李湘龙
- 作品数:2 被引量:18H指数:2
- 供职机构:浙江省农业科学院更多>>
- 发文基金:转基因生物新品种培育专项中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 稻瘟菌效应因子的筛选、克隆及其功能研究
- 背景与目的:稻瘟菌效应因子(Effector protein,EP)由于其在致病过程中扮演着重要角色而越来越受到广大植病学者的重视。对于EP的研究能够揭示稻瘟菌和水稻之间的分子互作机理,为防治稻瘟病乃至彻底解决这一病害问...
- 李湘龙
- 关键词:稻瘟菌全基因组高通量测序
- 第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析被引量:15
- 2012年
- 稻瘟菌为了实现对水稻的有效侵染,在侵染水稻时可能通过表达和转运一定数量的效应蛋白进入到水稻细胞,抑制和干扰水稻的先天免疫机制。文章利用Solexa第二代测序技术,通过开展水稻和稻瘟菌互作早期转录组的测定和分析,克隆和鉴定在互作早期表达的稻瘟菌效应蛋白基因。利用序列同源比对,我们从总计约12.5 M条序列标签中,分离和鉴定了338 942条来源于稻瘟菌的序列,并最终定位到779个稻瘟菌预测基因。其中108个基因很可能参与了水稻和稻瘟菌互作过程,42个基因为预测的分泌蛋白基因。通过RT-PCR分析,最终确认了42个预测分泌蛋白基因中有12个基因在侵染水稻早期有显著的表达,而其中有4个基因表现为侵染早期特异表达。文章尝试利用第二代测序技术实现稻瘟菌侵染早期特异表达基因,尤其是分泌蛋白基因的快速克隆和鉴定,为稻瘟菌效应蛋白基因的克隆和功能鉴定提供了较为有意义的探索。
- 李湘龙柏斌吴俊邓启云周波
- 关键词:分泌蛋白稻瘟菌