李建栋 作品数:35 被引量:372 H指数:9 供职机构: 南方医科大学公共卫生与热带医学学院流行病学系 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省医学科学技术研究基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 文化科学 生物学 更多>>
大肠埃希菌中强毒力岛的irp1、irp3、irp4基因检测 被引量:1 2005年 目的检测大肠埃希菌中耶尔森菌强毒力岛的irp1、irp3、irp4基因.方法采用PCR与菌落原位斑点杂交技术,检测1990~1992年分离于我国五大军区腹泻病人的106株大肠埃希菌的irp1、irp3、irp4基因,其中肠产毒型大肠埃希菌(Enterotoxigenic E.coli,ETEC)94株、肠侵袭型大肠埃希菌(Enteroinvasive E. coli,EIEC)1株、肠致病型大肠埃希菌(Enteropathic E. coli,EPEC)10株及肠凝集型大肠埃希菌(Enteropathic aggregative E. coli,EAEC)1株.结果irp1、irp3和irp4阳性检出率分别为12.3%(13/106)、86.8%(92/106)和61.3%(65/106),差异有显著性(X2=122.27,P<0.05).94株ETEC中,10株irp1阳性(阳性率10.6%),81株irp3阳性(阳性率86.2%),55株irp4阳性(阳性率58.5%);10株EPEC中,1株irp1阳性,9株irp3阳性,8株irp4阳性;1株EIEC和1株EAEC,irp1、irp3和irp4基因均为阳性.结论大肠埃希菌中携有耶尔森菌强毒力岛的irp1、irp3、irp4基因,这3个基因在小肠结肠炎耶尔森菌(Y.enterocolitica)和大肠埃希菌(E.coli)之间存在水平性转移. 王斌 叶冬青 王红 向前 李建栋 张冬梅关键词:基因 埃希氏菌属 趋化因子受体5基因启动子单核苷酸多态性与HIV易感性关系的Meta分析 被引量:1 2012年 目的:探讨趋化因子受体5(CCR5)基因启动子单核苷酸多态性(SNPs)与HIV易感性的关系。方法:在Pubmed等数据库检索有关CCR5基因启动子SNPs与HIV易感性的病例对照研究,选取文献,提取相关数据,用Stata10.0对数据进行Meta分析。结果:按照纳入和排除标准,共纳入8个病例对照研究,病例组共983例,对照组共1274例。分析的CCR5基因启动子SNPs位点共4个(59029A/G、59353T/C、59356C/T和59402A/G)。59029A/G和59353T/C位点的研究间异质性较小,使用固定效应模型。59029G等位突变的合并OR值及其95%CI是1.07(0.90~1.07),59353C等位突变合并的OR值及其95%CI是0.95(0.81~1.11)。59356C/T和59402A/G位点的研究间异质性较大,使用随机效应模型。59356T等位突变的合并OR值及其95%CI是1.34(0.86~2.11),59402G等位突变合并的OR值及其95%CI是0.88(0.63~1.23)。结论:CCR5基因启动子的SNPs与HIV的易感性可能没有关系。 朱文昌 聂军 李建栋 王云芸 陈清 俞守义关键词:HIV 趋化因子受体5 启动子 单核苷酸多态性 META分析 江门儿童急性腹泻中诺如病毒感染的流行趋势和基因型分析 被引量:3 2011年 目的:了解江门市儿童急性腹泻中诺如病毒(NV)感染流行趋势及病毒基因型别。方法:采集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本,采用RT-PCR方法检测NV,阳性标本进行测序,通过GenBank进行BLAST库比较进行基因分型。结果:2006年全年NV的检出率为14.36%(52/362),35份测序标本中32株属于GⅡ-4型,其中两株与广州分离的gz01同源性达到97%;2株属于GⅡ-3型,与2005年日本发现的毒株JP(AF315815)同源性达到99%;1株与澳大利亚发现的一株重组毒株Australia(AY919139)同源性达到99%,为新型GⅡ.bNV重组株。结论:江门儿童腹泻中全年均可检出NV,存在明显的季节差别。病毒以GⅡ-4基因型为主,也存在GⅡ-3型基因型,检出与国外同源的重组基因病毒。 唐亚丽 戴迎春 聂军 李建栋 黄宝明关键词:诺如病毒 基因型 单菌落PCR快速鉴定卡介苗fbpA基因 被引量:2 2005年 目的 分离、鉴定卡介苗fbpA基因 ,探求新型结核病疫苗的候选保护性抗原。方法 用PCR法从卡介苗基因组DNA中分离fbpA基因 ,克隆在pUCm -T载体上 ,用单菌落PCR扩增快速鉴定DNA片段后再用HindⅢ酶切进一步鉴定。结果 单菌落PCR和HindⅢ酶切鉴定证实fbpA基因与预期大小一致。结论 用单菌落PCR扩增快速鉴定克隆在pUCm -T载体上的fbpA基因是一种简便、经济的方法。fbpA基因的分离为进一步分析其功能与探索新型结核病疫苗奠定了基础。 刘凤娟 陈清 聂军 吴敏 朱利 李建栋 俞守义关键词:卡介苗 结核病疫苗 UC 菌落PCR T载体 酶切 膀胱癌表达谱的全基因组芯片检测及易感标志基因的筛选研究 被引量:2 2009年 目的采用70mer全基因组寡核苷酸基因芯片研究膀胱癌基因表达谱,获得差异基因并筛选出膀胱癌特异的肿瘤易感标志基因。方法取正常膀胱移行上皮、肌层浸润性(T2以上)膀胱癌组织各10例,抽提mRNA逆转录成cDNA后,再反转录成cRNA并标记后,与70mer oligo全基因组基因芯片杂交,洗脱,扫描及数据分析,采用Cluster及Treeview等统计分析软件比较正常膀胱移行上皮与膀胱癌组织基因表达谱差异,获得差异基因及其表达差异水平。进一步采用Panther数据库检索差异基因在各信号通路中的存在情况,初步阐述浸润性膀胱癌发生的可能的分子机制,筛选出膀胱癌特异的肿瘤标志基因。结果在19568个探针的全基因组芯片上,发现膀胱癌基因表达谱共同差异表达基因152个,其中表达上调的基因70个(膀胱癌中上调10倍以上的29个),与肿瘤发生明确相关的基因23个;下调基因81个(膀胱癌中下调10倍以上的16个),与肿瘤发生明确相关的基因17个;通过Panther数据库检索,发现上调基因涉及32条信号通路,下调基因涉及38条信号通路,其中部分信号通路已被证实与肿瘤发生密切相关。结论采用70mer oligo全基因组基因芯片分析膀胱癌基因表达谱,获得的差异表达基因及膀胱癌标志基因,对膀胱癌发生机理阐明、早期诊断以及人群基因易感性预测的前瞻性研究具有重要意义。 赵镇 毛向明 陈清 聂军 李建栋 朱文昌 石嵘 俞守义关键词:膀胱癌 基因表达谱 基因芯片 ADIPOQ基因11377C/G位点多态性与身体活动对儿童代谢综合征的影响 被引量:3 2015年 目的:探讨ADIPOQ基因多态性位点11377C/G rs266729与身体活动的交互作用对儿童代谢综合征的影响。方法:采用病例对照研究的方法,病例组114例,对照组114例。应用直接测序法检测ADIPOQ 11377C/G的基因型,用叉生分析方法研究其与身体活动的交互作用对代谢综合征的影响。结果 :活动充分是代谢综合征的保护因素,OR值为0.14;身体活动不足与11377C/G CC基因型存在交互作用,可以增加儿童代谢综合的风险。结论:身体活动充分可以降低儿童患代谢综合征的风险。身体活动与11377C/G rs266729多态性对儿童代谢综合征存在交互作用。 王凯风 叶萍 王丹 吴柳风 刘伟佳 陈清 李建栋关键词:代谢综合征 基因多态性 身体活动 广东和广西部分地区蝙蝠携带登革病毒及流行性乙型脑炎病毒的调查研究 被引量:7 2006年 目的了解广东及广西蝙蝠携带登革病毒和流行性乙型脑炎(乙脑)病毒的情况。方法2004年9月至2005年11月期间11次收集广东及广西部分地区的蝙蝠。收集的蝙蝠取脑组织标本和血清标本,采用两对登革病毒和乙脑病毒通用引物,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和细胞培养分离方法检测所采集蝙蝠标本中的登革病毒(denguevirus,DV)和乙脑病毒(Japaneseencephalitisvirus,JEV)。结果收集了4个科9个种共905只蝙蝠,其中棕果蝠154只、犬蝠395只、普通长翼蝠5只、小黄蝠52只、中菊头蝠228只、中华菊头蝠15只、小菊头蝠41只、双色蹄蝠8只、普氏蹄蝠7只。蝙蝠来源于粤中、粤西和桂东的7个县市。905只蝙蝠标本中未检测、分离到登革病毒和乙型脑炎病毒。结论未发现所调查的蝙蝠携带登革病毒和乙型脑炎病毒。 胡勇 陈清 李志峰 吴毅 胡贵方 李建栋 俞守义关键词:登革病毒 流行性乙型脑炎病毒 蝙蝠 一起家庭聚集性诺瓦克样病毒感染的调查 被引量:14 2004年 目的 :调查一起家庭聚集性非菌性腹泻病原、传播途径、临床表现以及病原学特性 .方法 :感染者腹泻粪便及其可疑食物采用RT PCR方法检测 ,并测序 .结果 :患儿、患儿父亲、患儿外公粪便标本及蟹肉标本均扩增出NLVs目的片断 ,测序分析表明该四份标本同源性为 1 0 0 % .结论 :证实该起家庭聚集性非菌性腹泻为诺瓦克样病毒感染所致 ,并在食物中检测到诺瓦克样病毒 。 戴迎春 聂军 刘翼 李志峰 李建栋 俞守义关键词:人类杯状病毒 诺瓦克样病毒 产毒性大肠杆菌腹泻的病原学和流行病学研究 陈清 俞守义 吴敏 陈义忠 聂军 王红 徐伟文 李建栋 申洪 王雅贤 甄蓓 该项目从产毒性大肠杆菌(ETEC)腹泻的流行病学、病原学特点、快速检测方法、致病机理和防治等方面进行了系统和深入研究。首次报告ETEC腹泻除了霍乱样水泻;首次在从鸡粪便中分离到ETEC,提示鸡可能与猪一样;建立了豚鼠作为...关键词:关键词:病原学 流行病学 儿童诺瓦克样病毒感染临床特征及危险因素 被引量:5 2006年 目的了解儿童诺瓦克样病毒(Norwalk-like virus,NLVs)感染的临床特征及危险因素。方法收集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本并填写调查表。对收集的标本分别采用ELISA检测轮状病毒(Rotavirus,RV)、RT-PCR检测NLVs。对调查表资料采用1∶1配对病例(NLVs)-病例(RV)及1∶1配对病例对照研究,分析NLVs感染的临床特点及危险因素。结果648份标本中检出RV 339份(52.31%),NLVs 80份(12.35%)。分析表明,NLVs所致腹泻的临床特征有别于RV腹泻,前者最早出现呕吐症状者居多(62.82%),并且有呕吐症状者多于后者。而RV腹泻患儿最早出现的症状以腹泻为主(65.38%)。发热、最高温度、发热天数、腹泻天数、是否输液治疗及就诊次数均为RV感染患儿高于NLVs感染患儿。对NLVs腹泻可能的危险因素进行单因素及多因素条件Logistic回归分析,最终筛选出4项危险因素,分别为吃生冷食品、与腹泻患者接触、吮手习惯及较少洗手。结论NLVs是导致儿童腹泻的重要病原体,其所致腹泻的临床特征不同于RV腹泻;RV腹泻临床症状较NLVs腹泻严重,但NLVs腹泻所造成的家庭经济负担不容忽视。 刘翼 聂军 詹惠春 戴迎春 李建栋 陈清 俞守义关键词:诺瓦克样病毒 杯状病毒 轮状病毒 儿童