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2014年-2015年合肥地区不明原因肺炎病例流感病毒核酸检测结果分析被引量：5: 2016年; 目的监测流感病毒临床严重性的变化,了解合肥地区人感染禽流感病毒的状况,及时发现人感染H7N9禽流感病例。方法对合肥市各级医疗机构监测到的不明原因肺炎病例进行流行病学调查,并采集上、下呼吸道标本开展流感病毒核酸检测。结果 2014年4月1日-2015年3月31日,共采集到不明原因肺炎病例标本43例,检出流感病毒核酸阳性16份,阳性率37.21%。其中B型1份(2.32%)、H3型11份(25.58%)、H7型4份(9.30%)。4名H7N9患者均为男性,在发病前一周内均有活禽接触史。确诊流感病例均主要集中于2015年春季。结论合肥地区不明原因肺炎病例中存在流感病毒感染,不明原因肺炎病例监测高峰期与流感监测一致,不明原因肺炎监测丰富了流感监测内容,为流感防控提供了科学依据。; 汪秀琴张文艳金晶; 关键词：不明原因肺炎流感病毒

合肥市肾综合征出血热疫源地健康者隐性感染情况调查被引量：6: 2015年; 目的了解合肥市疫源地健康者肾综合征出血热（hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS）抗体水平和隐性感染的风险因素,为制定防治措施提供科学依据。方法采用多阶段抽样的方法采集246名≥3岁疫源地健康者血样,用酶联免疫吸附试验（enzyme linked immunosorbent assay,ELISA）检测HFRS的Ig G抗体。采用自行设计调查表问卷调查226名成人,其隐性感染的风险因素采用多因素Logistic回归分析。结果 246名健康者,抗体阳性率为13.01%,抗体几何平均滴度（geometric mean of antibody titer,GMT）为1∶25.20。年龄和地区间阳性率和GMT差异有统计学意义（均有P〈0.05）。性别和职业类型阳性率和GMT差异无统计学意义（均有P〉0.05）。多因素分析结果显示,近1月昆虫叮咬史（OR=4.70,95%CI：1.25-17.77）、40-59岁人群（OR=3.50,95%CI：1.02-11.95）、近1月鼠类接触史（OR=3.39,95%CI：1.44-8.02）、近1月食用鼠排泄物污染的食物（OR=2.90,95%CI：1.24-6.80）是其危险因素。结论本次研究为HFRS防控工作提供了基线资料和依据。灭鼠防鼠是防控HFRS的首选措施,加强健康教育,定期开展抗体水平检测,有助于HFRS疫情的及时判断。; 张磊仰凤桃尤恩情陆群金晶; 关键词：肾综合征出血热流行病学研究

2005-2008年合肥市流行性脑脊髓膜炎病例监测结果分析被引量：1: 2009年; 目的应用实验室免疫血清学方法监测合肥市流行性脑脊髓膜炎(流脑)患者感染状况以及易感人群免疫水平。方法采用回顾性诊断研究模式,采集合肥市辖区内医疗机构流脑监测病例急性期、恢复期双份血清,应用酶联免疫吸附试验分析患者流脑感染状况,通过急性期抗体浓度研究易感人群免疫水平。结果2005-2008年流脑流行季节流脑监测病例数186份,C群流脑病例检出率72.6%(135份)。易感人群急性期C群脑膜炎奈瑟菌(Nm)抗体浓度大于2μg/m l组监测病例数为29份,Nm抗体阳性病例1份,阳性率3.4%(1/29)。结论在合肥市流脑监测病例中流脑感染以C群Nm为主,易感人群急性期抗体浓度大于2μg/m l时有明显保护性。; 黄泓滟柯文鸿王晓萍靳玉惠岳峰金晶; 关键词：流行性脑脊髓膜炎免疫血清学

合肥市某小学急性呼吸道感染疫情的病原学分析被引量：3: 2018年; 目的分析合肥市某小学一起急性呼吸道感染疫情病原学,为疫情发生的生物学病因提供依据。方法采用实时荧光PCR方法(Real-time PCR)对采集的10份患者咽拭子标本进行流感病毒和腺病毒核酸筛查,检出的腺病毒核酸阳性标本经普通PCR扩增腺病毒六邻体基因片段以进行序列测定,测序结果在Genbank上进行Blast比较并作系统进化树分析,以确定其病毒型别。结果 10份咽拭子标本流感病毒核酸检测结果均为阴性,7份标本检出腺病毒核酸,进一步通过基因测序、序列比对、基因进化树分析确定为腺病毒3型。结论依据实验室检测结果并结合流行病学调查和临床症状,确认该起急性呼吸道感染疫情的病原体为人腺病毒3型。; 陈煚金晶周虎啸赵科伕汤仁树张文艳; 关键词：腺病毒急性呼吸道感染暴发疫情分子生物学

一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原学诊断及基因型分析被引量：2: 2023年; 目的了解合肥市某工地一起急性胃肠炎聚集性疫情的病原及其基因型。方法采用实时荧光PCR方法对16份肛拭子标本和7份水样标本进行诺如病毒、札如病毒和星状病毒核酸筛查,对诺如病毒核酸阳性标本采用RT-PCR扩增Rd Rp-VP1区基因,并进行基因序列测定,在线比对确定病毒基因亚型,运用MEGA软件构建基因进化树,进行基因比对和进化分析。结果 14份肛拭子和2份水样标本诺如病毒核酸阳性,札如病毒和星状病毒核酸均阴性,获得9条诺如病毒Rd Rp-VP1区基因序列,均为GⅡ. P17-GⅡ. 17型。结论这是一起因饮用水污染GⅡ. P17-GⅡ. 17型诺如病毒引发的急性胃肠炎暴发疫情。; 宋永庆金晶汤仁树朱引娣张文艳; 关键词：诺如病毒胃肠炎聚集性疫情病原学检测

合肥市2009～2011年流行性感冒监测报告被引量：7: 2011年; 目的研究合肥市2009～2011年流行性感冒（简称流感）流行状况及型别分布,并分析其流行趋势,为流感的防控提供科学依据。方法每周统计监测点流感样病例（ILI）数据,采集流感样病例鼻咽拭子标本,使用荧光PCR检测流感病毒核酸。结果 2009年9～12月流感活动达到高峰期,2010～2011年则表现为夏秋和冬季双峰分布。2009年6～8月份以季节性H1N1流感病毒占优势,2009年9～12月转变为甲型H1N1流感病毒占优势,2010年1～3月份又转变为乙型流感病毒占优势,2010年8～10月又变为季节性H3N2,至2011年1月份又再次转变成甲型H1N1流感占优势。2009～2011年两个监测周期中,ILI%分别为6.81%和2.16%;流感病毒核酸阳性率分别为51.34%和10.18%。结论 2009～2011年度合肥市出现流感流行高峰。季节性H3N2、H1N1流感病毒和甲型H1N1、乙型流感病毒均有流行。; 金晶张文艳李明汪秀琴胡中旺; 关键词：流感样病例流感病毒流感样病例

安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究被引量：11: 2019年; 诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是引起病毒性胃肠炎的重要病原体,本研究旨在对2015～2016年春季安徽部分地区暴发的急性胃肠炎(Acute gastroenteritis,AGE)疫情标本进行病原检测和分子分型,分析病原的基因特征。收集2015年3月至2016年5月9起AGE疫情流行病学信息和采集病例粪便、肛拭子样本。采用Real-time PCR检测NoVs核酸和RT-PCR扩增RdRp与VP1区基因序列,基因测序后应用BLAST比对和NoVs在线分型工具分析结果。7起疫情发生在中、小学校(77.78%,7/9),2起疫情发生在乡镇,发病人数中位数为6人,男女发病比例为1.41∶1,临床表现主要以恶心、呕吐/腹泻、腹痛为主。77份临床病例样本中检出66份NoVs核酸阳性,基因序列测定获得76条序列,39条序列为RdRp区GⅡ.P17基因型,37条序列为VP1区GⅡ.17基因型。基因进化树分析显示:2015～2016年安徽地区39条RdRp区NoVs GⅡ.P17基因型序列Cluster III进化簇III b分支,与2015年广东、海南、中国台湾地区参考毒株序列有较近的亲缘性关系,核苷酸同源性为99%～100%。37条VP1区NoVs GⅡ.17基因型序列都处在Cluster III进化簇上,其中28条序列属于III a进化分支,与山东2015年LX09株、2016年广东GZ2016-L492株、江苏zj019株、中国香港CUHK-NS-942株以及日本2015年AichiF101毒株序列有较近的亲缘性关系。新型GⅡ.P17-GⅡ.17基因型NoVs是引起2015年和2016年春季安徽部分地区AGE暴发的主要病原体,需加强病毒性胃肠炎流行病学调查与病原监测及分子分型鉴定工作。; 史永林葛盈露金晶刘敏鸿汪飞鹏陈晓龙张文艳孙永胡万富; 关键词：急性胃肠炎腹泻基因型分子进化

合肥市2014—2019年副溶血性弧菌临床分离株病原学特征及耐药研究被引量：1: 2021年; 目的了解2014—2019年合肥市副溶血性弧菌临床分离株所属的血清群、毒力基因和耐药特征,为副溶血性弧菌感染的预防和控制提供科学依据。方法采用玻片凝集法对107株副溶血性弧菌进行血清分群,Real-time PCR方法检测tlh、tdh和trh毒力基因,K-B琼脂纸片扩散法进行药敏试验。结果 107株副溶血性弧菌分属6个血清群,以O3群为主,占83.2%(89/107);其次为O4群,占13.1%(14/107)。tlh、tdh和trh毒力基因检出率分别为100%(107/107)、99.1%(106/107)和0(0/107)。107株副溶血性弧菌对氨苄西林和头孢唑啉的耐药率较高,分别达到84.1%(90/107)和82.2%(88/107)。对头孢西丁、头孢他啶和头孢吡肟耐药率为0.9%(1/107),对哌拉西林、诺氟沙星、左氧氟沙星、阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素、甲氧苄啶/磺胺异恶唑、四环素、氯霉素和呋喃妥因完全敏感。结论近几年来,合肥市副溶血性弧菌临床分离株以O3群为主,tdh毒力基因携带率非常高,已有菌株耐药情况存在,临床应规范用药。; 刘了了方正钱玉春金晶张文艳胡中旺; 关键词：副溶血性弧菌血清群毒力基因

2020-2021年安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型多样性分析被引量：4: 2022年; 目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本,荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组,采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别,利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性,占19%(23/142);119份为GII阳性,占81%(119/142)。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型,包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示:GI.1[P1]型安徽株与韩国株(MZ021974)、法国株(MK956173)同属一个进化分支;GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株(MN922742)、四川株(MW255366)、韩国株(MZ022026)进化距离较近;GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株(MN938461)、2021年广东株(OK562729)处于一个进化分支;GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇,与陕西株(MW243609)、日本株(LC646339)进化距离较近。结论安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性,有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。; 史永林傅荔艳金晶葛盈露王鹏程鹏张文艳孙永; 关键词：诺如病毒急性胃肠炎基因型进化特征

一起急性胃肠炎暴发疫情的病原分子特征分析被引量：1: 2021年; 目的了解合肥市一起急性胃肠炎疫情的病原分子特征。方法采用实时荧光PCR(Real-time PCR)对13份肛拭标本同时进行札如病毒、诺如病毒、星状病毒核酸检测,检出的札如病毒核酸阳性标本采用传统RT-PCR扩增VP1基因片段,并测定基因序列,构建系统进化树。结果 Real-time PCR检出8份札如病毒核酸PCR阳性标本,诺如病毒、星状病毒核酸结果均为阴性。1份RT-PCR扩增产物测序成功,基因序列比对和进化分析显示为札如病毒GⅡ.3基因亚型。结论引起该起急性胃肠炎疫情的病原体为GⅡ.3型札如病毒。; 金晶史永林张文艳汤仁树周伟刘玮朱引娣; 关键词：札如病毒急性胃肠炎进化分析

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金晶

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