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大黄鱼EST微卫星标记初步筛选被引量：4: 2011年; 通过构建大黄鱼性腺线性化cDNA文库,并经测序后获得3535条EST,对其二碱基至六碱基重复序列进行筛选,共发现微卫星位点150个,占EST序列的4.24%;其中包括二碱基重复序列64条,三碱基重复序列80条,四碱基重复序列5条,五碱基重复序列1条;三碱基重复序列是最丰富的重复单元,占53.3%。在这些微卫星序列中,(TG/GT/AC/CA)n形式在二碱基重复中最为常见,(GAG/AGG/GGA/CCT)n形式在三碱基重复序列中最为常见,分别占微卫星序列总数的26%和14%。选取其中的62条微卫星序列进行引物设计、合成与多态性检测,经过PCR扩增,2.0%的琼脂糖凝胶电泳检测,获得呈多态性微卫星引物8对,多态率为12.9%。本研究为开发大黄鱼EST微卫星分子标记和大黄鱼基因编码区微卫星的功能研究提供有价值的信息。; 谢芳靖张子平邹志华周鹏王艺磊; 关键词：大黄鱼表达序列标签微卫星

牙鲆群体生化遗传学研究——Ⅱ.等位酶的生化遗传分析被引量：6: 2003年; 应用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对牙鲆[Paralichthys olivaceus(T.et S.)]养殖群体进行10种等位酶的电泳检测和谱带遗传分析,确定了21个等位酶位点和25个等位基因,单态位点有Est-2、Est-3、Aat-2、Sod-1、Sod-2、Ldh-1、Mdh-1、Me-1、Adh-2、Sdh-2、Sdh-3、Idh-1、Idh-2、Amy-1、Amy-2和Amy-3,而这些位点仅有1个等位基因。仅有Aat-l、Sdh-1、Adh-l、Est-1和Est-4(P_(0.99)标准)5个位点是多态的,多态位点的百分数为23.81％,而这些位点有2个等位基因。揭示了牙鲆群体等位酶位点及其等位基因带谱的变异式样,为牙鲆遗传育种及遗传结构的研究提供一批等位酶位点及其等位基因参考图谱。; 黎中宝邹志华常建波; 关键词：牙鲆等位酶等位基因

拟穴青蟹性腺miRNA的初步生物信息学分析: 为了研究miRNA在拟穴青蟹性腺发育过程中的作用,我们对青蟹精巢和卵巢的miRNA分别进行了测序.精巢中,共得到436条miRs,其中不能与miRbase中已报道miRs比对上,但是有预测的发夹前体的194条,与节肢动物...; 贾锡伟王艺磊张子平邹志华王晓伟高洁; 关键词：拟穴青蟹 MIRNA 生物信息学性腺

有机锡致海洋腹足类性畸变分子机制的研究进展被引量：5: 2013年; 有机锡作为防污损生物附着添加剂曾被大量使用,在极低浓度下就能诱发腹足类发生性畸变现象,严重危害了海洋生态系统的平衡。虽然三丁基锡已被国际海事组织全球禁用,但目前报道的环境有机锡污染仍然非常严重,而且其致毒机制一直众说纷纭。首先,简述了腹足类性畸变及其在世界各个海域有机锡污染监测中的应用,重点综述了有机锡致海洋腹足类性畸变分子机制的3种假说:脊椎动物类型的类固醇激素假说、神经肽假说以及视黄酸X受体(retinoid X receptor,RXR)假说,另外,结合快速发展的分子生物学技术,探讨了研究腹足类性畸变分子机制的新思路和新方法。; 肖丽萍王淑红邹志华王艺磊张子平; 关键词：有机锡腹足类分子机制

大黄鱼ubc9基因的克隆和组织表达被引量：6: 2009年; 类泛素化(sumoylation)是一种重要的转录后修饰过程。激活的SUMO(small ubiquitin-related modifer)和E2结合酶结合稳定后共价结合到底物上,从而完成对底物的类泛素化。UBC9(ubiquitin-conjugating enzyme)作为惟一的E2结合酶,在完成类泛素化中起着重要作用。从已构建的大黄鱼性腺线性化cDNA文库中筛选出ubc9同源片段,用SMART-RACE方法克隆得到了846bp的全长cDNA序列。该序列编码一个由158个氨基酸组成的蛋白。该蛋白序列与已知的UBC9高度同源,含UBC保守结构域和UBC9激活位点区域。实时定量PCR分析ubc9基因在各组织器官的表达,结果发现,ubc9基因在大黄鱼的性腺中大量表达。推测UBC9在大黄鱼性腺发育中起重要的生物学作用。; 周鹏张子平王艺磊谢芳靖邹志华; 关键词：RT-PCR 大黄鱼

Cyclin-CDK-CKI及UPP参与生殖调控及在甲壳动物性腺发育中的研究进展被引量：15: 2010年; Cyclin-CDK-CKI是参与真核细胞周期调控的3个重要的调节因子。泛素蛋白酶体途径(ubiquitin proteasome pathway,UPP)是真核细胞内非溶酶体途径的蛋白质选择性降解的重要途径。细胞周期中许多时相特异性周期蛋白通过泛素化被周期性的降解对于细胞分裂的调控进程具有重要的作用。主要综述了Cyclin-CDK-CKI和UPP的组成、生理生化特性及其参与生殖调控的作用机制,同时阐述了这两大系统之间的联系及其在甲壳动物性腺发育中的研究进展。; 韩坤煌张子平王艺磊邹志华; 关键词：生殖调控甲壳动物性腺发育

杂色鲍Perlucin基因亚型的克隆及分析: Perluicn属于C型凝集素家族,是软体动物特有的一种凝集素。通过检索课题组自建的杂色鲍EST数据库,筛选出perlucin的6条EST,分属不同的亚型。利用SMART RACE技术获得这6条perluicn基因的全长...; 林师王国栋张丽莉邹志华王艺磊; 关键词：基因亚型基因表达杂色鲍; 文献传递

刺激隐核虫α-微管蛋白基因的克隆、原核表达及在生活史不同阶段的mRNA表达: 2018年; 从本实验室已有刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)转录组数据中筛选获得α-微管蛋白基因片段,利用5'RACE和3'RACE技术首次克隆获得其cDNA,全长为1602 bp,包含1356 bp的开放阅读框,编码451个氨基酸,预测蛋白质分子量为49.78 kD。生物信息学分析表明α-微管蛋白为亲水性非跨膜蛋白,氨基酸序列的第142～148位有特异且保守的GTP核苷酸结合位点(GGGTGSG)。对刺激隐核虫α-微管蛋白氨基酸序列进行同源性比对及进化树分析,发现其与间日疟原虫(Trypanosoma vivax)、丹氏锥虫(Trypanosoma danilewskyi)、八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)、尾刺耐格里原虫(Naegleria gruberi)、眼虫(Euglena gracilis)等的序列一致性高达94%～95%,且在系统进化树上聚为一支。采用实时荧光定量PCR技术对α-微管蛋白基因在刺激隐核虫3个生活史阶段的表达进行检测,结果显示α-微管蛋白基因的表达量在纤毛虫时期显著高于包囊和滋养体时期(P<0.05)。我们进一步构建了α-微管蛋白重组表达载体,并转化至大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)和Rosetta(DE3)中进行原核表达,SDS-PAGE分析表明,诱导表达的重组蛋白分子量约为50 kD,与预测的结果一致,即成功诱导表达α-微管蛋白。本实验结果为后续制备α-微管蛋白有效亚单位疫苗防治刺激隐核虫病奠定了基础。; 孙嘉阳张子平朱友芳邹志华韩坤煌葛辉王艺磊; 关键词：刺激隐核虫 Α-微管蛋白原核表达生活史实时荧光定量PCR

副溶血弧菌感染的九孔鲍血细胞均一化全长cDNA文库的构建被引量：15: 2008年; 采用Trizol试剂提取副溶血弧菌感染的九孔鲍血细胞的总RNA,经Oligotex纯化得到mRNA.根据SMART技术原理合成双链cDNA.双链cDNA采用双链特异核酸酶进行cDNA的均一化,构建成九孔鲍血细胞的均一化全长cDNA文库.原始文库的库容为3.4×106cfu/cm3,重组率为92.3%,扩增后文库的滴度为2.6×1011cfu/cm3以上.从文库中随机挑取897个克隆,测序获得高质量ES-Ts814条,其中有23条Contigs;762条Singlets,Unigenes共785条,冗余率只有3.56%.以上结果说明所构建的文库质量好,完全可以满足后续基因克隆和表达序列标签测序工作的需要.; 王淑红邹志华张子平施永春王艺磊; 关键词：CDNA文库九孔鲍副溶血弧菌血细胞

杂色鲍HIF-1α的基因克隆与表达分析: 缺氧诱导因子-1a(Hypoxia inducible factor-1α,HIF-1 α)为基本螺旋-环-螺线(bHLH)转录因子家族中的成员之一,并具有Per-ARNT-Sim(PAS)结构域.HIF-1 α是参与调...; 蔡秀红张子平王国栋邹志华王淑红王艺磊; 关键词：缺氧诱导因子-1Α 杂色鲍基因表达缺氧

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邹志华

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