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DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率的影响(英文)被引量：1: 2014年; PCR是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。传统的PCR引物设计软件基本上忽略了DNA聚合酶与引物/模板的亲和性对PCR效率的影响。为揭示DNA聚合酶与引物/模板的相互作用是否对PCR的效率有影响,通过构建Taq DNA聚合酶与不同序列引物/模板DNA相互作用的三维结构模型,采用MM/GBSA方法计算复合物的结合自由能,以结合自由能为参数,为人血清白蛋白基因(Human Serum Albumin gene,HSA gene)和结核杆菌pyrF基因(Mycobacterium tuberculosis pyrF gene)设计了PCR引物。PCR实验结果表明,引物的PCR效率与结合自由能相关:引物与聚合酶的结合自由能越低,PCR实验的效率相对越高。这说明DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率有重要影响。因此,引物/模板DNA与聚合酶的结合自由能可以作为PCR引物设计的新参数。; 杨奇奇张俊威朱坚刘建平黄强; 关键词：PCR DNA聚合酶引物设计

DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率的影响: 聚合酶链式反应(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法，它的发现和发展对生物学领域具有深远的意义。PCR反应中至关重要的部分是引物设计，引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。传统的PCR引物设计方法仅仅考...; 杨奇奇; 关键词：DNA聚合酶基因重组引物设计

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杨奇奇