金建峰
- 作品数:4 被引量:9H指数:1
- 供职机构:浙江大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划)项目台州市科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 结球白菜转录因子基因BrCCCH的克隆与分析
- 2014年
- CCCH型锌指蛋白是1种转录因子,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要的调控作用。本研究以结球白菜叶片为材料,利用PCR技术克隆到1个CCCH基因。结果表明,BrCCCH的基因组全长为2 302 bp,具6个内含子,编码450个氨基酸,BrCCCH编码蛋白有5个保守的C-X8-C-X5-C-X3-H基序;序列比对结果表明,BrCCCH与13种植物CCCH基因的相似性为45%~97%,与同属植物芜菁的相似性最大,与禾本科的乌拉尔图小麦的相似性最小;从进化树上看,不同科的植物各自聚为1组,支持率达100%。BrCCCH基因的克隆为后续开展其表达分析和基因功能鉴定奠定了基础。
- 王岚金建峰蒋明赵罗鹏田星楼潇潇
- 关键词:结球白菜基因克隆转录因子
- 青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
- 2016年
- 根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。
- 黄笑梅金建峰张雪朱思眉朱柯柯赵罗鹏蒋明
- 关键词:青花菜抗病基因基因克隆
- 粗山羊草和二穗短柄草SOD基因成员的鉴定与比较分析
- 2014年
- 为给超氧化物歧化酶(SOD)基因克隆和功能研究奠定基础,以粗山羊草和二穗短柄草的基因组序列为材料,利用生物信息学手段对SOD基因家族成员进行鉴定和分析。结果表明,两种植物总共鉴定出12个SOD基因,其中二穗短柄草7个,粗山羊草5个;它们的编码区全长327~2 145bp,编码108~714个氨基酸,保守基序数量1~4个,等电点4.84~9.25;Cu/Zn-SOD、Fe-SOD与Mn-SOD的数量分别为8、3和1个,在粗山羊草基因组中没有鉴定到Mn-SOD基因;3种不同类型的SOD在进化树上处于不同分支。除Bradi2g30580.2和Bradi1g50550.1外,其他二穗短柄草的SOD基因在粗山羊草中均有同源基因。
- 蒋明管铭李金枝金建峰
- 关键词:粗山羊草二穗短柄草超氧化物歧化酶基因家族
- 石斛属植物rDNA ITS序列的克隆与分析被引量:9
- 2014年
- 对24种石斛属植物的rDNA ITS序列进行克隆分析,以期为石斛属植物的分子鉴定和遗传多样性研究提供依据。以叶片基因组为模板,利用通用引物分别扩增24种石斛属植物的ITS序列,结果表明,ITS全长为634~646 bp,其中,5.8S序列的长度十分保守,均为164 bp;而ITS1和ITS2序列长度变异较大,分别为226~235 bp和241~247 bp。ITS1和ITS2序列具有丰富的变异位点,分别为176和166个;其中,信息位点分别为114和104个,发现了大量的转换、颠换和插入/缺失现象。而5.8S序列相对保守,有36个变异位点,其中信息位点16个。本研究表明,利用ITS序列可将本研究中的24种石斛属植物完全区分,这24种石斛属植物的遗传距离为0.007~0.302,其中鼓槌石斛和粟斑鼓槌石斛的遗传距离最小,亲缘关系最为接近;而金耳石斛与短棒石斛的遗传距离最大,亲缘关系最远。
- 金建峰朱思眉蒋明林蒙蒙黄笑梅何美云
- 关键词:石斛属ITS序列克隆分子鉴定