李庆磊
- 作品数：1 被引量：6H指数：1
- 供职机构：河南中医药大学药学院更多>>
- 发文基金：河南省教育厅科学技术研究重点项目博士科研启动基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 冬凌草转录组SSR位点分析及多态性初步评价被引量：6
- 2016年
- 以冬凌草转录组为研究对象,使用Microsatellite(MISA)软件进行SSR搜索,分析冬凌草中SSR位点信息,并利用Primer 3设计SSR引物,对其多态性进行初步评价。结果表明:研究共发现11 114个SSR,分布于8 873条独立基因(Unigenes)中,SSR位点出现频率为24.90%,共有55种重复基元,平均每3 517bp含1个SSR位点。SSR位点所包含的重复类型中,二核苷酸重复是主要类型,占总SSR的47.71%;其次是单碱基重复类型(35.46%)。SSR所包含的重复基元中,单核苷酸重复基元A/T和二核苷酸重复基元AG/CT是优势重复基元,分别占总SSR的34.95%、30.16%。多态性进行评价结果表明冬凌草转录组SSR类型丰富,多态性潜能高。
- 苏秀红李庆磊陈随清董诚明杨晶凡尹雷
- 关键词：冬凌草转录组SSR
