贾锡伟
- 作品数:31 被引量:238H指数:7
- 供职机构:集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金福建省重点科技计划项目高等学校骨干教师资助计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学环境科学与工程天文地球更多>>
- 利用引物退火控制技术克隆日本囊对虾性腺差异表达基因被引量:2
- 2011年
- 为了解日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)性腺发育及分化的分子机制,本研究采用改良的引物退火控制技术克隆到了共8个精巢、卵巢的差异表达基因.其中4个为已知基因,分别为凝血酶敏感蛋白基因、皮质棒蛋白基因、增殖细胞核抗原基因和泛素缀合酶基因;4个为未知基因,分别命名为MjACP3-T、MjACP4-T、MjACP15-T和MjACP4-O基因.采用实时定量PCR方法分析了4个未知基因在性腺发育过程的表达谱,结果表明:MjACP3-T、MjACP4-T和MjACP15-T基因在日本囊对虾精巢和卵巢中的表达量有显著差异,且在各个时期精巢的表达量均高于卵巢,说明这3个基因可能在精巢的发育中起到某些重要作用.卵巢MjACP4-O基因的表达量变化较大,第5期卵巢的相对表达量达到最高(为1.38),而其他各个阶段的变化较大,在第4期卵巢的相对表达量最低(为0.03).在精巢中,MjACP4-O基因的表达量随着精巢逐渐发育成熟呈下降趋势.定量PCR结果与引物退火控制技术的结果有着很好的一致性.研究结果表明,引物退火控制技术是一种简单高效的克隆差异表达基因的技术.采用该技术所克隆到的8个精巢、卵巢的差异表达基因,为进一步了解日本囊对虾性腺发育分化的分子机制提供了基础材料.
- 贾锡伟沈冰玲张子平王艺磊谢芳靖
- 关键词:海洋生物学日本囊对虾性腺差异表达基因
- 拟穴青蟹雌雄肝胰腺的比较转录组学分析
- 本研究通过454-FLX高通量测序技术对拟穴青蟹(Scylla paramamosain)雌雄肝胰腺的cDNA文库进行大规模测序,首次从转录组水平对肝胰腺在性腺发育调控网络中的作用进行探索.肝胰腺参与甲壳动物的消化、免疫...
- 王晓伟高洁邹志华贾锡伟林鹏张子平王艺磊
- 关键词:拟穴青蟹肝胰腺
- 拟穴青蟹chh基因近端启动子的功能分析被引量:1
- 2017年
- 甲壳动物高血糖激素家族在调控甲壳动物的变态发育、生殖、蜕皮、血糖平衡及体内的渗透压平衡等方面起着重要的作用,甲壳动物高糖激素(CHH)是甲壳动物高血糖激素家族中的重要成员.通过Tail-PCR方法克隆获得拟穴青蟹(Scylla paramamosain)chh基因的近端启动子区序列,从翻译起始位点(ATG)起,共657 bp.生物信息学分析结果显示,转录起始位点位于翻译起始位点(ATG)上游第74个碱基(A),在转录起始位点(A)上游31 bp处存在TATA box;核心启动子区位于-41^+9 bp之间,包含在线软件预测的转录起始位点;潜在的转录因子结合位点包括Oct-1、C/EBPalp、GATA-1、Sp1、Ap-1、NF-κappa B、NF-1、RAP1、HNF-3等;目前获得的chh基因启动子区中没有Cp G岛.成功构建了chh基因4个启动子不同长度片段C1—C4,分别位于-583^+205、-388^+205、-286^+205、-46^+205 bp.含启动子不同长度片段的表达载体瞬时转染HEK293T细胞和Sf9细胞后的活性分析表明,在-286^-46、-583^-388 bp区域可能存在负调控基因表达的转录因子结合位点,在-388^-286 bp区域可能存在正调控基因表达的转录因子结合位点.
- 黄丹萍张子平贾锡伟邹志华涂传灯王艺磊
- 关键词:海洋生物学拟穴青蟹瞬时转染
- 锯缘青蟹性腺发育与性别分化相关组织混合线性化cDNA文库构建及EST初步分析被引量:4
- 2009年
- 分别提取锯缘青蟹Scylla serrata卵巢、精巢、眼柄、促雄腺的总RNA,等量混合后经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5′end of RNA transcript)技术及DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建线性化cDNA质粒文库。经检测文库约含有5.3×107重组子,扩增后的文库含有1011以上重组子。文库的插入cDNA长度为0.5—2.5kb,重组率大于98%。从构建的文库中随机挑取5 202个克隆进行大规模EST测序,获得3 346条ESTs,其中长度大于100bp的高质量ESTs 2 697条。经拼接与软件分析,2 697 ESTs代表了2 522个Unigenes,包括2 355个Singlets和167个Contigs,冗余率6.49%。EST序列经生物信息学分析(BLASTX,e<10-6),发现了Sry-like protein C、Sox14 protein、Sox4b、sex-determining protein fem-1、vitellogenin、vitellogenin receptor、cyclin A、cathepsin C和cyclin-dependent kinase 2等与性别分化和性腺发育相关的基因,以及热休克蛋白家族、泛素系统、抗氧化防御体系和抗病相关的功能基因。该文库具有较高的质量和利用价值,可为更大规模EST分析及采用基因芯片技术开展锯缘青蟹性腺发育及性别分化相关功能基因的研究奠定基础。
- 邹志华张子平王艺磊陈锦民贾锡伟王淑红林鹏
- 关键词:锯缘青蟹SCYLLASERRATA性腺发育性别分化EST
- 拟穴青蟹OTUB的克隆及其在性腺发育过程中的表达
- OTUB是半胱氨酸蛋白酶OTU超家族中的一员.OTUB具有去泛素化酶的功能,同时在免疫系统中发挥重要作用.近来研究发现OTUB中的一个亚型OTUB1是哺乳动物雌激素信号通路中的一个关键因子,OTUB1可以使ER α去泛素...
- 高洁邹志华贾锡伟林鹏张子平王艺磊
- 关键词:拟穴青蟹实时定量PCR性腺发育
- 拟穴青蟹miR-34靶基因预测及其生物信息学分析
- 2017年
- MiR-34是一类在进化过程中高度保守的miRNA家族,参与机体的许多重要生命活动。本研究首先比较本实验室构建的拟穴青蟹miRNA数据库中的miR-34(spa-miR-34)和通过miRBase获得的多个物种的miR-34的序列特征,然后应用RNAhybrid和Segal Lab两种在线工具预测spa-miR-34的靶基因,用blast2go软件对这些靶基因进行功能注释和信号通路富集分析。结果表明,spa-miR-34可能的靶基因有66个,这些基因的功能主要包括氧化还原、磷酸化、钙离子跨膜运输、转录等生物学过程;信号通路主要富集于精氨酸和脯氨酸代谢、抗生素生物合成、苯丙素生物合成、糖酵解和糖异生等合成代谢通路中。spa-miR-34预测的靶基因所涉及的基因家族和通路亦包括CHH家族、ERK通路、细胞周期和UPP通路、SUMO通路。此外,spa-miR-34预测的靶基因还有蜕皮激素受体,推测spa-miR-34在生殖、蜕皮及氨基酸等物质代谢方面具有重要作用。本研究为进一步了解spa-miR-34在拟穴青蟹中的作用提供了重要参考资料。
- 梁萌萌张子平贾锡伟王艺磊
- 关键词:靶基因生物信息学拟穴青蟹
- 中国龙虾栖息习性的观察被引量:7
- 2001年
- 于1999年5月在集美大学水产学院海水养殖试验场进行中国龙虾栖息习性的试验观察。结果表明 ,正常温度、盐度条件下 ,中国龙虾有隐匿穴居、昼伏夜出的栖息习性 ,喜欢栖息于紧身或身体易于找到依靠的水平洞穴中 ,并有同穴共居现象 ,低层洞穴的栖息率高于高层洞穴 ;温度低于12℃时 ,中国龙虾夜间也很少离穴活动 ,温度低于8.6℃或高于34℃ ,盐度低于14.1或高于44.6时 。
- 陈政强陈昌生吴仲庆林楚城贾锡伟
- 关键词:中国龙虾
- 几种江蓠的养殖生物学比较
- 本文对我国沿海的几种江蓠种类的形态特征、生态习性、繁殖习性、切段再生能力以及养殖方式进行比较,为我国南、北沿海人工养殖江蓠选择适宜种类提供参考.
- 陈昌生陈政强贾锡伟纪德华
- 关键词:养殖生物学海藻类
- 文献传递
- 拟穴青蟹性腺miRNA的初步生物信息学分析
- 为了研究miRNA在拟穴青蟹性腺发育过程中的作用,我们对青蟹精巢和卵巢的miRNA分别进行了测序.精巢中,共得到436条miRs,其中不能与miRbase中已报道miRs比对上,但是有预测的发夹前体的194条,与节肢动物...
- 贾锡伟王艺磊张子平邹志华王晓伟高洁
- 关键词:拟穴青蟹MIRNA生物信息学性腺
- 基因芯片扫描中PM T信号增益与信噪比
- 2005年
- 用Cy3标记DNA片段,打印在聚赖氨酸包被的载玻片上,制作DNA芯片.在不同的光电耦合装置(photoelectric mu lti-p lication tube,PMT)电压下对DNA芯片进行扫描,研究PTM信号增益与信噪比之间的关系.结果表明,PTM信号增益仅在一定范围内与信噪比呈正相关.
- 徐景升周会贾锡伟邹志华王艺磊张木清陈如凯
- 关键词:基因芯片信号增益信噪比