还揭示了编码所述反...
- 李宜奎汪仁钱彬彬李晓丹徐晟程丽夏冰
- 植物CPR基因密码子偏好性及聚类分析被引量:16
- 2017年
- 细胞色素P450还原酶(cytochrome P450 reductase,CPR)在植物的生长、发育、天然产物的合成和抵御外界刺激的过程中发挥重要作用。本研究通过利用12种植物的36个CPR基因,运用Codon W软件分析密码子的偏好性指标,并分别运用SPSS和MEGA5.0软件进行密码子偏好性和基因聚类分析。结果显示,单子叶植物和双子叶植物CPR基因的有效密码子数(effective number of codons,ENC)范围分别为52.92~58.17和46.85~53.58,密码子偏好性较弱。全部CPR基因位点在ENC绘图中均偏离ENC期望曲线,其密码子偏好性主要是受自然选择压力的影响。单子叶植物和双子叶植物CPR基因对同义密码子的偏好性存在差异;同种植物不同CPR基因的密码子偏好性也不同。在基于基因同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)的聚类中,单子叶植物CPR基因和双子叶植物CPR基因分别聚为一支,更接近于12种植物的传统系统分类,反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的重要补充。在基于基因编码序列(coding sequence,CDS)的系统进化树中,同种植物的CPR基因分别聚到两个支上,一定程度上反映了CPR基因的分类和功能。本研究结果从密码子偏好性和蛋白质水平上说明同种植物的不同CPR基因存在功能与进化差异,为植物CPR基因的分类与演化、功能预测与表达以及植物育种研究奠定了基础。
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- 关键词:密码子偏好性聚类分析
- 一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法
- 本发明公开了一种发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸的方法,属于氨基酸衍生物生产技术领域。本发明包括:利用含有由人工密码子优化得到的四氢甲基嘧啶羧酸生物合成基因组装而成的基因簇的大肠杆菌,进行发酵生产四氢甲基嘧啶羧酸,包括活化培养、...
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- 唐菖蒲伯克霍尔德氏菌荧光定量PCR内参基因及其引物的筛选和应用
- 本发明公开了唐菖蒲伯克霍尔德氏菌实时荧光定量PCR(qRT‑PCR)内参基因及其引物的筛选和应用。根据已获得的转录组分析结果及已报道的内参基因,初步筛选表达相对较为稳定的12个候选内参基因,基因名分别为:atpD、clp...
- 李晓丹汪仁徐晟王蓉江玉梅周正雄李宜奎王松凤
- 唐菖蒲伯克霍尔德氏菌荧光定量PCR内参基因及其引物的筛选和应用
- 本发明公开了唐菖蒲伯克霍尔德氏菌实时荧光定量PCR(qRT‑PCR)内参基因及其引物的筛选和应用。根据已获得的转录组分析结果及已报道的内参基因,初步筛选表达相对较为稳定的12个候选内参基因,基因名分别为:<I>atpD<...
- 李晓丹汪仁徐晟王蓉江玉梅周正雄李宜奎王松凤
- 一种产生p-羟基肉桂酸的基因工程菌株及其构建方法与应用
- 本发明涉及一种产生p‑羟基肉桂酸的基因工程菌株及其构建方法与应用。所述产生p‑羟基肉桂酸的基因工程菌株可以以葡萄糖为原料发酵生产p‑羟基肉桂酸,工艺简单,效率高,成本低,能够克服植物提取法所面临的植物资源生长周期长、与中...
- 汪仁李宜奎钱彬彬李洁李晓丹徐晟夏冰
- 一株忽地笑内生细菌伯克霍尔德氏菌HDXY‑02及其应用
- 本发明公开了一株拮抗多种植物病原真菌的忽地笑内生细菌,具体涉及伯克霍尔德氏菌(Burkholderia sp.)HDXY‑02,该菌株己保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,其保藏编号为CGMCC No 14...
- 汪仁李晓丹李宜奎周佳宇夏冰
- 石蒜科植物忽地笑细胞色素P450还原酶2及其编码基因与应用
- 本发明涉及细胞色素P450还原酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的细胞色素P450还原酶2,其具有良好的辅酶专一性,可以协助细胞色素P450酶发挥催化活性以氧化修饰其底物合成产物。本发明还揭示了编码所...
- 汪仁李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟程丽夏冰