马翔
- 作品数：10 被引量：16H指数：3
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- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 靶向Wnt1的miRNA与circRNA及其靶基因间相互作用的生物信息学分析被引量：6
- 2016年
- 为对靶向Wnt1的7种mi RNAs进行circ RNAs及其靶基因的预测,同时分析其与circ RNAs及靶基因间的相互作用,分别采用Starbase及mi RWALK软件,对文献报道的靶向Wnt1基因的let-7e、mi R-21、mi R-34a、mi R-122、mi R-148a、mi R-148b与mi R-152等7种mi RNAs的circ RNAs和对应的靶基因进行生物信息学预测.利用Cytoscape 3.2.1对这7种mi RNAs和预测所得到的circ RNAs及对应的靶基因进行网络分析.并进一步对预测到的靶基因通过DAVID软件进行通路分析.Starbase软件对这7种不同mi RNAs所预测的靶circ RNAs的数量分别为58、15、41、20、28、28、28个.分别比较mi RWALK中7～9个以上软件共有的mi RNAs及其与靶基因的关系,发现CHD7基因是唯一一个在三种不同预测范围内与mi R-21、mi R-148a、mi R-148b和mi R-152等4种mi RNAs相对应的靶基因.CNOT6、NBEA、ZFYVE26与ZDHHC17是在两种不同预测范围内与至少4个mi RNAs相对应的靶基因.在7种mi RNAs所预测靶基因相关的KEGG信号通路中,7～9个软件以上共有的信号通路为Focal adhesion信号通路、MAPK信号通路、Notch信号通路与TGF-beta信号通路.在MAPK信号通路中DUSP1与MRPS35_hsa_circ_001042均分别是与mi R-21、mi R-148a、mi R-148b及mi R-152等4种mi RNAs相互作用的靶基因与circ RNA.本研究对靶向Wnt1的mi RNAs及其相互作用的circ RNAs、靶基因与信号通路等进行了网络分析与预测,为进一步分析它们之间的相互作用奠定了基础.
- 张遥任秀智王延宙马翔左清利韩金祥鲁艳芹
- 关键词：WNT1MIRNARNA
- 全文增补中
- 4例软骨发育不全患者FGFR3基因突变检测被引量：2
- 2018年
- 目的对4例临床诊断为软骨发育不全(ACH)患者进行成纤维细胞因子受体3(FGFR3)基因突变检测。方法提取4例患者及父母外周血DNA,设计FGFR3基因外显子10的引物序列,应用聚合酶链反应(PCR)扩增,并对扩增产物进行测序,通过Mutation Survey软件分析突变位点。结果 4例ACH患者均存在FGFR3基因第10外显子1138位点G>A碱基转换,导致FGFR3的第380位氨基酸由甘氨酸(Gly)变为精氨酸(Arg)。结论 FGFR3基因10号外显子c.1138G>A的杂合突变是造成ACH的主要致病原因,FGFR3基因突变检测为产前基因诊断提供了实验依据。
- 尹小丽尹小丽鲁艳芹张遥张遥马翔
- 关键词：软骨发育不全基因突变
- 成骨不全差异性miRNA与之相互作用的非编码RNA和靶基因分析
- 环状RNA(circularRNA,circRNA)是广泛存在于各种生物细胞中一类区别于传统线性RNA的新型形式,富集在胞浆中具有牢固的环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分环状RNA是由外显子构成,具有良好的物种保守...
- 马翔
- 关键词：成骨不全MIRNAS靶基因生物信息学预测
- 文献传递
- 成骨不全circRNAs研究进展
- 环状RNA(circularRNA,circRNA)是广泛存在于各种生物细胞中一类区别于传统线性RNA的新型形式,富集在胞浆中具有牢固的环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分环状RNA是由外显子构成,具有良好的物种保守...
- 马翔任秀智张遥鲁艳芹韩金祥
- 关键词：MIRNA成骨不全诊断标记物
- 文献传递
- 检测人COMP基因突变的引物组及其试剂盒
- 本发明涉及检测人COMP基因突变的引物组及其试剂盒，包括：上述用于检测COMP基因突变的由第1至第19外显子的PCR扩增引物组成的引物组；PCR扩增试剂；PCR产物纯化试剂；含有上述用于检测COMP基因突变的测序引物组的...
- 鲁艳芹韩金祥李公超尹小丽代运章张遥马翔
- 文献传递
- 检测人FGFR3基因突变的引物组及其试剂盒
- 本发明涉及检测人FGFR3基因突变的引物组及其试剂盒，包括：用于检测FGFR3基因突变的由第2至第7外显子以及第9至第19外显子的PCR扩增引物组成的引物组；PCR扩增试剂；PCR产物纯化试剂；含有用于检测FGFR3基因...
- 韩金祥鲁艳芹王士富代运章尹小丽张遥马翔
- 文献传递
- 成骨不全环状RNA生物信息学预测
- 目的 对成骨不全血清中差异表达的miR-21、miR-26a、 miR-29a、 miR-29b、miR-30e、miR-34c、miR-133a、miR-145、miR-210、miR-489与miR-1297等共11...
- 马翔鲁艳芹王延宙刘军龙张遥左清利任秀智韩金祥
- 关键词：成骨不全MIRNA靶基因信号通路生物信息学预测
- 成骨不全环状RNA生物信息学分析被引量：5
- 2017年
- 目的对成骨不全血清中差异表达的miR-21、miR-26a、miR-29a、miR-29b、miR-30e、miR-34c、miR-133a、miR-145、miR-210、miR-489与miR-1297等共11种miRNAs进行circRNAs及其靶基因的预测,同时分析其与circRNAs及靶基因间的相互作用。方法采用starbase软件对11种差异性表达miRNAs相关circRNAs进行预测,将得到的miRNA-circRNA进行频数分布分析并通过cytoscape软件进行网络分析寻找核心分子。采用miRWALK软件对11种差异性表达miRNAs相关靶基因进行预测,将得到的miRWALK-靶基因进行频数分布分析并通过cytoscape,DAVID软件进行网络分析寻找核心分子。结果 Starbase软件对11种不同miRNAs所预测的靶circRNAs的总数量为222个,非重叠circRNAs为141个。其中MIB1_hsa_circ_000886,MIB1_hsa_circ_002013,CPNE1_hsa_circ_000657,CYP4F3_hsa_circ_001395,KIAA1586_hsa_circ_001439与其中4种miRNA相互作用。另有14个circRNAs与3种miRNA相互作用。miRWALK软件对11种不同miRNAs所预测的靶基因中CNOT6、ELF2、NAV3等基因在不同数量级数据库中与相应不同种miRNAs作用密切。通过对11种miRNA相应circRNA以及靶基因生物学预测分析得到YES1基因与miR-133a、miR-145以及FAT1_hsa_circ_000713与LMNB2_hsa_circ_001499之间存在相互作用。PPP2CA与miR-29a、miR-29b、miR-133a以及KIAA1586_hsa_circ_001439之间存在相互作用。NTN4和SRGAP1与miR-26a、miR-145以及RFC1_hsa_circ_001649之间存在相互作用。结论本研究对成骨不全血清中差异表达的11种miRNAs及其相互作用的circRNAs、靶基因与相关信号通路进行了网络分析与预测,为进一步分析之间相互作用奠定了基础。
- 马翔鲁艳芹王延宙刘军龙苏学利张遥左清利任秀智韩金祥
- 关键词：成骨不全MIRNA靶基因生物信息学预测
- 环状RNA的研究进展被引量：3
- 2016年
- 环状RNA(circular RNA,circ RNA)是广泛存在于各种生物体中一类区别于传统线性RNA的新型形式,是特殊的内源性RNA分子,并具有调控基因表达的作用。circ RNA首次在RNA病毒中被发现。近年来,研究人员在人、鼠、线虫、植物、古生菌生物体内发现存在大量circ RNA。在真核生物体中,大部分circ RNA是由外显子构成,富集在胞浆中,并具有牢固的环状结构,大量存在于真核转录组中,具有良好的物种保守性以及组织特异性,不易被核酸酶裂解。研究发现,circ RNA可作为一类新型的竞争性内源RNA分子(competing endogenous RNA,ce RNA)调节物,发挥RNA海绵功能,竞争性抑制micro RNA(mi RNA)的表达,阻断mi RNA对其靶基因表达的抑制作用。目前发现,circ RNA在肿瘤、阿兹海默症等疾病的发生上起重要作用,其作为新型临床诊断标记物具有明显的优势。本文就circ RNA的研究进展作一综述。
- 马翔任秀智刘军龙鲁艳芹韩金祥
- 关键词：可变剪接
- 环状RNA
- 环状RNA(circular RNA,circRNAs)是广泛存在于各种生物体中一类区别于传统线性RNA的新型形式.它首次在RNA病毒中被发现.近年来,研究人员在人,鼠,线虫,植物,古生菌生物体内发现存在大量circRN...
- 马翔任秀智张遥左清利鲁艳芹韩金祥
- 关键词：基因功能
- 文献传递
