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椰枣全基因组测序与分析: 椰枣是中东和北非地区广泛种植的作物,具有重要的经济价值和历史文化意义.为了揭示椰枣的生物多样性、地理种群的分布、抗旱和抗逆的分子机理、性别决定(雌雄异株植物)与分子育种研究等,我们开展了椰枣基因组和转录组测序和分析工作....; Al-Mssallem Ibrahim S.张同武尹玉新辛成齐吴浩张广宇Ba Abdullah Mohammed M.黄大维方永军AlnakhliYasser O.贾善刚胡松年殷安Al-OwayyedSaad A.AlsaihatiBurair A.赵多军张笋Al-OtaibiNoha A.孙高远MajrashiMajed A.李福森塔拉张晓伟AlhuzimiEman M.王吉祥云权正AlnassarNafla A.王磊杨猛Al-JelaifyRasha F.刘凯高胜寒陈开富谭军AlkhaldiSamiyah R.刘贵明张猛郭海燕于军林强刘万飞于晓光刘久成潘林林; 关键词：全基因组

小鼠乳腺发育的转录组学研究--怀孕哺乳周期乳腺的关键调控基因被引量：2: 2014年; 乳腺是哺乳动物特有的器官,90%的发育过程集中在出生之后.此外,在生殖过程中乳腺发育会经历怀孕、哺乳和退化3个阶段(称为怀孕哺乳周期).为了在转录组水平上更好地了解乳腺发育的机制,利用核糖体RNA去除法构建了小鼠乳腺3个时期(怀孕12天、哺乳14天和退化7天)的总RNA文库,每个文库产出的数据量均大于5×107条reads.3个文库分别得到17344,10160和13739个蛋白编码基因以及1803,828和1288个ncRNAs.其中,从怀孕期到哺乳期有4843个差异表达基因(包括749个上调表达的基因和4094个下调表达的基因);从哺乳期到退化期共有4926个差异表达基因(包括4706个上调表达和220个下调表达的基因).此外,还观察到与溶酶体酶相关的基因在哺乳期乳腺中有较高的表达.通过对转录因子及ncRNAs的分析,还得到一些可能在乳腺发育的不同时期有重要调控作用的调控因子基因(如转录因子基因Trps1,Gtf2i,Tcf7l2,Nupr1,Vdr,Rb1和Aebp1;miRNA基因mir-125b,Let-7,mir-146a和mir-15等).; 周媛媛龚未肖景发吴佳妍潘林林李小暖王绪敏王伟伟胡松年于军; 关键词：小鼠乳腺乳腺发育转录组 MIRNAS

基于新一代测序方法的小鼠睾丸出生后发育的转录组研究被引量：2: 2013年; 哺乳动物睾丸的发育是一个高度复杂而精密的过程.为了从转录组水平研究睾丸正常发育过程中的动态变化,本实验选取了出生后6日龄、4周龄和10周龄的3组小鼠,分别代表其幼年期、青春期以及成年期.应用超高通量的新一代测序技术(RNA-seq),获得了2.11亿条长度为35bp的序列,鉴定出18837个基因,并且发现表达量最高的基因均与精子发生相关.同时,也发现6日龄小鼠睾丸的基因表达谱明显有别于4和10周龄,表明4周龄小鼠已进入性发育期.本文分析了睾丸发育过程中大量与精子发生和体细胞发育相关的基因,找到了MAPK,Hedgehog和Wnt等信号通路在睾丸不同发育阶段中所起的重要作用.这些研究结果加深了对睾丸发育的分子调控机制的认识.本研究也表明新一代测序技术在转录组研究中具有很大优势.; 龚未潘林林林强周媛媛辛成齐俞晓敏崔鹏胡松年于军; 关键词：转录组小鼠睾丸发育

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潘林林