张丽杰
- 作品数：4 被引量：15H指数：2
- 供职机构：北京市计算中心更多>>
- 发文基金：北京市优秀人才培养资助更多>>
- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- 2型糖尿病易感基因代谢通路生物信息学研究被引量：2
- 2016年
- 目的构建中国人群中2型糖尿病易感基因的代谢通路。方法采用2型糖尿病的易感基因集合,基于商用数据库Ingenutiy Pathway Analysis(后简称IPA)中的Right-Tailed Fisher′s Exact Test算法进行统计分析,找到与糖尿病相关的代谢通路,并从中筛选出15个与中国人群糖尿病相关的易感基因,根据易感基因建立代谢通路,探讨中国人群易感基因之间在生物学上的关联关系。结果 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因位于多条代谢通路的节点位置,与多条代谢通路相关。结论 KCNQ1、PPARG、IRS1、ADIPOQ等基因在中国人群2型糖尿病的发生过程中起到了关键作用。该研究结果对基于代谢通路研究复杂性疾病具有很好的借鉴意义。
- 张丽杰裴智勇马跃陈禹保
- 关键词：2型糖尿病易感基因代谢通路
- ACOT1蛋白突变的分子动力学研究
- 2014年
- 酰基辅酶硫酯酶(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),也被称作酰基辅酶A水解酶,是一类能够水解酰基辅酶A酯类水解的酶,在脂肪酸的代谢中起着重要的作用。文中通过将序列分析得到的ACOT1的有害突变序列(ACOT1_MULT)和野生型序列利用同源建模的方法得到了相应的蛋白结构,并利用分子动力学模拟的方法研究了突变氨基酸对蛋白结构造成的影响。研究结果发现:突变蛋白在分子动力学过程中活性中心上面的"盖子"(LEU374-SER380)区域打开,而野生型一直处于关闭状态。通过对氢键和疏水作用的分析发现,突变位置的氨基酸(ALA189THR)与蛋白序列中的GLY169形成了新的氢键,突变残基附近的氢键也发生了很大的变化,导致了邮水解酶区域的第3个β折叠的末端Loop区(160Loop)朝着外侧的亲水性区域拉伸。160Loop区域的变化使得它与"盖子"区域之间的疏水相互作用消失,"盖子"区域的稳定性下降,并最终导致了"盖子"的打开。该结果对ACOT1蛋白相关的人类免疫病毒缺陷疾病和附睾炎等疾病的发病机理的研究具有很好的借鉴作用,同时也为基于该活性区域的抑制剂筛选工作提供了新的靶点。
- 张丽杰李雪楠李昊阳周家蓬陈禹保
- 关键词：氢键疏水相互作用分子动力学模拟
- 高血压早期预警和健康管理平台的构建被引量：13
- 2014年
- 为了控制和降低高血压的病死率、致残率,提高患者知晓率、治疗率,减轻高血压以及其他慢性疾病对个人和社会造成的负担,我们开发了高血压早期预警和健康管理平台。该平台基于云计算和大数据挖掘技术,包括数据收集与档案的建立、风险评估与重点人群分类、健康指导、效果评价等四个部分,平台界面简洁、使用简便,可面向普通个人用户,也可本地化到社区使用。
- 桂小柯张丽杰陈禹保周家蓬王丽娟刘洁琳温绍君刘康
- 关键词：高血压健康管理
- 用于服务器中的生物信息分析系统
- 本发明提供了一种用于服务器中的生物信息分析系统。本发明提供的生物信息分析系统，集群了生物分析计算中常用的各类软件，当用户需要安装某一生物计算软件时，只需通过显示界面查找并点击该软件，系统即可自动对该软件进行安装，避免现有...
- 陈禹保裴智勇张丽杰钟爱秒
- 文献传递
