谢尚潜 作品数:5 被引量:17 H指数:3 供职机构: 南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室 更多>> 发文基金: 中央高校基本科研业务费专项资金 教育部“新世纪优秀人才支持计划” 江苏省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础 被引量:4 2013年 以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境(QE)互作、QTL′细胞质(QC)互作和QTL′QTL(QQ)互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。 闫宁 谢尚潜 耿青春 徐宇 李广军 刘兵 汪霞 李其刚 章元明关键词:大豆 上位性 偏分离群体连锁图矫正和QTL定位软件包DistortedMap的研制 被引量:3 2014年 为使偏分离群体连锁图矫正方法能被广泛应用,在Microsoft Visual Studio 2010操作平台下,利用C++语言研制了Windows界面友好的DistortedMap软件包。结果显示:DistortedMap软件包具有遗传群体模拟、偏分离群体连锁图矫正和数量性状基因座定位的功能。使用该软件包可获得偏分离标记间遗传距离的无偏估计值并消除标记偏分离对QTL定位的影响。 谢尚潜 耿青春 章元明关键词:偏分离 连锁图 QTL定位 软件包 偏分离群体遗传图谱矫正方法 <正>双亲分离群体中分子标记偏离Mendel分离比例的现象称为偏分离现象。这种现象是一种自然现象。它对连锁图构建影响的研究结果是有分歧的。在研究主效偏分离基因座(SDL)和连锁SDL对偏分离标记重组率影响的基础上,研究了... 谢尚潜 冯建英 章元明关键词:偏分离 上位性 遗传连锁图 文献传递 大豆粒形性状QTL的精细定位 被引量:13 2013年 在溧水中子黄豆×南农493-1衍生的504个F2:6家系中选择Satt331~Satt592目标区间7个杂合单株和168个重组单株,衍生成356株RHL-F2个体(群体Ⅰ)和168个重组体家系(群体Ⅱ)。群体Ⅱ来自142个F2:6家系,若每个F2:6家系只保留1个重组家系则构成群体Ⅲ。采用lasso和复合区间作图(CIM)法检测3个群体粒形性状2种指标的QTL。结果表明,lasso法检测到的粒长关联标记是O19和S21/Satt331,而CIM检测到的QTL区间是S21~S22和O23~O19;lasso法检测到的粒宽关联标记是O19/O21,而CIM检测到的QTL区间是O23~O19/O19~O21;长宽比与S21~S22关联是由于粒长QTL引起的,与O23~O19/O19~O21关联是由于粒长和粒宽QTL引起的。将原Satt331~Satt592目标区间的粒长QTL剖分为与标记S21~S22和O23~O19/O19~O21关联的2个多效性QTL。根据大豆基因注释数据库,Glyma10g35240和Glyma10g34980可能是控制粒形性状发育的候选基因。 牛远 谢芳腾 布素红 谢尚潜 韩世凤 耿青 刘兵 章元明关键词:大豆 粒形 数量性状基因座 候选基因 偏分离群体数量性状多QTL定位方法 <正>偏分离是一种普遍的自然现象。虽然双亲分离群体分子标记呈偏分离现象较多,但是在这些群体中进行QTL定位研究时很少考虑标记的偏分离。我们知道,一旦分子标记出现偏分离,基于分子标记推演的QTL基因型概率会发生变化,直接影... 文佳 谢尚潜 章元明关键词:偏分离 上位性 遗传连锁图 QTL 文献传递