采用稀释涂布平板、分离培养和16S r DNA序列分析法对我国甘肃白银地区半干旱荒漠草原土壤可培养细菌、放线菌、真菌数量及群落分布特征进行了分析,比较了荒漠草原和耕地土壤微生物多样性。发现荒漠草原土壤可培养细菌、放线菌、真菌数量分别为1.23×106、0.19×106、0.18×106cfu·g-1,耕地三类微生物数量分别是3.03×106、0.53×106、0.05×106cfu·g-1。荒漠草原可培养细菌、放线菌数量明显低于耕地,而真菌数量高于耕地。从荒漠草原分离出14株细菌,分别属于γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)噬冷杆菌属(Psychrobacter),放线菌门(Actinobacteria)皮球菌属(Kytococcus),厚壁菌门(Firmicutes)芽孢杆菌属(Bacillus)、亮氨酸芽孢杆菌属(Lysinibacillus)、土壤芽孢杆菌属(Solibacillus)、气球菌属(Aerococcus),优势菌为芽孢杆菌属和噬冷杆菌属。耕地分离出可培养细菌19株,分别属于ɑ-变形菌纲(ɑ-Proteobacteri)根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium),γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)假单胞菌属(Pseudomonas),厚壁菌门(Firmicutes)芽孢杆菌属(Bacillus),放线菌门(Actinobacteria)微杆菌属(Microbacterium)、节杆菌属(Arthrobacter)、微球菌属(Micrococcus)、考克氏菌属(Kocuria),以放线菌门细菌为主(占57.9%)。从荒漠草原分离放线菌共8株,分别属于链霉菌属(Atreptomyces)、小单孢菌属(Micromonspora)、间孢囊菌属(Intrasporangium),而耕地主要为链霉菌属(Atreptomyces)、小单孢菌属(Micromonspora)。荒漠草原真菌主要是交链孢霉属(Alternaria)、芽枝霉属(Cladosporium),耕地土壤真菌包括青霉属(Penicillium)、交链孢霉属(Alternaria)、曲霉属(Aspergillus)、毛霉属(Mucor)、链孢霉属(Coniothecium)。试验结果表明,荒漠草原与耕地土壤微生物都具有较丰富的多样性,但微生物群落结构存在一定差异,同一区域不同深度土壤中微生物数量和种类也存在差异,耕地土壤微生物多样性�
从石油污染土壤分离到30株石油降解菌,经复筛得到一株适应能力强、对石油降解效率高的优势菌株JC3-1。该菌株在温度为20~40℃、p H 5~9、盐度(Na Cl)为0~3%(W/V)条件下生长良好。在以4 g/L原油为惟一碳源的培养基中生长15 d后对原油的降解率达42.15%。通过形态学观察、生理生化实验及16S r DNA序列分析,初步鉴定属于嗜油不动杆菌(Acinetobacter oleivorans)。菌株在以正戊烷、正己烷、十六烷、十八烷、苯、甲苯、二甲苯、邻苯二酚、萘、芘为惟一碳源培养基中都能很好生长。用特异性PCR检测发现,JC3-1具有酰基辅酶A脱氢酶、苹果酸合成酶、异柠檬酸裂合酶、Ton B-依赖性铁载体受体、铁载体受体蛋白、多功能脂肪酸氧化酶复合体α亚单位等代谢功能基因,及烷烃单加氧酶、芳烃双加氧酶、联苯双加氧酶、邻苯二酚双加氧酶、萘双加氧酶、甲苯双加氧酶等降解功能基因。
为丰富石油降解微生物菌种库,筛选更加高效、适应性更强的降解菌株,从西部荒漠地区石油污染土壤中分离石油降解菌,经细菌形态学、生理生化及16S r DNA序列分析进行鉴定,采用紫外分光光度法和气相色谱质谱联用(GC-MS)研究菌株生长及降解特性,利用PCR检测石油烃代谢相关基因.结果显示,分离的3株石油降解菌株KB1、2182和JC3-47在含油培养基中培养3 d后,石油降解率分别为41.02%、32.26%和55.90%,3株菌均属于红球菌属(Rhodococcus spp.),其中KB1与红平红球菌(Rhodococcus erythropolis)、2182与马红球菌(Rhodococcus equi)、JC3-47与庆笙红球菌(Rhodococcus qingshengii)的16S r DNA序列相似性分别均为100%,初步确定3株菌属于红平红球菌、马红球菌和庆笙红球菌.在温度10-50℃,p H 3-9,盐度为0-5.0%条件下菌株能很好生长,KB1和2182的最适生长温度为35℃,JC3-47最适温度为30℃,KB1和2182还可在p H 2和9.0%盐度的极端条件下生长.菌株能以十二烷、十八烷、苯、甲苯、二甲苯和萘为唯一碳源生长,其中KB1和J C3-47还能在含芘的培养基生长.GC-MS分析发现3株菌对中链及长链烷烃都具有较强降解能力,能产生表面活性剂,对十六烷具有一定粘附能力.利用特异性PCR扩增,在3株菌中均检测到烷烃单加氧酶基因、芳香烃双加氧酶基因和邻苯二酚双加氧酶基因,在KB1和2182中还检测出联苯双加氧酶基因.本研究表明,3株红球菌具有较强石油降解能力,适应性强,可用于高盐、低温等极端环境石油污染土壤的生物修复.
采用平板透明圈法从不同来源土壤样品中分离得到31株脂肪酶生产菌株,经复筛得到一株脂肪酶产量较高的菌株Mhy-1。根据培养特征、生理生化分析及16SrDNA序列同源性分析,初步鉴定菌株Mhy一1为杀鲑气单胞菌(Aeroraonas salmonicida),该菌的最适生长温度及初始pH分别为35℃和pH7.0,最适产酶温度及初始pH分别为30℃和pH9.0。采用硫酸铵盐析、DEAE—Sepharose fast flow阴离子交换层析从菌株Mhy-1的发酵上清液中分离纯化了脂肪酶,酶的分子量约为34ku,最适作用温度为45qC,最适作用pH8.0。该酶在pH7.0—9.0和温度30—70℃的范围内稳定。在70℃条件下能维持80%以上酶活力,是一热稳定酶,纯化后的酶可用于生物柴油的催化合成。