冯钦
- 作品数:3 被引量:13H指数:3
- 供职机构:四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金四川省科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 应用多位点数目可变串联重复序列对四川地区结核分支杆菌的基因分型被引量:4
- 2012年
- 为了研究四川地区结核分枝杆菌的传播动态,选用12个VNTR位点对2009年1月至2009年12月间采集的结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型研究.结果表明,在80株结核分支杆菌临床分离株中,12个VNTR位点鉴定出7个簇和65单独基因型.HGI指数对12个VNTR位点等位基因多态性的评估表明,选用的12个VNTR位点在临床分离株中表现出高度多态性,它们的HGI值为0.503至0.799.根据此多态性,选取的VNTR 12个位点的组合应用可作为一线分型方法监测四川地区结核分枝杆菌的传播情况.
- 赵于丁冯钦罗涛杨志荣孙群
- 关键词:基因分型VNTR多态性结核分枝杆菌
- 四川地区利福平耐药结核分枝杆菌rpoB基因利福平耐药决定区突变分析被引量:4
- 2013年
- 本文对268株结核分枝杆菌临床分离株(包括213株利福平耐药株、55株利福平敏感株)rpoB基因RRDR区进行测序并比较分析.结果表明,在213株利福平耐药株中有200株(93.90%)在rpoB基因RRDR区发生了突变,在55株利福平敏感株中RRDR均未发生突变.突变频率最高的类型依次为:531位点(55.87%),526位点(16.43%),516位点(10.33%)和511位点(8.92%),以上四个位点的突变菌株数占所有利福平耐药株的91.55%.四川地区利福平耐药株中511位点突变频率高于全国其他地区.
- 汤科孙宏虎郑超冯钦郭建华张聪聪赵于丁孙群
- 关键词:结核分枝杆菌利福平RPOB基因突变
- 四川地区北京型结核分枝杆菌的MIRU-VNTR基因分型被引量:6
- 2014年
- 用寡核苷酸多态性基因分型(Spoligotyping)对2008年1月至2010年10月间采集的211株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型,然后对北京型结核分枝杆菌VNTR位点的多态性进行检测.选用的12个VNTR位点存在较高的基因多态性,该12位点组合分辨能力(HGI=0.99985)高于标准的VNTR-12位点组合(HGI=0.99546),其中多态性较高的7位点组合HGI指数为0.99977.因此,7位点组合可以作为四川地区北京家族分枝杆菌的一线分型方法.
- 冯钦景誉庆黄正辉段菁岳郑超孙宏虎钟晶孙群
- 关键词:结核分枝杆菌北京家族寡核苷酸数目可变串联重复序列