杜雄明
- 作品数:259 被引量:1,156H指数:22
- 供职机构:中国农业科学院棉花研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学轻工技术与工程生物学医药卫生更多>>
- 鉴定与纤维强度有关的瑟伯氏棉渐渗片段的成套引物及应用
- 本发明公开了一种鉴定与纤维强度有关的瑟伯氏棉渐渗片段的成套引物及应用,该瑟伯氏棉渐渗片段位于陆地棉染色体D08上,与陆地棉纤维强度QTL位点qFS‑D08紧密相关,位于染色体D08上7.073‑60.027Mb范围内,该...
- 杜雄明王丽媛宋宪亮何守朴潘兆娥王晓阳耿晓丽贾银华陈保军王立如李红戈庞保印
- 文献传递
- 陆地棉种子发育过程中microRNA的挖掘与功能研究被引量:6
- 2014年
- microRNAs(miRNAs)广泛参与调控植物的生长和发育,但这类分子是否对棉花胚珠和纤维的生长发育起到重要的作用,还有待验证。对这些小分子的认识,一般先要从序列信息的获得上开始。应用基因芯片对TM-1+5 DPA(开花后5 d)胚珠总RNA进行了miRNA的筛选研究。结果显示,含有352个探针的芯片成功钓取到199个陆地棉miRNA,其中绝大多数为首次报道。此外,对miR399研究发现,它与纤维中磷的含量变化相关;miR169可能与干旱应激反应有关。
- Wang Gaskin余道乾杜雄明
- 关键词:陆地棉基因芯片MIRNA
- 一种增加棉花纤维干重的培养基及其培养方法
- 本发明涉及棉花纤维领域,特别涉及一种增加棉花纤维干重的培养基及其培养方法。一种增加棉花纤维干重的培养基,在BT培养基中添加第二组分,第二组分选自以下物质中的任一种:甘露醇、茉莉酸甲酯、蔗糖、氯化钾。本发明提供的一种增加棉...
- 孙君灵刘松江龚文芳杜雄明潘兆娥贾银华何守朴庞宝印王立如
- 文献传递
- 棉属四倍体AD_1与二倍体A_2、D_5基因组的同源SSR分析被引量:1
- 2015年
- SSRs(Simple sequence repeats)是一类广泛存在于动植物基因组的DNA短串联重复序列,是重要的基因组分子标记。比较不同基因组同源SSR的差异,有利于了解相近物种间的进化过程。文章使用雷蒙德氏棉基因组(D5)、亚洲棉基因组(A2)全基因组序列和陆地棉(AD1)的限制性酶切基因组测序数据,进行全基因组SSR扫描,比较了A组和D组的SSR分布情况,通过识别3个基因组之间的同源SSR,比较它们之间同源SSR重复序列的差异。结果发现,A组和D组同源SSR的分布规律非常相似,但A组与AD组的同源SSR保守性比D组与AD组同源SSR的保守性强。与AD组同源SSR相比,A组中重复序列长度增长的SSR数量约为长度缩短的SSR数量的5倍,在D组中这一比值约为3倍。可以推测,四倍体AD组在与A组、D组的平行进化过程中,由于基因组融合,导致SSR的重复序列长度变化速率与二倍体A、D组有差异,同时这种差异可能导致了AD组SSR重复序列长度在进化过程中与二倍体相比有变短的趋势。文章首次对3个棉花基因组的同源SSR进行了系统地比较,发现了同源SSR在棉属四倍体基因组和二倍体基因组中的显著差异,为进一步揭示棉属基因组的进化规律提供了基础。
- 孙高飞何守朴潘兆娥杜雄明
- 关键词:SSR棉花基因组
- 棉花γ射线诱变后代的SSR标记遗传多样性被引量:16
- 2006年
- 【目的】了解γ射线诱变对棉花后代SSR标记遗传多样性的影响。【方法】利用39个多态性SSR标记分析了3个棉花品种辐射诱变后代M5材料(共74份)的遗传多样性。【结果】3个品种诱变后代的成对相似系数变幅分别为0.6129~0.9848、0.6212~1.000、0.4857~0.9905,其中Arcot-1和Su9108两个品种诱变后代的成对相似系数大于或等于8.000的比例达到60.0%以上,J11诱变后代的成对相似系数主要集中在低相似性区域,其对成相似系数小于7.000的比例达62.5%。3个品种诱变后代材料与其未辐射处理对照的遗传相似系数变幅分别为0.6515~0.9697、0.6970~1.0000、0.5524~0.8095。【结论】辐射可创造丰富的遗传变异,拓宽原品种的遗传基础。辐射对不同棉花品种的诱变效果存在差异。
- 孙君灵杜雄明孙其信周忠丽潘兆娥庞保印
- 关键词:棉花SSR标记
- 棉花优质棕色纤维新品种的选育方法
- 本发明提供了一种优质、大铃、高产棕色彩色棉(棕色纤维)的选育方法,本发明以半野生棉为基础材料,选育出综合性状较好的棕色彩色棉品系棕1-52(棕絮1号改良系),以棕1-52为父本,与纤维品质优异、大铃的白色棉种质S9108...
- 杜雄明孙君灵周忠丽潘兆娥贾银华刘国强庞保印
- 文献传递
- 重测序解码棉花基因组及表型遗传变异
- 棉花全基因组框架图的完成及重测序等高通量技术的发展,为解码棉花基因组及表型遗传变异奠定了基础。相比芯片技术,重测序技术以其高效、可重复性好等特点近年来广泛应用于基因组与表型变异研究。2017年至今我们利用重测序进行了陆地...
- 杜雄明代攀虹何守朴孙高飞龚文芳潘兆娥贾银华
- 关键词:棉花全基因组关联分析
- 生长物质对彩色棉胚珠离体培养纤维发育的影响被引量:3
- 2015年
- 【目的】天然彩色棉是理想的绿色、环保、健康纺织原料,建立并优化棕色棉和绿色棉胚珠离体培养体系,研究渗透压调节剂、植物生长调节剂和类黄酮代谢前体物质等生长物质对彩色棉胚珠培养纤维发育的影响,为彩色棉纤维色泽改良提供一定的理论基础。【方法】以棕1-61、RT白絮、绿棉CC28为材料,采用常规栽培管理方法种植,在开花当天标记棉铃,取开花后3 d的棉铃进行离体培养。所有处理均在BT培养基基础上添加10.0μmol·L-1的IAA和5.0μmol·L-1的GA3,此外分别采用不同浓度的渗透压调节剂(甘露醇、氯化钠、氯化钾、蔗糖)、植物生长调节剂(茉莉酸甲酯、油菜素内酯)和类黄酮代谢前体物质(苯丙氨酸、阿魏酸)进行处理。除了考察油菜素内酯和茉莉酸甲酯交互作用的试验外,其他均为品种和处理的双因素试验。在离体培养30 d后观察纤维显色状况、测量纤维长度并称取胚珠鲜重、纤维干重和胚珠干重。试验中每个处理的数据均计算平均数和标准误,主要采用最小显著差数法或新复极差法进行多重比较。【结果】离体培养条件下彩色棉纤维在培养后15 d显色;适合彩色棉胚珠生长和纤维发育的最佳处理为5 g·L-1蔗糖,其中棕1-61纤维长度、胚珠鲜重、纤维干重和胚珠干重比对照分别显著增加28.35%、20.69%、103.70%和75.84%(P<0.05),绿棉CC28纤维长度、胚珠鲜重、纤维干重和胚珠干重比对照分别显著增加8.10%、16.07%、63.14%和82.76%(P<0.05);0.05μmol·L-1Me JA处理时棕1-61纤维长度比对照显著增加22.90%(P<0.05),CC28纤维长度对照增加4.39%,差异不显著;0.5μmol·L-1BR处理使棕1-61、CC28纤维长度分别比对照显著增加22.46%和11.56%(P<0.05);25μmol·L-1阿魏酸处理下棕1-61、CC28纤维长度分别比对照显著增加了8.72%和8.81%(P<0.05);添加适宜浓度的甘露醇(30 g·L-1)、氯化钠(0.10mol·L-1)、氯化钾(0.20 mol·L-1)、�
- 刘松江龚文芳孙君灵庞保印杜雄明
- 关键词:彩色棉纤维发育植物生长调节剂前体物质
- 陆地棉矮化突变体Ari1327茎尖的转录组分析被引量:9
- 2014年
- 为了从分子水平上研究陆地棉矮秆突变体Ari1327的矮化机理,本研究以矮秆突变体Ari1327、野生型Ari971和高秆突变体Ari3697的茎尖为材料,建立3个cDNA文库,用Illumina HiSeqTM2000系统对3个材料的茎尖cDNA进行转录组测序。3个文库测序共得4.9 G数据量,拼接得到Unigene 70877个。通过矮化突变体Ari1327与野生型Ari971和高秆突变体Ari3697两个文库的差异筛选,得到13919个与矮化相关的差异表达基因,其中5406个表现上调,8513个表现下调。GO功能和KEGG通路富集发现,差异基因在植物激素信号转导途径显著富集。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,推测Ari1327的矮化可能与赤霉素和生长素2种激素的信号转导及互作有关。转录组测序得到的大量差异基因,为深入研究棉花的矮化机理具有重要参考价值,同时为棉花的矮化育种工作奠定了基础。
- 安文燕孙君灵龚文芳何守朴潘兆娥杜雄明
- 关键词:矮化转录组
- 陆地棉无短绒突变体GZnn的纤维发育及其基因表达分析被引量:6
- 2009年
- 【目的】利用棉花无短绒突变体GZnn为材料,分离与棉花纤维发育相关的重要基因,从而揭示棉花纤维发育的分子机理。【方法】通过扫描电镜观察GZnn与其近等基因系TM-1在纤维发育上的差别;采用差异显示RT-PCR方法寻找GZnn与TM-1之间的差异表达片段,并进行相应分析。【结果】用扫描电镜观察突变体GZnn与TM-1的胚珠表面纤维细胞起始发生的情况,发现GZnn不仅在纤维细胞发生和延伸上延迟,而且纤维细胞总数也明显减少。利用差异显示PCR进行比较筛选,获得了12个差异表达的EST片段,其中,DS3只特异性地在GZnn开花前(-3~0DPA)的胚珠中特异表达,而在其近等基因系TM-1中没有表达,推测DS3可能是一个纤维启动过程中的MYB类负调控转录因子。【结论】本研究利用棉花无短绒突变体GZnn发现,棉纤维细胞在早期分化和形态建成过程中大量基因表达,对其中的关键基因的表达模式和功能开展深入研究将有助于阐明棉纤维分化发育的分子机理,为棉花遗传改良提供理论基础。
- 龚建杜雄明路小铎姜凌沈颂东范云六张春义
- 关键词:陆地棉MRNA差异显示RT-PCR