赵丹
- 作品数：13 被引量：98H指数：6
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家食用豆产业技术体系建设专项国家高技术研究发展计划农作物种质资源保护项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 一种植物黄矮病抗性相关蛋白及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种植物黄矮病抗性相关蛋白及其编码基因和应用。本发明提供的蛋白质，是如下(a)或(b)的蛋白质：(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；(b)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/...
- 张增艳辛志勇赵丹杜丽璞徐惠君李宁黄茜
- 应用SSR标记对小豆种质资源的遗传多样性分析被引量：29
- 2009年
- 利用24对SSR引物对158份栽培小豆及18份野生小豆资源进行遗传多样性分析。结果表明,栽培小豆的遗传变异水平显著低于野生小豆,其中18对引物在栽培小豆中能检测到多态性,平均等位变异数为3.0个,21对引物在野生小豆中能检测到多态性,平均等位变异数为2.6个。栽培小豆种质间平均遗传相似性系数为0.724,野生小豆间为0.605。基于类平均法的聚类分析可以将栽培小豆和野生小豆区分开,这与主坐标分析的结果基本吻合。不同来源的栽培小豆群体间也有一定的遗传分化。SSR分析不仅验证了小豆品种间的遗传背景与其系谱来源相吻合,而且揭示了同名种质天津红小豆之间的遗传差异。本研究为我国小豆种质资源育种及SSR标记在小豆多样性分析、基因标记、品种纯度鉴定等工作提供了信息。
- 王丽侠程须珍王素华梁辉赵丹徐宁
- 关键词：小豆SSR
- 以地理来源分组和利用表型数据构建中国小豆核心种质被引量：36
- 2008年
- 中国国家种质库里保存着4877份小豆(Vigna angularis)种质资源,但仅有部分资源在小豆的改良中被利用。构建小豆核心种质,不但能简化管理,而且可以提高遗传资源在小豆改良中的利用效率。根据我国小豆的地理来源进行分组,在分组的基础上利用表型数据,以类平均法聚类构建了中国现有小豆核心种质,共435份资源,占资源总量的8.92%,涵盖98.3%的表型变异类型,控制不同性状表型相关的相互适应的遗传复杂性在核心种质中也得到了适当的保持。不同性状的均值t测验、方差F测验、表型频率分布、χ2测验等分析表明,所构建的小豆核心种质可以作为整体资源的代表性样本,在小豆种质资源的充分利用中将发挥重要作用。
- 徐宁程须珍王素华王丽侠赵丹
- 关键词：核心种质表现型遗传资源
- Ceratotropis亚属基于SSR标记和ITS序列的分类与进化分析
- 2010年
- 利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异。初步筛选出分布于11个连锁群（linkage group,LG）的74对小豆引物及14对黒吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料（除HAI_103）划分为两大类,第I类包括Ceratotropis组所有种质和3个＂过渡＂种质;第Ⅱ类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上。对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小（0-0.005）,V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树（maximum parsimony,MP）和邻接树（neighbor-joining,NJ）,将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致。
- 马燕玲程须珍王丽侠王素华赵丹
- 关键词：SSR标记ITS序列进化
- 小麦抗病基因类似序列BRG1的分离与功能分析被引量：3
- 2011年
- 利用cDNA-AFLP技术筛选到1个在抗黄矮病的小麦-中间偃麦草易位系YW642中特异表达的小麦抗病基因类似序列(BYDV resistance-related gene1,BRG1)的基因片段。利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和RT-PCR技术,从YW642中分离出BRG1基因全长cDNA序列,获得了一个通读的抗病同源基因cDNA序列,编码由645个氨基酸组成的蛋白质,包含1个NB-ARC保守结构域和3个LRR结构域,该蛋白属于nucleotide-site binding,leucine-rich repeats(NBS-LRR)家族。荧光定量或半定量RT-PCR表达分析表明,BRG1在抗病小麦易位系YW642叶片中优势表达,受BYDV的诱导,BYDV接种后48h表达量最高,BRG1在感病小麦亲本中8601中表达量始终较低,随BYDV接种时间延长呈轻微的下调趋势;而且外源激素水杨酸(SA)与茉莉酸(JA)处理可上调该基因在YW642中的表达。利用病毒介导的基因沉默技术分析了BRG1基因的功能,结果表明该基因沉默的抗病小麦易位系YW642中BYDV相对含量增加,但未造成抗病性表型显著改变,说明该基因参与抗黄矮病反应,但不是小麦抗黄矮病重要基因。
- 李宁黄茜刘燕赵丹刘艳黄占景张增艳
- 关键词：CDNA-AFLP
- 利用BSMV-VIGS技术快速分析小麦TNBL1基因的抗黄矮病功能被引量：9
- 2011年
- 小麦黄矮病是由蚜虫介导的大麦黄矮病毒(Barley yellow dwarfvirus,BYDV)侵染引起的小麦重要病害之一。利用cDNA-AFLP分析,筛选出在抗黄矮病小麦易位系YW642中特异表达的长度为292bp的cDNA片段,以此片段为启始序列,利用RACE和RT-PCR技术克隆出该基因的全长cDNA序列,推导该基因编码1个NBS-LRR蛋白,将其命名为TNBL1。本研究利用大麦条纹花叶病毒(BSMV)诱导的基因沉默(virus-inducing gene silencing,VIGS)技术,快速分析TNBL1是否参与小麦抗黄矮病反应。通过PCR添加酶切位点、定向酶切与连接,将TNBL1特异的292bp片段反向整合到BSMV-γ链的多克隆位点上,获得重组载体BSMV-γ:TNBL1as,体外转录BSMV-VIGS载体的3个组分(BSMV-TNBL1as、BSMV-α和BSMV-β),等量混合、摩擦接种到抗黄矮病的小麦易位系YW642幼苗叶片上,使YW642中TNBL1基因沉默,然后接种BYDV病原进行黄矮病抗性鉴定。结果表明,TNBL1基因沉默后的YW642对BYDV敏感、显现感病症状,其体内BYDV含量较未发生基因沉默的YW642中的明显增加,证明TNBL1基因是正向调控小麦抗BYDV反应的1个重要基因。
- 赵丹赵继荣黄茜李宁刘艳黄占景张增艳
- 关键词：小麦中间偃麦草黄矮病NBS-LRR
- 绿豆基因组研究进展被引量：6
- 2010年
- 绿豆是亚洲国家重要的经济作物。绿豆基因组的研究工作已开展多年,至今已经发布了6张遗传连锁图谱,然而还未有一张图谱的连锁群数与绿豆(2n=2x=22,n=11)的染色体基数一致。近年来,豆科植物比较基因组学的研究成果,为绿豆遗传连锁图谱的发展提供了新的思路。通过将绿豆遗传连锁图与其他豆类连锁图比较发现,绿豆与小豆、豇豆、普通菜豆、大豆、藊豆以及豆科模式植物—蒺藜苜蓿的基因组间有不同程度的保守性,其中尤以绿豆与普通菜豆基因组间共线性水平高。本文分别从绿豆遗传连锁图谱构建、比较基因组作图以及抗豆象基因定位等方面进行了综述,以期为绿豆遗传研究工作者提供参考。
- 赵丹程须珍王丽侠王素华
- 关键词：绿豆基因组遗传连锁图
- 抗小麦黄矮病重要基因TiNBL1的分离克隆与功能验证
- 黄矮病是小麦的一种世界性的主要病毒病b选育和推广抗黄矮病小麦新品种,是防治该病害的最经济有效途径b小麦初级基因库中尚未发现抗性基因,而小麦远缘植物中间偃麦草高抗黄矮病毒
- 赵丹李宁张增艳黄茜赵继荣陈亮黄占景辛志勇
- 文献传递
- 抗小麦黄矮病重要基因TiNBL1的分离克隆与功能验证
- 黄矮病是小麦的一种世界性的主要病毒病。选育和推广抗黄矮病小麦新品种，是防治该病害的最经济有效途径。小麦初级基因库中尚未发现抗性基因，而小麦远缘植物中间偃麦草高抗黄矮病毒多个株系(BYDV-PAV、-C-AV、-GW、-M...
- 赵丹李宁张增艳黄茜赵继荣陈亮黄占景辛志勇
- 关键词：小麦黄矮病抗性基因分离纯化克隆表达
- 文献传递
- 绿豆遗传连锁图谱的整合被引量：16
- 2010年
- 利用绿豆及其近缘种的701对SSR引物,对现有绿豆遗传连锁图谱进行补充,结果在高感豆象绿豆栽培种Berken和高抗豆象绿豆野生种ACC41两亲本间筛选到多态性SSR引物104对。群体分析后,结合其他分子数据,使用作图软件Mapmaker/Exp 3.0b,获得一张含有179个遗传标记和12个连锁群,总长1831.8cM、平均图距10.2cM的新遗传连锁图谱,包括97个SSR标记,91个来自绿豆近缘种;RFLP标记76个;RAPD标记4个;STS标记2个。对32个绿豆、小豆共用SSR标记在遗传连锁图谱的分布分析发现,二个基因组间有一定程度的同源性,共用标记在连锁群上的排列顺序基本上一致,只有部分标记显示绿豆和小豆基因组在进化过程中发生了染色体重排;利用新图谱对ACC41的抗绿豆象主效基因重新定位,仍定位于I(9)连锁群,与其相邻分子标记的距离均小于8cM,其中与右翼SSR标记C220的距离约2.7cM。与原图谱比较,新定位的抗性基因与其相邻标记的连锁更加紧密。
- 赵丹程须珍王丽侠王素华马燕玲
- 关键词：绿豆遗传连锁图谱SSR标记
