裴智勇 作品数:18 被引量:16 H指数:2 供职机构: 北京市计算中心 更多>> 发文基金: 北京市自然科学基金 国家自然科学基金 北京市财政局项目 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 医药卫生 生物学 农业科学 更多>>
基于高通量测序的全基因组关联研究策略 被引量:12 2014年 全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)是人类复杂疾病研究的重要组成部分之一,在群体水平检测全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗传关联。传统的GWAS是以芯片(Array)技术获得高密度的遗传变异,尽管硕果累累,但也存在不少问题。如:所谓的"缺失的遗传力",即利用关联分析检测达到全基因组水平显著的遗传变异位点只能解释小部分遗传力;在某些性状上不同研究的结果一致性较弱;显著关联的遗传变异位点的功能较难解释等。高通量测序技术,也称第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)技术,可以快速、准确地产出高通量的变异位点数据,为解决以上问题提供了可行的方案。基于NGS技术的GWAS方法(NGS-GWAS)可在一定程度上弥补传统GWAS的不足。文章对NGS-GWAS策略和方法进行了系统性调研,提出了目前较为可行的NGS-GWAS的实施策略和方法,并对NGS-GWAS如何应用于个体化医疗(Personalized medicine,PM)进行了展望。 周家蓬 裴智勇 陈禹保 陈润生关键词:全基因组关联研究 个体化医疗 一种识别并校正六边形的方法 本发明提供了一种识别并校正六边形的方法,包括:第一步:初步识别六边形图像,第二步:对六边形的六个顶点进行校正,第三步:获取六边形图像的形心,对六边形图像的形心进行校正。该方法能够准确识别图形边缘有噪音点或者不规整六边形,... 裴智勇 张铉 陶磊 左琦 刘彤基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法及小分子靶标核酸适配体 本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析,其次在小分子化合物库中进行筛选,如符合匹配原则,则作为目标小分子靶标,与核酸分子进行分子对... 刘书霞 赵新颖 裴智勇 杨杰 刘满姣 袁寒玉文献传递 2型糖尿病易感基因代谢通路生物信息学研究 被引量:2 2016年 目的构建中国人群中2型糖尿病易感基因的代谢通路。方法采用2型糖尿病的易感基因集合,基于商用数据库Ingenutiy Pathway Analysis(后简称IPA)中的Right-Tailed Fisher′s Exact Test算法进行统计分析,找到与糖尿病相关的代谢通路,并从中筛选出15个与中国人群糖尿病相关的易感基因,根据易感基因建立代谢通路,探讨中国人群易感基因之间在生物学上的关联关系。结果 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因位于多条代谢通路的节点位置,与多条代谢通路相关。结论 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因在中国人群2型糖尿病的发生过程中起到了关键作用。该研究结果对基于代谢通路研究复杂性疾病具有很好的借鉴意义。 张丽杰 裴智勇 马跃 陈禹保关键词:2型糖尿病 易感基因 代谢通路 用于服务器中的生物信息分析系统 本发明提供了一种用于服务器中的生物信息分析系统。本发明提供的生物信息分析系统,集群了生物分析计算中常用的各类软件,当用户需要安装某一生物计算软件时,只需通过显示界面查找并点击该软件,系统即可自动对该软件进行安装,避免现有... 陈禹保 裴智勇 张丽杰 钟爱秒文献传递 一种识别并校正六边形的方法 本发明提供了一种识别并校正六边形的方法,包括:第一步:初步识别六边形图像,第二步:对六边形的六个顶点进行校正,第三步:获取六边形图像的形心,对六边形图像的形心进行校正。该方法能够准确识别图形边缘有噪音点或者不规整六边形,... 裴智勇 张铉 陶磊 左琦 刘彤一种基于jupyter-lab开发网络服务的教育培训一体机系统及实现方法 本发明提供了一种基于jupyter‑lab开发局域网的人工智能教育培训一体机系统,其特征在于,包括:课程端和管理端,还包括jupyter‑lab管理平台实现模块,基于后端功能实现jupyter‑lab管理平台;用户端通过... 裴智勇 袁寒玉 刘彤 陶磊 张铉 左琦 潘勇 员丽丽 胡风雪 武豪杰一种药用植物化合物信息数据库建立方法及系统 本发明提供了一种药用植物化合物信息数据库建立方法及系统,包括以下步骤:荻取药用植物信息,分别对各药用植物进行编码;获取各药用植物能够提取出的化合物,建立映射关系;信息存储;数据统计,排序。解决现有天然化合物基本都是分散在... 缪剑华 裴智勇 乔柱 胡营 李春瑞 韦坤华 雷明 杨晓男 阮丽君 汤丹峰一种基于图像处理和知识图谱的目标物信息及目标物关系可视化查询方法和装置 本发明提供一种基于图像处理和知识图谱的目标物信息及目标物关系可视化查询方法和装置,能够将存储人提供的照片及其里面的目标物与关系放入知识图谱之中,将图片与目标物及其关系联系起来,使即使在网页上爬取不到的目标物也可以搜寻到想... 裴智勇 杨杰 陶磊 刘晶晶 马裕涵 王黎超 胡风雪用于检测2型糖尿病易感基因的突变位点组合及其检测引物与应用 本发明涉及分子生物学,具体公开了检测2型糖尿病易感基因的突变位点组合及其检测引物与应用。所述突变位点组合包括来自KCNQ1、C2CD4A、TCF7L2、SLC30A8、CDKAL1、CDKN2A/2B、KCNJ11、PP... 李春瑞 陈禹保 裴智勇 刘满姣 卜祥霞 邢玉华文献传递