李萍萍
- 作品数：3 被引量：18H指数：2
- 供职机构：新疆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市重点实验室开放基金新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 解除独行菜种子低温萌发停滞的温度响应蛋白筛选及表达分析被引量：7
- 2016年
- 新疆北部早春短命植物独行菜(Lepidium apetalum Willd.)种子萌发对温度响应独特:低温层积可以促进种子的萌发并显著增加整齐度,但在4℃条件下存在低温萌发停滞现象,而经25℃处理45-55 min及更长时间后,种子则可以在4℃条件下萌发。这种短暂的高温诱导解除低温萌发停滞的机制尚不清楚。本研究对处于低温层积前、萌发停滞状态及25℃高温处理解除低温萌发停滞后的种子进行蛋白质差异分析,筛选出解除独行菜种子低温萌发停滞的温度响应蛋白,采用定量q RT-PCR技术对相应基因的表达进行了验证。结果表明:低温层积前、后独行菜种子之间差异蛋白不显著;25℃高温处理45 min解除低温萌发停滞的种子与前二者种子蛋白差异显著。从中筛选出37个差异蛋白,其中14个上调,23个下调。选择显著上调的6个蛋白进行LC/MS-MS鉴定,并在生物信息学分析基础上,进一步选择其中的Cdc48E、Hsp17.6和Per12进行q RT-PCR验证,结果表明:这三个蛋白的基因在解除低温萌发停滞的种子中表达量极显著增高;随25℃处理时间增加,三个基因表达均呈上升趋势,且处理在45~55 min时上调表达达到最高,之后维持这一水平表达,这与经25℃处理30~60 min能够解除低温萌发停滞进行萌发的种子比率显著增加的特性相一致。以上结果说明Cdc48E、Hsp17.6和Per12可能与解除独行菜种子低温萌发停滞有密切关系,此结果为植物温度信号响应的研究提供了新的线索。
- 李萍萍曾卫军周茜赵惠新李艳红葛风伟祝长青赵君洁卢函赵和平
- 关键词：独行菜种子萌发
- 独行菜种子转录组的高通量测序及分析被引量：14
- 2016年
- 独行菜种子为我国传统常用中药,从中已提取出多种药用活性成分,但目前尚不清楚其次级代谢过程中这些活性物质合成的遗传基础。采用Illumina Hiseq^(TM)2000高通量测序平台对独行菜种子转录组进行测序,经de novo组装后获得40 303条unigene。进一步利用六大公共数据库进行同源比对,注释了27 935条unigene。研究发现,534个基因参与了独行菜次生物质的合成和代谢,其中在芥子苷、黄酮类和芪类化合物生物合成途径中的unigene分别有4个、19个和69个,在苯丙氨酸代谢途径中的unigene有92个。这些基因可能参与独行菜种子药性活性物质的生物合成,并分析获得了参与上述合成代谢途径的13个关键基因的同源序列。另外,从转录组序列中搜索到6 304个SSR位点,分布于5 306条unigene中,出现频率为15.64%。研究结果不仅为挖掘独行菜种子药用次生代谢物生物合成关键基因提供了基础数据信息,而且为独行菜遗传多样性研究和分子标记开发奠定了分子基础。
- 周茜赵惠新李萍萍曾卫军李艳红葛风伟赵君洁赵和平
- 关键词：独行菜转录组次生代谢SSR
- 解除独行菜种子低温萌发停滞的温度响应蛋白筛选及表达分析
- 独行菜(Lepidium apetalum Willd.)为十字花科独行菜属植物，分布十分广泛。前期研究发现，生活在新疆北部的独行菜在低温下萌发到一定阶段会出现停滞现象，而经较高温度短时间处理，种子即可在低温下继续萌发生...
- 李萍萍
- 关键词：独行菜种子萌发
