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- 梨SSR指纹图谱身份证的研究进展与展望
- 2025年
- 为更加科学、快捷、精准地开展梨品种资源鉴定工作,文章综述了SSR指纹图谱身份证技术,回顾了该项技术在梨品种鉴定方面的研究进展和应用情况,详细分析了当前这项技术在简便性、可扩充性、标记数据的采集与分析等方面存在的问题,针对上述问题介绍了采用更高效的编码方法、进行数据扩充、使用荧光标记毛细管电泳检测技术等改进的方向,并对今后SSR指纹图谱身份证技术结合新一代测序技术,实现更加快速、准确、高效的梨品种鉴定工作等方面进行了展望。
- 曹军王茂森王国铸赵杰王建明郑思思陶弢赵怡宁张才喜纠松涛
- 关键词:SSR标记指纹图谱分子身份证
- 桃新品系‘保佳早蜜’亲缘关系的SSR分析
- 2025年
- ‘保佳早蜜’是在‘深州蜜桃’产区发现的白肉桃实生优系,其果实具有‘深州蜜桃’的独特风味。为明确桃新品系‘保佳早蜜’的亲缘关系,本研究利用筛选出的19对多态性良好的SSR引物对深州及其周边的54个桃品种进行分析,并利用SSR分子标记进行聚类分析。结果显示,共扩增出DNA谱带225条,其中多态性谱带194条,占扩增谱带数总和的86.2%,‘保佳早蜜’与‘深州蜜桃’在树状图上聚为一类,相似系数达0.821,推断‘深州蜜桃’是‘保佳早蜜’的亲本。本研究明确了‘保佳早蜜’的亲缘关系,排除了其与以前品种是同物异名的可能,同时也为今后以‘深州蜜桃’与‘保佳早蜜’为亲本进行桃新品种选育提供了理论依据。
- 安佳乐于辛春田义张学英陈海江
- 关键词:SSR亲缘关系
- 基于SSR分子标记构建盘锦大米DNA指纹图谱
- 2025年
- 建立了一种基于简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)标记技术和微芯片电泳技术鉴别方法,对辽宁省盘锦地区主要耕种的水稻进行检测,并建立盘锦大米DNA指纹图谱库,构建11个品种盘锦大米二维码和条形码。结果表明,48对引物在11个品种盘锦大米中共检测到438个等位基因,每对引物检测到的等位基因数平均为9个。筛选获得能完全区分11个品种盘锦大米的4对核心引物RM551、RM1195、RM1、RM7102,根据微芯片电泳检测的结果,构建了盘锦大米的DNA指纹图谱库。本项研究为盘锦大米品种质量真伪检测、水稻种子质量溯源评价和保护起到重要作用。
- 章沙沙
- 关键词:盘锦大米DNA指纹图谱微芯片电泳
- 雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异
- 2025年
- 【目的】探究不同种群雌性榧树Torreya grandis种实性状,基于简单重复序列标记(SSR)引物对榧树的种群遗传变异进行分析,比较榧树种群间、种群内种实表型、品质及遗传多样性的差异。【方法】以浙江富阳、嵊州、临安、建德及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过方差分析、主成分分析对榧树叶片及种实表型进行比较;以浙江富阳、嵊州、临安、淳安及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过SSR分子标记对榧树遗传多样性进行比较。【结果】榧树种实分析发现:叶质量、叶形指数、种实质量、种形指数、种核质量、核形指数、假种皮厚、种壳厚等8个指标在种群间和种群内个体差异极显著(P<0.01);脂肪相对含量及可溶性糖质量分数在种群间差异极显著(P<0.01),脂肪相对含量为29.36%~42.35%,榧树种实外观和种仁品质变异丰富。SSR引物分析发现:榧树种群的Nei’s遗传多样性指数(H)均值为0.400,Shannon’s信息指数(I)均值为0.650,多态性信息含量(P_(IC))均值为0.400。淳安种群的遗传多样性(H=0.410,I=0.658)最高,嵊州种群(H=0.369,I=0.565)最低。92%总遗传变异存在于种群内。【结论】榧树种实的表型、品质在种群间和种群内存在遗传变异,淳安种群遗传多样性最高,且种群内遗传变异大于种群间。
- 李柯豫陈荣刘琏蔡晓郡姜郑楚谢前丹俞晨良喻卫武
- 关键词:榧树不饱和脂肪酸可溶性糖SSR标记
- 基于SSR标记的白榆资源遗传多样性分析
- 2025年
- 为明确白榆种质资源的亲缘关系,了解种质的遗传基础,为资源保护和品种选育提供依据,采用SSR分子标记对河北省邓栅子林场白榆国家林木种质资源库中的83份白榆种质资源进行了遗传多样性与聚类分析。结果表明:(1)11对引物共扩增出59条多态性条带,多态性比率达98.33%。平均多态性信息含量(PIC)为0.6980。(2)平均等位基因数(Na)为1.9833,平均有效等位基因数(Ne)为1.3011,平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.2040,平均Shannon多样性指数(I)为0.3387,白榆种质资源在DNA水平上存在丰富的遗传变异。(3)群体间的遗传分化系数(Gst)为0.1238,白榆群体内部遗传变异显著高于群体间变异。遗传距离和遗传相似性分析发现,参试3个群体的亲缘关系较近,遗传背景相似。(4)83份白榆种质平均遗传距离为0.6201,经UPMGA聚类分析,可将白榆种质分为6个类群,聚类结果分析和主成分分析结果一致性较强。研究发现邓栅子林场来自不同地区的白榆种质资源遗传多样性较为丰富,亲缘关系较近。
- 王琦崔宏新武立东张子杰
- 关键词:SSR分子标记白榆种质资源
- 苹果属植物的SSR分子标记及其应用
- 本发明涉及植物育种技术领域,尤其涉及苹果属植物的SSR分子标记及其应用。所述分子标记包括:苹果第1‑17号染色体上共17个SSR标记位点。本发明从已发表的七个苹果属植物全基因组序列中筛选了17个多态性高、可靠性高、重复性...
- 董雷鸣王瑞珍贺然魏钰权键郭翎张辉刘东焕刘东燕陈春玲曹颖孙宜刘浡洋刘恒星
- 基于SSR标记的海南油茶DNA指纹图谱构建
- 2025年
- 为有效对海南油茶优良无性系品种进行鉴别,使之更有效、长期地应用于市场,推动海南油茶产业发展,本研究基于已开发的16对SSR引物对20个海南省林木品种审定委员会认定的油茶良种进行PCR扩增及指纹图谱构建,PCR产物经毛细管电泳得到等位基因分型峰图,显示引物SJMCoa003的多态性最为丰富,可以同时鉴定出4个油茶品种。由基因座信息做出的SSR指纹图谱显示除品种‘海林1号’、‘琼东2号’、‘琼东8号’、‘侯臣3号’、‘万海1号’无法由单一引物对扩增鉴别出外,其余品种均具有多个专一引物,这五个品种还可经由2~3个引物对联合鉴别即可区分。由基因座信息计算得出的遗传距离及相应进化树显示当遗传距离小于0.05时各个供试品种均可明显被区分出来。根据创建的指纹图谱和聚类树,20个油茶品种可被简单高效区分出来,这为油茶良种投入市场后的规范使用提供了理论支持。同时聚类结果还表明海南油茶品种遗传变异丰富,为油茶品种选育打下基础,SSR指纹图谱亦可为新品种鉴定提供支撑,推动海南油茶产业科学研究进一步发展。
- 赵欣宋家明张敬涛黄东益胡海燕吴文嫱刘进平赖杭桂
- 关键词:SSR标记指纹图谱
- 基于甘蔗及其近缘属参考基因组开发SSR标记及数据库
- 2025年
- 甘蔗(Saccharum spp. hybrid)是重要的糖料和能源作物。甘蔗基因组复杂,群体遗传学研究相对落后。目前,甘蔗参考基因组仍有待完善。利用甘蔗及其近缘属参考基因组开发甘蔗SSR标记及数据库有助于推动甘蔗群体遗传学的研究。本研究基于3个甘蔗种(割手密种、热带种和栽培种)和2个甘蔗近缘种(芒和高粱)的基因组进行SSR检测,统计各基因组SSR的数量和类型,挑选多态性好的SSR标记对104份甘蔗及近缘属种质材料进行遗传多样性分析。在5个物种的基因组中共鉴定到了1,860,645个SSR,以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复单元类型为主。基因组间SSR的共线性信息显示,甘蔗栽培种和其他物种间的亲缘关系由近到远为:R570、热带种、割手密种、芒、高粱;基于SSR及InDels标记的甘蔗种质资源的遗传多样性分析显示,斑茅92-105最先被单独划分,割手密种为一个类群,大茎野生种和热带种分为一个类群,栽培种为一个类群。最后,围绕5个基因组鉴定的SSR以及引物等相关信息,开发了一个基于Web界面的甘蔗SSR数据库。本研究为甘蔗研究和育种提供了重要的分子工具。
- 匡博文韦妳刘金典陈美燕毛兴洁段维兴杨细平
- 关键词:甘蔗SSR标记数据库
- 基于SSR标记的牡丹品种鉴定技术标准体系的构建
- 2025年
- 【目的】建立牡丹品种鉴定的简单重复序列(SSR)标记标准技术体系,筛选出多态性高、重复性好的牡丹SSR核心引物和参照品种,并确定品种差异判定标准,为牡丹品种的精准快速鉴定及新品种权审查提供技术支持。【方法】以9个野生牡丹种和5个具有代表性品种群、9种花型及11种花色的48个常见栽培品种为试验材料,通过收集引物信息、核对DNA序列信息、重新设计引物、分析位点多态性,筛选出SSR核心引物和参照品种,并对SSR位点组合的品种鉴别力进行分析与评价。【结果】在10个SSR位点中,9个野生种和48个品种共检测到84个等位基因。等位基因数为4~12个;多态性信息含量为0.572~0.837,均值为0.712。SSR位点组合的品种鉴别能力分析结果显示:当差异位点为1个时,至少需要5对引物才可完全区分48个品种;而当差异位点为2个时,至少需要8对引物才能完全区分48个品种。【结论】筛选出的17个参照品种和10个SSR位点在所有牡丹品种群中均表现出良好的鉴别能力。最终确定了以1个差异位点为鉴定标准的牡丹品种SSR标记技术体系。
- 张雨婷于雪丹郑勇奇郑勇奇张川红赵国栋李伟李丰钰
- 关键词:SSR标记分子身份证
- 杏与扁桃属间远缘杂交后代的SSR标记亲子鉴定
- 2025年
- 杏(Armeniaca vulgaris)与扁桃(Amygdalus communis)进行远缘杂交育种,开放式授粉获得的杂种纯度较低,为了提高育种效率,需要在苗期对杂交子代进行鉴定。以母本为龙王帽、父本不完全确定的3个疑似来源于杏与扁桃远缘杂交的子代个体为对象,选用了15个多态性和扩增效率较高的SSR(Simple Sequence Repeat)位点,通过荧光修饰引物结合毛细管电泳分型技术,对3个亲本和3个子代进行基因分型,并计算了等位基因频率、亲权指数和亲子关系概率(RCP)。结果发现,15个SSR位点在6份材料中共检测到78个等位基因,各位点的等位基因数介于4~7个之间。子代A1和B1与其疑似亲本间的累积RCP值均高于99.99%,并由此断定远缘杂交后代A1是来源于父本蒙特瑞(Monterey)扁桃,而辛普森(Thompson)是子代B1的真实父本。15个位点中子代B2均未出现其假定父本扁桃2号的等位基因,从而排除它们之间有亲缘关系。亲子鉴定结果与聚类分析显示的亲缘关系相符合。另外,通过分析SSR位点的数量与累积RCP值之间的关系发现,基于这些SSR位点对杏与扁桃远缘杂交后代进行亲子鉴定时,需要选用9个以上的位点。此方法可用来鉴定杏与扁桃属间远缘杂交后代的所有个体。
- 张俊环张美玲杨丽姜凤超王玉柱于文剑孙浩元
- 关键词:扁桃远缘杂交SSR标记亲子鉴定
相关作者
- 王凤格

- 作品数:145被引量:1,599H指数:26
- 供职机构:北京市农林科学院
- 研究主题:玉米 SSR SSR标记 玉米品种 中国玉米
- 赵久然

- 作品数:502被引量:6,598H指数:50
- 供职机构:北京市农林科学院玉米研究中心
- 研究主题:玉米 玉米品种 SSR 玉米自交系 选育
- 易红梅

- 作品数:75被引量:657H指数:16
- 供职机构:北京市农林科学院玉米研究中心
- 研究主题:玉米 SSR SSR标记 玉米品种 DNA指纹
- 邱丽娟

- 作品数:603被引量:3,662H指数:36
- 供职机构:中国农业科学院作物科学研究所
- 研究主题:大豆 分子标记 大豆胞囊线虫 抗性 SSR
- 李火根

- 作品数:125被引量:831H指数:17
- 供职机构:南京林业大学
- 研究主题:鹅掌楸 SSR 北美鹅掌楸 马尾松 杨树