谷妍
- 作品数:6 被引量:33H指数:3
- 供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域:化学工程理学更多>>
- 有机精细化学品的计算机辅助分子设计及软件开发
- 袁身刚郑崇直陈敏伯姚建华陈海峰董喜城张伟琪袁琼杨铄冯传莉荔建锋欧阳政罗时玮刘映晖王源张玉珍成小林谷妍
- 该项目瞄准了精细化学品分子设计的SAR/QSAR研究工具软件、三维结构数据库和组合化学模拟系统三个主攻方向,取得了一系列拥有自主知识产权的成果,为我国精细化学品工业提供了解决“生产什么”问题的技术平台。所开发的软件都吸取...
- 关键词:
- 关键词:分子设计
- 皂甙的三维定量构效关系研究被引量:7
- 2000年
- 针对目标分子柔性大的特点,在比较分子场分析(CoMFA)方法中采用交叉验证相关系数平方R^2引导的构象选择法.对12个皂甙分子的生物活性进行了三维定量构效关系研究.探讨了几种探针对构效关系结果的影响,并选择了一种较合理的“复合”探针方案.应用该复合探针构建CoMFA模型,发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为40%和4O%,其它能量项的贡献为20%.该模型交叉验证的相关系数平方R^2为0.653,非交叉验证的R^2为0.991,方差比F(4,7)值130.195(即置信度99%以上),活性预计的标准偏差与极差比(s/Δγ)为4.2%,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,预计在指定位置添加位阻较大的基团活性值提高将会比较明显.
- 谷妍陈敏伯董喜城陈海峰曾宝珊冯传莉俞飙惠永正
- 关键词:三维定量构效关系COMFA生物活性皂甙
- 含氟农药的比较分子场分析研究被引量:16
- 2000年
- 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4%和39.6%,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2%和40.8%.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6%和2.9%.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4%和6.4%.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物.
- 谷妍董喜城陈海峰陈敏伯张世相袁身刚郑崇直
- 关键词:3D-QSAR含氟农药生物活性
- 抗小麦赤霉病类含氟农药的3D-QSAR研究被引量:9
- 2000年
- 用CoMFA方法对一组含氟农药分子的抗小麦赤霉病活性进行了定量构效关系研究.发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为90.3%和9.7%,立体场的影响是占主导性的.该模型非交叉验证的相关系数(r^2)为0.991,F值是297.524,标准偏差(S)为0.015,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,设计并预测了几个新的化合物,其活性都在0.96以上,经过研究表明在预测结构的某些位置添加位阻较大的基团,活性提高比较明显.
- 陈海峰董喜城谷妍柴鸽庆张世相袁身刚陈敏伯郑崇直
- 关键词:三维定量构效关系COMFA含氟农药小麦赤霉病
- 分子模拟和3D-QSAR的研究和应用
- 分子设计是一门将理论化学与计算机实验相结合的科学.该论文的主要工作就是围绕着分子设计展开的.论文分为两大部分.第一部分主要介绍分子模拟方法,即怎样通过分子模拟找到分子的低能构象、最可几构象的几率分布.第二部分的工作-三维...
- 谷妍
- 关键词:分子模拟三维定量构效关系
- 文献传递
- 一种新的De Novo生物活性分子设计方法被引量:1
- 2000年
- 由药效团进行虚拟活性结构生成与3D-QSAR模型相结合,筛选出有前途的结构多样性的化合物,并从中寻找活性先导化合物,是一种新的分子设计方法.采用这种方法对抗小麦赤霉病类含氟农药进行了研究,共生成了53个虚拟活性结构,通过3D-QSAR模型筛选出其中10个活性较高的结构,在活性最高的化合物基础上进行了结构修饰,得到了活性更高巨毒性较低的理想化合物.研究结果表明这种方法能突破原模型化合物结构模式的局限,可以找到结构新颖的活性先导化合物,是一种非常有前途的分子设计方法,而且具有较高的筛选效率.
- 陈海峰谷妍董喜城荔建锋张世相袁身刚陈敏伯郑崇直
- 关键词:3D-QSAR含氟农药分子设计药效团