邵爱华
- 作品数：21 被引量：107H指数：7
- 供职机构：苏州科技学院化学与生物工程学院更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学医药卫生更多>>
- 暗纹东方鲀线粒体基因组核苷酸全序列测定与分析被引量：4
- 2010年
- 以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝的线粒体DNA为模板,参照红鳍东方鲀(T.rubripes)等近源鱼类的线粒体基因组DNA序列,设计合成14对特异引物,进行PCR扩增并测序,首次获得了暗纹东方鲀线粒体基因组全序列。结果表明,暗纹东方鲀线粒体基因组序列全长16 444 bp(GenBank登录号为GQ409967),A+T含量为55.8%,其mtDNA结构与其他脊椎动物相似,由22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因和1段819 bp非编码的控制区(D-loop)所组成。蛋白质基因除COⅠ和ND6的起始密码子为GTG、CCT以外,均为典型的起始密码子ATG。ND1、ATPase8、COⅢ、ND4L、ND5、Cyt b使用典型的终止密码子TAA,其他的使用不完全终止密码子。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer、tRNAGlu、tRNAPro在L-链上编码之外,其余基因均在H-链编码。基因排列顺序与已测定的鲀类一致,这显示了鲀类线粒体基因排列顺序上的保守性。tRNA基因核苷酸长度为64～73nt,预测了22个tRNA基因的二级结构,均呈较为典型的三叶草状。基于19种鲀类mtDNA全序列构建的进化树表明,暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、中华东方鲀(T.chinensis)聚成一个姊妹群。结果还支持东方鲀属鱼类为一单系类群。
- 邵爱华杜建陈葵盛烨郑峰丰史全良沈卫德朱江
- 关键词：暗纹东方鲀线粒体基因组全序列分析
- 暗纹东方鲀CD8α全长cDNA的克隆及序列分析被引量：2
- 2009年
- 根据红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)的CD8α序列设计引物,用RACE技术克隆并测定了暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)CD8α全长cDNA序列,经序列比对两者同源性为97%。序列分析显示657 nt的开放读码框编码218个氨基酸残基的跨膜糖蛋白的前体蛋白,蛋白结构预测包括信号肽区、免疫球蛋白样结构域区、茎区、跨膜区和胞浆区。对其中胞外的免疫球蛋白样结构域区和茎区进行了原核表达,表达产物为22 ku左右的重组蛋白。
- 杜建邵爱华朱江
- 关键词：暗纹东方鲀CD8
- 暗纹东方鲀线粒体ATPase8和ATPase6基因的克隆与序列分析被引量：5
- 2010年
- 克隆并测定了暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)线粒体ATP合酶Fo亚基8(ATPase8)和亚基6(ATPase6)的序列,并对其进行了初步分析。结果表明:PCR扩增产物的总长度为923 bp,其中842 bp为ATP8和ATP6基因的编码区。ATP8基因长168 bp,编码55个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为6.8 KD,等电点为7.85;ATP6基因长684 bp,编码227个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为24.9 KD,等电点为9.16。暗纹东方鲀ATP合酶Fo亚基8和亚基6与其他已报道的部分东方鲀属鱼类具有很高的同源性。通过探讨ATP合酶Fo亚基所含的信息量,发现相对于其他线粒体基因,ATPase8和ATPase6基因所含鉴别信息较少。
- 邵爱华杜建陈葵朱江
- 关键词：暗纹东方鲀线粒体DNAATP合酶亚基
- 暗纹东方鲀线粒体若干tRNA基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2006年
- 利用分离纯化的暗纹东方鲀肝脏mtDNA为模板,按照红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)mtDNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,首次克隆并测定了暗纹东方鲀mtDNA的Cytb、COI、COII、COIII、D-loop等5个重要基因及其侧翼的8个tRNA基因。上述基因均已在GenBank登录。8个tRNA基因含有69～72个碱基。推定了各个tRNA的二级结构并进行了初步的序列分析。结果表明:8个tRNA基因具有较为典型的三叶草型结构,各臂的碱基配对率大多数较高,稳定性较好。
- 邵爱华叶亚新王金虎朱江
- 关键词：暗纹东方鲀
- 暗纹东方鲀线粒体12S rRNA基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2008年
- 利用提取纯化的暗纹东方鲀肝脏的mtDNA为模板,按照红鳍东方鲀mtDNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,首次克隆并测定了暗纹东方鲀mtDNA的12S rRNA基因。同时运用DNA分析软件,对暗纹东方鲀与GenBank中选取的几种同目鱼类的相应序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的12S rRNA基因具有较高的同源性。利用分子生物学相关软件,对暗纹东方鲀及与其同目的5种鱼的12S rRNA基因序列建立NJ和MP分子进化树,并与传统的分类地位进行比较,结果表明与传统的分类地位基本吻合。
- 邵爱华朱江史全良陈葵刘冬娇
- 关键词：暗纹东方纯线粒体12SRRNA分子系统学
- 暗纹东方鲀线粒体ND1及其侧翼tRNA基因的克隆及序列分析被引量：6
- 2007年
- 利用提取纯化的暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的mtDNA为模板,按红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)mtDNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,首次克隆并测定了暗纹东方鲀mtDNA的ND1亚基及其侧翼的tRNA基因。运用DNA分析软件,对暗纹东方鲀与GenBank中选取的几种同目的鱼类的相应序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的各个相应基因具有较高的同源性。利用分子生物学相关软件,对暗纹东方鲀及与其同目的6种鱼的ND1基因序列建立NJ和MP分子进化树,并与传统的分类地位进行比较,结果表明与传统的分类地位基本吻合。3个tRNA基因含有69～71个碱基,推定了各个tRNA的二级结构,均具有较为典型的三叶草型结构。
- 邵爱华薛峰陈葵朱江
- 关键词：暗纹东方纯系统学
- 暗纹东方鲀线粒体COⅡ及两侧tRNA基因的克隆和序列分析被引量：21
- 2005年
- 用细胞色素氧化酶第二亚基基因(COⅡ)特异性引物对暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)的线粒体DNA(mtDNA)进行PCR扩增,克隆并测定了COⅡ及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,COⅡ基因691 bp和5'端上游的tRNAAsn基因及3'端下游的tRNALys基因序列共890 bp.用DNA分析软件比较暗纹东方鲀与GenBank中9个目11种鱼类的COⅡ序列,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COⅡ基因具有较高的同源性;其中与同属红鳍东方鲀(T.rubripes)的同源性最高为99.0%.暗纹东方鲀COⅡ基因的核苷酸组成中,A+T含量为56%,与其他11种鱼类的A+T含量(55%～62%)相近.鱼类COⅡ序列组成对A+T核苷酸的偏倚程度比较低.根据暗纹东方鲀与其他11种鱼的COⅡ基因序列同源性所建立的分子进化树,与传统的分类地位基本吻合.推定的tRNA二级结构为典型的三叶草型结构.
- 邵爱华朱江陈葵史全良李新平沈颂东
- 关键词：暗纹东方鲀线粒体DNA系统学
- 暗纹东方鲀线粒体DNA16S rRNA基因克隆、测序与在分子系统发育分析中的应用被引量：9
- 2009年
- 以暗纹东方鲀（Takifugu fasciatus）肝脏线粒体DNA为模板，按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增，获得了暗纹东方鲀线粒体DNA 16S rRNA基因（1667bp）及3′端上游的tRNALeu基因（73bp）的全序列。16S rRNA碱基组成分别为：胸腺嘧啶（T）22．1％，胞嘧啶（C）23．6％，腺瞟呤（A）35．2％，鸟嘌呤（G）19．0％。运用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中鲀形目其他23种鱼类的mtDNA 16S rRNA序列进行核苷酸同源性比较分析，分别在鲀形目和东方鲀属水平上利用多种鱼类DNA 16S rRNA序列构建分子系统树。结果显示，同目不同科间的16S rRNA序列核苷酸相似性在73．6％～87．4％之间，同属间的核苷酸相似性高达约99．0％。在属间、科级、亚目级水平上，利用较长的16S rRNA序列构建的NJ树和MP树在拓扑图总体趋势相似，各枝的支持率较高。而在东方鲀属内中选取同源性较高的16S rRNA部分序列构建分子系统树拓扑结构虽一致，但各枝的支持率不太高。因此认为，16S rRNA基因较适合于研究鲀形目鱼类中属间、不同种间以及分化较早的种间、科级、亚目级的系统发育分析。本研究结果有助于进一步利用线粒体基因研究分析鲀形目鱼类系统进化关系。
- 邵爱华杜建陈葵朱江
- 关键词：暗纹东方鲀线粒体DNARRNA基因系统发育分析
- 暗纹东方鲀线粒体细胞色素b及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析被引量：14
- 2005年
- 以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方豚(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定线粒体细胞色素b(Cyt b)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆的暗纹东方Cyt b基因(1 137 bp)及其5′端上游的tRNAGlu基因和3′端下游的tRNAThr基因序列共1 327 bp。用DNA分析软件对暗纹东方与GenBank中10个目13种鱼类的Cyt b序列进行比较分析,显示暗纹东方与这些鱼类的Cyt b基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方的同源性最高,为96.1%;与同目不同科的矛尾翻车(Masturus lanceolatus)和翻车(Mola mola)的同源性分别为74.1%和74.8%。tRNAGlu基因由69个碱基组成,tRNAThr基因由72个碱基组成,与红鳍东方相应tRNA的碱基组成完全相同。推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构,各臂的碱基配对率高,稳定性好。根据暗纹东方与其他13种鱼的Cyt b基因序列同源性所建立的进化树比较,结果与传统的分类地位基本吻合。
- 邵爱华朱江陈葵史全良
- 关键词：暗纹东方纯细胞色素B系统学
- ISO14001在创建“绿色大学”中的运用被引量：6
- 2005年
- 本文通过借鉴ISO14001环境管理体系,对创建"绿色大学"的管理体系和实施步骤进行了探析.
- 周溢邵爱华
- 关键词：ISO14001环境管理体系
