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偏分离群体遗传图谱矫正方法: <正>双亲分离群体中分子标记偏离Mendel分离比例的现象称为偏分离现象。这种现象是一种自然现象。它对连锁图构建影响的研究结果是有分歧的。在研究主效偏分离基因座(SDL)和连锁SDL对偏分离标记重组率影响的基础上,研究了...; 谢尚潜冯建英章元明; 关键词：偏分离上位性遗传连锁图; 文献传递

多歧性状关联分析的分层广义线性混合模型方法: 品种资源群体具有遗传变异大和历史性重组多等特点，蕴藏了很多可被作物遗传育种利用的优异基因，为作物遗传和设计育种提供了基础。特别地，抗病性和抗逆性等重要性状大多是多歧性状（即分级性状），表现出离散的表现型和较为复杂的非孟德...; 冯建英; 关键词：耐盐碱性; 文献传递

多位点关联分析方法学的研究进展被引量：2: 2022年; 多位点关联分析在人和动植物遗传研究中的应用日益广泛。本文综述了以混合线性模型(mixed linear model,MLM)为框架下多位点关联分析的主要方法及重要软件平台,包括全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)混合线性模型方法学的建立与发展,多位点模型方法的发展,多位点GWAS混合线性模型方法的发展,以及GWAS方法学研究的影响因素,最后展望了关联分析的发展方向。; 温阳俊冯建英张瑾; 关键词：全基因组关联分析混合线性模型软件包

多歧性状上位性关联分析的分层广义混合线性模型方法被引量：1: 2017年; [目的]作物抗性性状是重要的育种目标,通常表现为多个级别,称为多歧性状。但是,这类性状的上位性关联分析方法较少。因此,本研究针对品种资源群体探索了新的多歧性状上位性检测方法。[方法]提出了多歧性状分层广义混合线性模型的上位性关联分析方法。在遗传模型中,主效QTL、QTL间互作和QTL-环境互作为随机效应,群体平均数、群体结构和环境效应为固定效应。应用经验贝叶斯和最大似然方法分别估计这些效应。一系列Monte Carlo模拟试验和大豆耐盐碱性实际数据分析验证了新方法的有效性。[结果]新方法的统计功效高,效应估计值精度好;检测结果会受遗传率、表型分类数、表型分布、Founders数和Non-founders数的影响。用新方法分析了257份大豆品种幼苗根长耐盐碱性指数分级数据,检测到2个主效QTL、4个上位性QTL和3个QTL-环境互作,其中11个标记与其他方法或以前结果一致。[结论]本研究为植物上位性关联分析提供了新方法。; 冯建英岳秀丽倪元丽章元明; 关键词：上位性全基因组关联分析

植物关联分析方法的研究进展被引量：12: 2016年; 关联分析在人类和动植物遗传研究中的应用日益广泛,新方法及其软件包不断涌现。为对其更好选择和应用,本文综述了关联分析的主要方法及其软件包。首先,介绍了群体结构对关联分析的影响;其次,重点介绍了单位点关联分析、多位点关联分析、上位性和多性状关联分析方法及其软件包;最后,展望了关联分析的发展动向。应当指出,基于群体结构和多基因整体背景控制的全基因组单标记快速扫描算法在目前的实际资料分析中应用较广泛,与其结果互补的是假阳性率较高的非参数方法。但是,今后的方法应当是以多位点模型、环境互作、上位性检验和多个相关性状联合分析为主。这为今后的理论与应用研究提供了有益信息。; 冯建英温阳俊张瑾章元明; 关键词：全基因组关联分析上位性混合线性模型

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冯建英