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朱坚

作品数:1 被引量:1H指数:1
供职机构:上海美迪西生物医药有限公司更多>>
发文基金:上海市教育委员会重点学科基金上海市自然科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇引物
  • 1篇引物设计
  • 1篇英文
  • 1篇相互作用
  • 1篇聚合酶
  • 1篇合酶
  • 1篇PCR
  • 1篇DNA聚合酶

机构

  • 1篇复旦大学
  • 1篇上海美迪西生...

作者

  • 1篇黄强
  • 1篇张俊威
  • 1篇刘建平
  • 1篇朱坚
  • 1篇杨奇奇

传媒

  • 1篇中国生物工程...

年份

  • 1篇2014
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率的影响(英文)被引量:1
2014年
PCR是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。传统的PCR引物设计软件基本上忽略了DNA聚合酶与引物/模板的亲和性对PCR效率的影响。为揭示DNA聚合酶与引物/模板的相互作用是否对PCR的效率有影响,通过构建Taq DNA聚合酶与不同序列引物/模板DNA相互作用的三维结构模型,采用MM/GBSA方法计算复合物的结合自由能,以结合自由能为参数,为人血清白蛋白基因(Human Serum Albumin gene,HSA gene)和结核杆菌pyrF基因(Mycobacterium tuberculosis pyrF gene)设计了PCR引物。PCR实验结果表明,引物的PCR效率与结合自由能相关:引物与聚合酶的结合自由能越低,PCR实验的效率相对越高。这说明DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率有重要影响。因此,引物/模板DNA与聚合酶的结合自由能可以作为PCR引物设计的新参数。
杨奇奇张俊威朱坚刘建平黄强
关键词:PCRDNA聚合酶引物设计
共1页<1>
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