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珙桐实时定量PCR内参基因的筛选及稳定性评价被引量：25: 2016年; 实时荧光定量PCR(qPCR)技术被广泛应用于基因表达分析,选用合适的内参基因是运用该技术准确分析目标基因表达变化的前提。本研究以珙桐不同器官为材料,采用qPCR技术分析了珙桐中6个管家基因(ACT7、eIF、EF1a、GAPDH、β-TUB、18S rRNA)及2个新内参基因(CAC、TIP41),共8个候选内参基因的表达情况,并利用ge Norm、Norm Finder和BestKeeper3种软件对候选内参基因的表达稳定性进行了评价。结果表明,CAC和ACT7在珙桐营养器官与生殖器官中均表达稳定,且新内参基因CAC的表达稳定性优于ACT7;GAPDH、EF1a、18S rRNA和TIP41在珙桐营养器官与生殖器官中均表达不稳定,尤其是GAPDH和18S rRNA的表达稳定性更差;β-TUB在珙桐营养器官中表达更稳定,而eIF在珙桐生殖器官中表达更稳定。; 任锐戴鹏辉李萌刘志明曹福祥; 关键词：实时定量PCR 内参基因

绣球花品种遗传多样性的ISSR分析及指纹图谱构建被引量：12: 2016年; 利用ISSR-PCR分子标记技术对23个绣球花品种进行遗传多样性研究,从100条引物中筛选出10条引物对供试材料基因组总DNA进行PCR扩增,共扩增出条带123条,其中多态性条带102条,占82.93%,具有较高的多态性。经Pop Gen32软件包分析,23个绣球花品种的平均有效等位基因数为1.493 7,平均Nei’s基因多样性指数为0.290 7,平均Shannon信息指数为0.435 7,遗传距离介于0~0.769 1之间,遗传一致度介于0.463 4~1.000 0之间,具有广泛的遗传多样性,梦幻蓝和史欧尼10条引物的扩增结果一致,二者可能为同一个品种。UPGMA聚类将23个品种分成2类,聚类结果与叶片特征一致。引物UBC855可以将23个绣球花品种完全区分,依此建立了23个绣球花品种的指纹图谱。研究结果为绣球花分类,品种鉴定、分子育种和子代鉴定提供了重要的依据。; 彭继庆曹福祥曹基武董旭杰刘志明任锐熊亚丽张鹏鸿; 关键词：绣球花 ISSR 指纹图谱

珙桐MYB转录因子DiMYB1基因的克隆及表达分析被引量：11: 2016年; 根据珙桐转录组测序结果,筛选到一个与原花青素合成相关的基因,通过克隆该基因片段并进行序列分析确定该基因编码一个珙桐MYB转录因子,将其命名为DiMYB1(GenBank登录号KR996175)。该基因开放阅读框全长为924 bp,编码产物包含307个氨基酸。对其编码产物的基本理化性质、亲水性和疏水性、保守结构域、亚细胞定位等方面进行了生物信息学分析和预测。对DiMYB1基因编码产物的氨基酸序列进行聚类分析表明,其与拟南芥MYB123转录因子的同源性最高。应用qRT-PCR分析该基因的表达模式发现,DiMYB1基因在珙桐紫色幼叶中的表达量最高,其次是雄蕊,在芽、茎、成熟叶片、苞片、果肉和种子中只有微量表达。另外,DiMYB1基因的表达量在珙桐败育种子中显著高于正常种子,且在中期败育种子中表达量达到最高。构建原核表达载体pET-28a(+)-DiMYB1,并在大肠杆菌BL21(DE3)中获得高效表达。本研究通过对DiMYB1基因进行克隆与表达分析,为探索该基因在珙桐逆境胁迫、花青素合成和种子发育过程中的调控功能奠定基础。; 戴鹏辉任锐曹福祥刘志明李萌; 关键词：MYB转录因子逆境胁迫

珙桐CAC基因的克隆及其作为内参基因的评价被引量：3: 2017年; 从珙桐(Davidia involucrata Baill.)中克隆到一个编码网格蛋白衔接蛋白复合物(Clathrin adaptor complexes,CAC)的基因,命名为DiCAC(Gen Bank登录号为KX268525)。该基因开放阅读框全长1 317 bp,编码438个氨基酸。同源序列比对与聚类分析表明,该基因与其它15种植物的CAC氨基酸序列的相似度达到94%以上,其中与葡萄CAC的氨基酸序列同源性最高。为评价该基因作为珙桐内参基因的可行性,结合5个珙桐管家基因(ACT7、EF1a、GAPDH、β-TUB、18S rRNA),采用半定量PCR和实时荧光定量PCR对DiCAC基因在珙桐不同组织以及不同发育阶段苞片中的表达稳定性进行分析,并与常见管家基因的稳定性进行比较,结果表明,该基因在珙桐不同组织以及不同发育阶段苞片中均为稳定表达,且表达稳定性优于常见管家基因,可以作为相关基因表达研究中的内参基因。首次克隆到珙桐CAC基因,并且明确了其作为内参基因的可行性,为深入研究珙桐相关基因的表达分析提供了候选内参基因资源。; 任锐戴鹏辉曹福祥董旭杰李萌; 关键词：内参基因苞片

珙桐转录因子DiMYB1基因的生物信息学分析被引量：2: 2017年; 利用生物信息学方法对前期通过转录组测序获得的珙桐DiMYB1基因编码蛋白序列进行分析,为后续DiMYB1基因的功能鉴定和调控研究奠定基础。结果表明:DiMYB1蛋白全长924bp,编码307个氨基酸,相对分子量为35kDa,为亲水性蛋白。DiMYB1属于R2R3-MYB蛋白家族,含有1个信号肽结构和2个功能结构域,亚细胞定位预测该基因位于细胞核的可能性是91.3%。系统进化树分析表明,其与柿树MYB2转录因子的同源性最高,相似度为84%。; 戴鹏辉任锐董旭杰李萌曹福祥; 关键词：生物信息学

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任锐