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于军: 作品数：85 被引量：408H指数：10; 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院科研装备研制项目更多>>; 相关领域：生物学医药卫生农业科学建筑科学更多>>

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用于敲除人BTF基因的gRNA序列及其敲除方法: 本发明涉及基因工程领域，具体提供了一种提供一种用于敲除细胞人BTF（Bcl-2-associated？transcription？factor？1）基因的sgRNA序列。在细胞中该gRNA能够特异结合于人BTF编码序列第...; 邵长君王绪敏王延强于军

合成生物学的发展路线及治理被引量：4: 2014年; 合成生物学家的理想是逐步实现对物种基因和基因组的功能性修饰,创造出对人类有益并对自然界无害的新生物。尽管分子水平的研究仅有60余年的历史,但有必要充分认识合成生物学的复杂性。鉴于此,任重而道远的合成生物学研究路线图应该包括多学科的底盘物种系统研究、细胞水平的功能元件解析与移植、新功能物种的安全性与功能优化、生产型功能物种的再选育、后期的跟踪技术和应用评价等。除了明确科学界的路线图外,社会伦理、道德和法律等领域的讨论及研究也至关重要,关注治理问题可以规避风险,避免社会利益群体的冲突,造成难解的"死结",使科学成果成为无法利用的"夹生饭"。; 于军; 关键词：合成生物学基因组遗传修饰路线图

寒冷诱导产热时大鼠棕色脂肪能量代谢相关蛋白谱的变化(英文)被引量：1: 2010年; 棕色脂肪组织(BAT)的生理作用与白色脂肪显著不同,它以产热的形式释放能量而不是将能量以 ATP的形式储存.线粒体是在能量代谢和维持细胞稳态中具有重要功能的细胞器.为了更好地了解棕色脂肪中的能量代谢过程,运用双向电泳及质谱相结合的技术,分离了大鼠白色和棕色脂肪线粒体,对其差异蛋白质谱进行了系统分析和鉴定.参与脂肪和氨基酸代谢、三羧酸循环及线粒体呼吸链的蛋白质在棕色脂肪线粒体中的表达明显高于白色脂肪线粒体,在寒冷诱导下这些蛋白质的表达进一步上调.此外,参与辅酶 Q 合成的一系列 COQ 基因在棕色脂肪中经寒冷适应后表达明显上调.该研究表明,辅酶 Q合成的增高在非颤栗性产热中具有重要作用,为进一步了解棕色脂肪特异性的能量代谢提供了新的思路.; 杨悦龚未王伟伟俞晓敏胡松年于军; 关键词：棕色脂肪组织产热辅酶Q

用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群: 本发明提供用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群，所述肠道微生物菌群包括肠道产丁酸菌和肠道非发酵菌两类肠道菌；其中，所述肠道产丁酸菌包括12个产丁酸菌菌属的微生物，所述肠道非发酵菌包括33个非发酵菌菌属的...; 楚亚男康禹孟庆仁于军石兴邵长君王建陈婧; 文献传递

一种痰液微生物的快速提纯试剂及其应用: 本发明提出一种痰液微生物的快速提纯试剂，包括液化液、细胞裂解液、核酸外切酶缓冲液；所述细胞裂解液含有胍盐和表面活性剂，所述胍盐在细胞裂解液中的浓度为1～3mol/L。本发明还提出所述痰液微生物的快速提纯试剂的应用。本发明...; 邵长君康禹石兴于军林强王建楚亚男付荣荣; 文献传递

类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析: 2013年; 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus),作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体,介导金黄色葡萄球菌产生耐药性.本研究报道了一株新甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的全基因组序列信息,即类SCC样MSSA463菌株,经多重PCR方法,该菌株被误鉴定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,结果与药敏结果相冲突.为此,运用焦磷酸测序方法完成了该菌株的全基因组测序,并与已知金黄色葡萄球菌的基因组序列信息不同,发现可读框(CZ049;AB037671)存在于attL,attR反向重复序列的临近下游.这些结果提示,在金黄色葡萄球菌与其他微生物之间可能存在一种水平基因转移,并改变了金黄色葡萄球菌对药物的敏感性,推测attL,attR反向重复序列可能作为外源性基因的插入部位而存在.; 李德志楚亚男任鲁风李欣刚袁丽娜康禹张伟杨宇王绪敏Baillie J.Kenneth于军高占成; 关键词：金黄色葡萄球菌基因组学焦磷酸测序

遗传密码的新排列和起源探讨被引量：5: 2009年; 根据DNA核苷酸组分的动态变化规律将遗传密码的传统排列按密码子对GC和嘌呤含量的敏感性进行了重排.新密码表可划分为2个半区(或1/2区)和4个四分区(或1/4区).就原核生物基因组而言,当GC含量增加时,物种蛋白质组所含的氨基酸倾向于使用GC富集区和嘌呤不敏感半区所编码的氨基酸,它们均使用四重简并密码,对DNA序列的突变具有相对鲁棒性(Robustness).当GC含量降低时,大多数密码子处于AU富集区和嘌呤敏感半区,这个区域编码的氨基酸具有物理化学性质的多样性.因为当密码子第三位核苷酸(CP3)在嘌呤和嘧啶之间发生转换时,密码子所编码的氨基酸也倾向于发生变化.关于遗传密码的进化存在多种假说,包括凝固事件假说、共进化假说和立体化学假说等,每种假说均试图解释遗传密码所表现出来的某些化学和生物学规律.基于遗传密码的物理化学性质、基因组变异的规律和相关的生物学假说,本研究提出了遗传密码分步进化假说(The Stepwise Evolution Hypothesis for the Genetic Code).在人们推断的最原始的RNA世界里,原初(Primordial)遗传密码从只能识别嘌呤和嘧啶开始,编码一个或两个简单而功能明确的氨基酸.由于胞嘧啶C的化学不稳定性,最初形成的遗传密码应该仅仅由腺嘌呤A和尿嘧啶U来编码,却可得到一组7个多元化的氨基酸.随着生命复杂性的增加,鸟嘌呤G从主载操作信号的功能中释放出来,再伴随着C的引入,使遗传密码逐步扩展到12,15和20个氨基酸,最终完成全部进化步骤.遗传密码的进化过程同时也伴随以蛋白质为主体的分子机制和细胞过程的进化,包括氨酰tRNA合成酶(AARS)从初始翻译机器上的脱离、DNA作为信息载体而取代RNA以及AARS和tRNA共进化等基本过程.分子机制和细胞过程是生命的基本组成元件,它们不但自己不断地趋于完善,也促使生命体走着不尽相同的道路,或�; 肖景发于军; 关键词：遗传密码 GC含量

SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析被引量：23: 2003年; 严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病。对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定,并与其他已知病毒进行了比较分析。该病毒基因组全长为29.725kb,含11个可读框(ORFs),由1个稳定区和1个可变区组成,其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶,包括两个ORFs;可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs),分别编码病毒的4个结构蛋白(S,E,M,N蛋白)。此外,可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs)。此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致。通过与已知RNA病毒的序列比对,可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae)。与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示,已在30个核苷酸位置上检出序列差异,总体突变率为0.1％,其中15个变异位点在编码区,可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变)。S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异,而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应.与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化。进化分析表明,SARS病毒可能不是来源于人类,但没有证据证明是人为制造的。为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在,仍需进行更深入的研究。; 秦鄂德祝庆余于曼范宝昌常国辉司炳银杨保安彭文明姜涛刘伯华邓永强刘洪张雨王翠娥李豫川甘永华李晓萸吕富双谭刚曹务春杨瑞馥汪建李蔚徐祖元李彦吴清发林伟陈维军唐琳邓亚军韩玉军李昌峰雷蒙李国庆; 关键词：冠状病毒基因组系统发生学

多维度基因组信息:起源、内涵与技术瓶颈被引量：3: 2020年; 近年来发展起来的染色体多维结构研究很快就遇到了概念盲区和技术瓶颈,有必要在较高级的思维层次加以澄清和深入探讨.虽然生命可能起源于操作(基因组DNA以外的大小生物分子)而非信息(基因组DNA),但是当DNA被选择来承载信息后(或同时),其操作和平衡功能又分别在不同层面上(不同谱系、物种、细胞、染色质、基因)以不同程度体现出来,比如参与平衡的物质不仅包括DNA和RNA大分子也包括脱氧核苷酸、核苷酸、修饰核苷衍生物等小分子以及可识别的结构单元包括染色质区域、转座子、染色体结构元件等.正是这些物质和结构的动态变化和交叉关联构成了多维度的生命活动.这些活动的机械化学、时间空间界定及对其规律的探索和研究,构成了复杂的基因调控体系,从中衍生出由简到繁、由表及里、纵横交错的核心生物学元素和这些元素所构成的科学问题.; 于军; 关键词：基因组染色体基因表达调控

基因组学与环境和健康的研究: 基因组学亦即基因组生物学,是一门系统地研究物种全部基因和它们产物所构成的生理结构和生命活动的学问,所以也被称为系统生物学.笔者对它的研究现状及前景进行了分析.; 于军; 关键词：基因组基因组学; 文献传递

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