2024年12月28日
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杨润涛
作品数:
20
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供职机构:
山东大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
轻工技术与工程
生物学
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合作作者
张承进
山东大学
张丽娜
山东大学
宋勇
山东大学
吴峰
山东大学
高瑞
山东大学
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2017
1篇
2016
1篇
2015
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一种蛋白质糖化位点鉴定方法
本申请提供了一种蛋白质糖化位点鉴定方法,收集糖化位点训练数据集,从所述糖化位点训练数据集中提取肽链,利用肽链数字矢量、肽链中氨基酸的可及表面积、肽链中氨基酸的二级结构概率和肽链的灰色关联度来编码表征蛋白质,选用最大相关性...
杨润涛
陈金桂
张承进
张丽娜
宋勇
文献传递
一种蛋白质糖化位点鉴定方法
本申请提供了一种蛋白质糖化位点鉴定方法,收集糖化位点训练数据集,从所述糖化位点训练数据集中提取肽链,利用肽链数字矢量、肽链中氨基酸的可及表面积、肽链中氨基酸的二级结构概率和肽链的灰色关联度来编码表征蛋白质,选用最大相关性...
杨润涛
陈金桂
张承进
张丽娜
宋勇
一种蛋白质糖化位点鉴定方法
本申请提供了一种蛋白质糖化位点鉴定方法,包括:收集蛋白质糖化位点数据,从所述蛋白质糖化位点数据中提取肽链获得肽链样本集,所述肽链以赖氨酸为中心;分别采用单热向量编码所述肽链的每个氨基酸,获得使用单热向量表示的肽链训练集;...
杨润涛
陈金桂
张承进
张丽娜
宋勇
基于分布式估计算法的深度神经网络参数优化方法及系统
本发明公开了一种基于分布式估计算法的深度神经网络参数优化方法及系统,包括:初始化种群,将种群中每一个个体解码为深度神经网络;对上述深度神经网络的分类能力进行评价;对种群中的个体优劣进行排序;随机产生掩码向量,根据掩码向量...
许庆阳
刘安邦
张承进
宋勇
张立
袁宪锋
杨润涛
文献传递
用于识别细胞外基质蛋白的集成学习方法
本发明公开了用于识别细胞外基质蛋白的集成学习方法,数据集建立:建立细胞外基质ECM蛋白序列的训练样本集和独立测试样本集;将训练样本集中的蛋白质序列映射成数值特征向量;采用信息增益率—增量特征选择方法挑选出相对有效的特征子...
张承进
杨润涛
高瑞
张丽娜
文献传递
基于自然语言处理的丙二酰化位点预测方法及系统
本公开属于生物信息技术领域,提供了一种基于自然语言处理的丙二酰化位点预测方法及系统,包括以下步骤:获取基准数据集;对基准数据集进行平衡处理;将基准数据集分割为多个氨基酸单位,采用Word2vec中的Skip‑gram方法...
杨润涛
孙宁
张丽娜
基于词向量与卷积神经网络的DNA复制起始区域识别方法
本申请提供的基于词向量与卷积神经网络的DNA复制起始区域识别方法中,首先通过连续三分序列分词将DNA序列进行分词,得到各个三联核苷酸,然后将分词后的三联核苷酸负采样后通过Word2vec迭代训将三联核苷酸进行向量化得到词...
杨润涛
吴峰
张承进
陈金桂
张丽娜
群机器人觅食中基于动态响应阈值的自组织任务分配方法
本发明公开了群机器人觅食中基于动态响应阈值的自组织任务分配方法,包括:在觅食任务开始时,所有机器人都聚集在巢穴中处于等待状态,当等待时间超过给定时间后,使用动态响应阈值模型计算觅食概率,基于觅食概率,机器人决定是否开始觅...
张承进
庞豹
宋勇
王洪玲
杨润涛
文献传递
分子生物学系统建模及蛋白质功能预测相关问题研究
生命科学是研究生命活动规律、生命本质、生命发育规律,以及各种生物之间和生物与环境之间相互关系的科学。进入21世纪后,生命科学蓬勃发展,取得了重大突破。生命科学的广阔应用前景备受瞩目,其不仅有助于揭示生命活动的基本规律,而...
杨润涛
关键词:
蛋白质
遗传密码
DNA计算
酿酒酵母DNA复制起始区域识别方法
本申请提供了一种酿酒酵母DNA复制起始区域识别方法,包括:从酿酒酵母基因序列数据库中选取DNA样本;利用大小为3的滑动窗口以等距步长在DNA样本上进行滑动,得到核苷酸三联体集合;计算每个核苷酸三联体在核苷酸三联体集合中的...
杨润涛
吴峰
张承进
陈金桂
张丽娜
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