史永林
- 作品数:70 被引量:478H指数:11
- 供职机构:安徽省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:安徽省自然科学基金国家科技重大专项中美新发和再发传染病合作项目更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 安徽省首起家庭聚集性人感染H7N9禽流感疫情的调查分析被引量:2
- 2017年
- 目的对安徽省发生的首起家庭聚集性人感染H7N9禽流感疫情进行现场调查分析,探讨感染来源和传播方式,为今后H7N9禽流感防控与疫情处置工作提供参考。方法应用现场流行病学方法对2例患者的发病就诊经过、可疑暴露史、流行病学关联及密切接触者进行调查;采集病人及相关活禽市场标本,开展流感病毒核酸检测。结果本次家庭聚集性疫情共发病2人,为母子关系;首发病例2月4日发病,发病前有明确的活禽市场暴露史;续发病例2月15日发病,发病前既有活禽市场暴露史,也有与首发病例的密切接触史;共采集相关环境标本38份,其中13份标本检出H7阳性,均来自当地自活禽市场。结论首发病例的感染来源可能为活禽市场暴露,续发病例的感染来源既可能是活禽市场暴露,也可能为人-人传播;在H7N9疫情调查处置中,应做好密接管理和个人防护工作。
- 侯赛张进史永林胡晓申程婧王军马婉婉俞俊岭龚磊吴家兵
- 关键词:聚集性
- 安徽省肾综合征出血热病人省外就医的相关因素分析被引量:1
- 2015年
- 目的分析安徽省肾综合征出血热病人省外就医的因素,为制定肾综合征出血热防治对策提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制系统收集2005—2013年安徽省肾综合征出血热省外就医的病人作为研究组,把转诊到省内医疗水平相当医院就医的年龄相近的肾综合征出血热病例作为对照组,并对研究组和对照组病人进行电话调查。结果181例研究组和101例对照组的年龄上差异无统计学意义(0=0.81,P=0.997);181例从安徽省转诊到省外医院就医的‘肾综合征出血热病人中,初诊到转至省外医院平均间隔时间为(47.19±7.68)h,经过电话回访得知,181例转诊病例全部治愈;肾综合征出血热病人省外就医的因素中因医院距离、交通便利以及家庭经济状况高等因素差异有统计学意义(均有P〈0.05)。结论肾综合征出血热病人治愈率可能与治疗时间早和治疗水平高因素相关;肾综合征出血热病人省外就医的因素中因医院距离近、交通便利以及家庭经济状况高等因素相关而与就医习惯和熟人介绍无相关性。
- 李青刘红史永林范引光王建军
- 关键词:肾综合征出血热统计学流行病学方法
- 安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究被引量:11
- 2019年
- 诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是引起病毒性胃肠炎的重要病原体,本研究旨在对2015~2016年春季安徽部分地区暴发的急性胃肠炎(Acute gastroenteritis,AGE)疫情标本进行病原检测和分子分型,分析病原的基因特征。收集2015年3月至2016年5月9起AGE疫情流行病学信息和采集病例粪便、肛拭子样本。采用Real-time PCR检测NoVs核酸和RT-PCR扩增RdRp与VP1区基因序列,基因测序后应用BLAST比对和NoVs在线分型工具分析结果。7起疫情发生在中、小学校(77.78%,7/9),2起疫情发生在乡镇,发病人数中位数为6人,男女发病比例为1.41∶1,临床表现主要以恶心、呕吐/腹泻、腹痛为主。77份临床病例样本中检出66份NoVs核酸阳性,基因序列测定获得76条序列,39条序列为RdRp区GⅡ.P17基因型,37条序列为VP1区GⅡ.17基因型。基因进化树分析显示:2015~2016年安徽地区39条RdRp区NoVs GⅡ.P17基因型序列Cluster III进化簇III b分支,与2015年广东、海南、中国台湾地区参考毒株序列有较近的亲缘性关系,核苷酸同源性为99%~100%。37条VP1区NoVs GⅡ.17基因型序列都处在Cluster III进化簇上,其中28条序列属于III a进化分支,与山东2015年LX09株、2016年广东GZ2016-L492株、江苏zj019株、中国香港CUHK-NS-942株以及日本2015年AichiF101毒株序列有较近的亲缘性关系。新型GⅡ.P17-GⅡ.17基因型NoVs是引起2015年和2016年春季安徽部分地区AGE暴发的主要病原体,需加强病毒性胃肠炎流行病学调查与病原监测及分子分型鉴定工作。
- 史永林葛盈露金晶刘敏鸿汪飞鹏陈晓龙张文艳孙永胡万富
- 关键词:急性胃肠炎腹泻基因型分子进化
- 安徽省早期甲型H1N1流感病毒的血凝素基因序列分析被引量:3
- 2010年
- 目的检测、分析安徽省甲型H1N1流感早期病例的病毒血凝素(HA)基因的序列特征。方法RT-PCR方法扩增我省早期流感样病例的病毒核酸并对其HA基因序列进行分析比对。结果我省早期甲型H1N1流感病例的病毒HA基因与2009年全球流行的甲型H1N1流感病毒高度同源,与古典型猪流感亲缘性较近,与欧洲和亚洲分离的A/H1N1猪流感和A/H1N1禽流感亲缘关系较远。结论我省早期流行的甲型H1N1流感毒株HA基因可能由古典型猪流感进化而来,与WHO选定的甲型H1N1疫苗候选株同源性较高,对于人季节性流感A/H1N1疫苗可能并不敏感。
- 何军孙永王俊史永林胡万富马明英刘丽萍
- 关键词:甲型H1N1流感病毒RT-PCR血凝素基因
- 安徽省不同地区人群和家畜Q热血清流行病学调查被引量:7
- 2010年
- 目的了解安徽省丘陵和淮北平原人群、家畜Q热感染状况和分布特点,为科学防治Q热提供依据。方法2009年4月~5月在安徽省广德、明光和怀远县采集农村人群血清613份,家畜血清150份,使用试剂盒,采用间接免疫荧光法(IFA)检测Q热病原体抗体,并进行不同地区、年龄、性别比较。结果613份人血清中,Q热阳性血清239份,阳性率53.67%,存在性别差异。家畜血清150份,Q热阳性血清92份,阳性率61.33%,存在地区差异。人群与家畜Q热血清阳性率正相关关系。结论安徽省部分农村地区人和家畜均有较高的Q热血清阳性率,存在由家畜传染给人的风险,需加强Q热的预防意识及诊断能力。
- 张永根史永林刘红曹明华胡万富王俊李荣民禹惠兰张丽娟
- 关键词:Q热血清流行病学农村
- 安徽省2017-2018年手足口病柯萨奇病毒A6型基因进化特征分析被引量:7
- 2021年
- 人肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)是引起手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体。近年来非EV-A71和非CV-A16的其他肠道病毒(Enterovirus,EV)已成为HFMD流行或暴发疫情的优势病原体。安徽省HFMD监测数据显示,2017-2018年HFMD样本非EV-A71和非CV-A16其他EV核酸阳性率超过50%,其中大部分为柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)。为了解安徽省2017-2018年HFMD其他肠道病毒构成和CV-A6基因进化特征,本研究收集2017-2018年HFMD咽拭子EV核酸阳性标本,采用人横纹肌肉瘤(RD)细胞进行病毒分离培养,对分离到的CV-A6毒株VP1全长序列基因扩增及核苷酸序列测定。从NCBI GenBank数据库下载CV-A6原型株和代表性毒株基因参考序列,运用生物软件MEGA 6.0构建VP1基因序列系统进化树,分析其基因遗传特征。结果显示,安徽省2017-2018年HFMD实验室确诊病例其他EV占66.1%,CV-A16占23.5%,EV-A71占10.4%。52株CV-A6毒株均为D3a基因亚型,其VP1区核苷酸序列间相似度为93.7%~100%,编码的氨基酸序列相似度为98.3%~100%;与CV-A6 Gdula原型株核苷酸相似度为78%~82.3%,氨基酸相似度为94.6%~96.3%。VP1区15个氨基酸位点有变异,氨基酸位点Q98L和G160S的变异发生率为100%。其他EV已成为安徽省引起HFMD流行的重要病原体,D3基因型CV-A6为优势流行毒株。持续加强其他EV的病原学监测与分析,对安徽省HFMD防控策略制定与疫情处置具有重要意义。
- 史永林葛盈露马婉婉陈芳陈国平孙永苏斌
- 关键词:D基因型进化分析
- 安徽省2010~2015年流感病原学监测分析被引量:10
- 2016年
- 目的了解安徽省流感病毒活动特征,为流感科学防控提供依据。方法对2010~2015年度安徽省流感监测哨点医院流感样病例标本病原学检测结果进行统计分析。结果2010—2015年度安徽省流感样病例阳性率依次为9.44%、12.83%、8.40%、14.95%和13.28%;总体呈现季H3型、新甲H1型和B型交替或共同流行的态势;每年冬春季高峰必然出现,多出现在1—3月;而夏季高峰隔年出现,多出现在7~9月;A型流感病毒在夏季和冬春季高发,而B型流感则只在冬春季高发。结论每年1~3月和7—9月是安徽省流感防控的重点时期。应进一步加强监测,研究本地区流感活动特点。
- 侯赛何军吴家兵龚磊胡万富史永林曹明华张进
- 关键词:流感流感病毒
- 柯萨奇B5型病毒安徽分离株的鉴定及VP1区基因特征分析被引量:2
- 2014年
- 目的了解手足口病相关病原CVB5病毒安徽分离株VP1基因遗传进化特征。方法用RD和Hep-2两种细胞对采集的手足口病临床病例咽拭子标本进行病毒分离,出现CPE后培养物上清,采用微量中和试验鉴定毒株血清型;抽提病毒RNA,用RT-PCR扩增VP1基因,对扩增产物进行基因序列测定,采用ClustalX2.0和Mega5.0生物软件对测序结果与国内外参考毒株进行基因亲缘性进化分析。结果 2株毒株微量中和试验鉴定为CVB5,基因测序显示VP1区核苷酸长度均为891bp,其核苷酸和氨基酸序列同源性均为100%;基因进化分析显示,安徽分离株与山东、河南和浙江分离毒株亲缘性较近,处于同一进化分支CladeⅠ,核苷酸同源性为92.56%-98.94%,氨基酸同源性为92.93%-100%;与国外参考株及CVB5的原型株(Faulkner/)比对,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.89%-83.84%和96.81%-98.59%。结论分离到的2株病毒均为肠道病毒CVB5,其VP1区基因和氨基酸序列变异较小,与国内流行参考株同源性高。
- 史永林张永根胡万富
- 关键词:手足口病VP1基因
- 寨卡病毒病原学及实验室诊断研究进展被引量:1
- 2016年
- 寨卡病毒(Zikavirus,ZIKV)自1947年在非洲被首次发现以来的半个多世纪,感染人类的病例只在非洲和亚洲(东南亚)呈散发性状态。然而2007年太平洋岛国密克罗尼西亚、2013~2014年法属波利尼西亚、2015~2016年南美洲智利和巴西分别出现了ZIKV感染暴发流行,
- 史永林胡万富苏斌
- 关键词:病原学小头畸形综合征新发传染病
- 安徽省首例人感染H5N6禽流感病例的调查与分析被引量:8
- 2018年
- 目的分析安徽省首例人感染H5N6禽流感病例发病与流行病学特征,为制定监测方案与防控措施提供科学依据。方法对人感染H5N6禽流感病例、密切接触者、感染来源进行流行病学调查,采集相关生物和环境标本进行实验室检测,应用描述性流行病学方法进行分析。结果安徽省首例人感染H5N6禽流感病例为单个散发病例,密切接触者无感染,早期临床表现无特异性,发病前一周有明确的病死禽接触史,病禽市场检出2份H5N6阳性标本。结论该病例为本地感染病例,感染来源与接触病死禽有关,未发现人传人的证据。
- 张进侯赛吴家兵史永林何军吴光健夏志才
- 关键词:流行病学调查