郑崇直 作品数:55 被引量:101 H指数:6 供职机构: 中国科学院上海有机化学研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 “九五”国家科技攻关计划 教育部留学回国人员科研启动基金 更多>> 相关领域: 理学 自动化与计算机技术 化学工程 医药卫生 更多>>
合成目标化合物析分系统 被引量:1 2001年 在化学反应处理的计算模型的基础上 ,完成了一个实验性的目标化合物析分系统 (TargetParsingSystem ,TPS)。目前它主要用于测试和优化反应规则的选择和表述方法。TPS的工作逻辑基本上模仿人的思维过程 ,它通过对目标分子析分找出谋略键 ,根据谋略键将目标分子分拆成前体 ,再通过对原料库的检索确定是否已是可得原料等 3个步骤完成反合成分析。通过对一些小分子和天然产物的测试 ,表明它已能给出令人满意的反合成分析结果。由于TPS在知识量上的局限性 ,对复杂化合物的析分还不可能达到实用水平。但是 ,可以预见通过对知识库的扩充和对TPS的不断完善 ,它有望发展成为一个真正意义上的计算机辅助合成设计系统。 王利莎 袁身刚 郑崇直网上logP数据库的实现 被引量:1 2000年 介绍了网上数据库查询接口的实现方法以及上网的logP数据库的库结构和查询方法。 荔建锋 杨铄 袁身刚 郑崇直关键词:数据库 LOGP 网上查询 库结构 化学数据库 化学反应处理的计算模型 被引量:2 2001年 介绍了一种将同类反应上升为合成反应知识和在计算机上实现反合成分析的方法.反合成分析是合成设计中最关键的一步,在本工作中采用了基于谋略键寻找的合成设计方法.它有逻辑宜于在计算机上实现的优点.为了实现这个方法,我们首次提出了一种能中肯地描述合成反应的计算模型--反应知识的分类模型.这一模型由三条规则定义:规则A--反应类型;规则B--发生反应的外部条件;规则C--不适宜采用这个反应的情况.这种计算模型能够将海量反应数据中最重要最基本的信息提炼出来,转换成计算机能处理的知识.它也包含有反应适用范围的信息,从而提高了析分过程的外推能力. 王利莎 袁身刚 郑崇直反应知识的层次模型 被引量:1 1999年 为在开发计算机辅助合成路线设计系统的过程中能有效地利用已知反应知识,我们提出以反应中心为核心,逐步扩展的反应层次模型来描述反应知识。本文首先简要介绍了反应知识的层次模型,再给出了反应层次模型中的基本概念的定义并以一个示例反应加以说明,最后对其进行了讨论,说明了目前的不足并提出了今后改进的方向。 王可 袁身刚 袁身刚 郑崇直关键词:知识库 有机合成化学 红外谱图中特征峰与对应子结构相互关系的确定 被引量:4 2000年 采用子结构检索、公共子结构寻找和相似指数计算的方法研究了红外特征峰与对应子结构的相互关系。说明对大量谱图信息进行统计分析确定基团的特征峰 ,是一种行之有效的方法。 陈海峰 罗时玮 姚建华 袁身刚 郑崇直 范波涛 A.PANAYE J.P.DOUCET关键词:化学结构 红外谱图 含氟农药的比较分子场分析研究 被引量:16 2000年 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4%和39.6%,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2%和40.8%.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6%和2.9%.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4%和6.4%.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物. 谷妍 董喜城 陈海峰 陈敏伯 张世相 袁身刚 郑崇直关键词:3D-QSAR 含氟农药 生物活性 乙烯基丙烯基醚Claisen重排反应机理 杨政 姜标 郑崇直 陈敏伯从C-13 NMR到化学结构——结构解析的计算机化 1992年 本文介绍了一个从C-13 NMR谱数据自动推断简单有机化合物结构的计算机系统.该系统基于拓扑子结构/C-13 NMR化学位移相关模型推导候选子结构,然后用部分重叠的方法将这些子结构拼装成候选结构,同时用模拟C-13 NMR谱的方法估评候选(子)结构.将文献上报道的247个单官能团开链化合物作为未知物进行解析,成功率为97.2%. 袁身刚 彭琛 郑崇直关键词:计算机 NMR 大批量获取分子三维结构数据的方法 被引量:7 2000年 用VisualC + +编写程序 ,并结合PC机上运行的分子模拟软件HyperChem的专用脚本语言 ,实现二维分子结构的快速批量转化 ,从而用于三维化合物数据库的建立。 杨铄 袁身刚 陈敏伯 郑崇直关键词:分子结构 数据库 高能量密度材料的分子设计 被引量:5 2000年 CERIUS2 program was employed on an Indigo2 SGI workstation to investigate the vacuum and crystal structures of the high energy density materials (HEDM). Over 20 known HEDM were first studied with an emphasis on the enthalpy of formation, optimal lattice forms, crystal lattice energy and crystal density. On the basis of the study, about 20 potential HEDM were designed. 董喜城 陈敏伯 柴鸽庆 袁身刚 郑崇直关键词:分子设计 计算机辅助设计