沈海燕 作品数:11 被引量:38 H指数:3 供职机构: 广东省农业科学院动物卫生研究所 更多>> 发文基金: 广东省科技计划工业攻关项目 国家自然科学基金 广东省农科院院长基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
H7N9亚型禽流感病毒HRM检测方法的建立 被引量:3 2016年 根据H 7N 9亚型禽流感病毒(AIV)的HA和NA基因保守区域,分别设计了2对特异性引物,通过优化反应条件,建立了基于高分辨率熔解曲线(HRM)分析的H7N9亚型AIV检测方法。结果显示,该方法特异性强,其他常见禽源病毒及非H7亚型和非N9亚型的AIV不能形成特异熔解峰形;灵敏度高,对H7和N9阳性质粒的最低检测限分别达到1.0×101 copies/L和1.0×100 copies/L;重复性好,熔解峰Tm 1和Tm2的批内和批间变异系数均<1%;临床样本检测与某商品化H7N9亚型AIV定量PCR检测试剂盒比较,符合率为100%。该方法可用于临床疑似病例的应急检测、早期诊断及养鸡场、活禽交易市场等外环境H7N9亚型AIV的监测。 刘志成 贾伟新 孙敏华 沈海燕 孙俊颖 殷三鸿 钟亮宁 张建峰 张春红关键词:禽流感 高分辨率熔解曲线 RNA干扰抑制ST细胞Ⅰ型干扰素受体-2表达的研究 2016年 应用RNA干扰技术建立猪睾丸(ST)细胞Ⅰ型干扰素受体-2(IFNAR-2)基因knock down模型。采用FuGENE HD转染剂将pSiCMVE1、pSiCMVE2和pSiCMVE3干扰载体分别转染ST细胞,经荧光定量PCR和Western blot分别检测IFNAR2mRNA和蛋白水平表达变化。结果显示,与对照组比,转染干扰载体组均可明显降低IFNAR2 mRNA和蛋白的表达(P<0.05)。RNA干扰技术能够有效抑制IFNAR2基因的表达,为进一步研究IFNAR2基因的生物学功能提供可靠的手段,为研究IFNAR2在病毒感染中的作用奠定基础。 沈海燕 张春红 刘志成 孙俊颖 卢宇 张建峰关键词:RNA干扰 ST细胞 重组猪IFN-λ3原核表达及其活性分析 被引量:2 2015年 应用RT-PCR技术从多聚肌苷酸多聚胞苷酸(poly(I∶C))刺激的ST细胞中扩增猪干扰素-λ3(PoIFN-λ3)基因。基因序列分析表明,PoIFN-λ3基因全长为588bp,与绵羊IFN-λ3基因(XM_004015683)的同源性最高(87.6%);分子遗传进化树分析表明猪IFN-λ3与牛、绵羊亲缘关系最近,与马、人、黑猩猩和鸡的亲缘关系次之。将PoIFN-λ3成熟肽序列定向插入pET-32a载体,转化宿主菌Rosetta gami B,IPTG诱导表达,SDS-PAGE和Western blotting检测分析表明,PoIFN-λ3基因获得表达,重组蛋白大小为32 000,以包涵体形式存在。重组蛋白经变性、纯化、复性后,用细胞病变抑制法在MDBK/VSV系统上进行抗病毒活性的测定。结果显示,复性后重组蛋白的含量约为1g/L,抗水泡性口炎病毒(VSV)活性达到2×103 U/mg,表明重组poIFN-λ3具有较高的抗病毒作用。 周恒 沈海燕 郭鹏举 张春红 张建峰 刘志成 孙俊颖 李玉谷关键词:原核表达 抗病毒活性 猪圆环病毒2型广东分离株ORF2基因的克隆和序列分析 被引量:2 2014年 为了解广东部分地区猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)流行毒株的基因型和遗传变异情况,本研究根据GenBank中PCV2的核苷酸序列设计针对ORF2基因的1对特异性引物,从分离于广东省的8株PCV2分离株BL、HD、Li、GD01、GD02、HD01、HD02和HD03株的细胞培养物中扩增ORF2基因,扩增片段克隆到pMD18-T上,获得重组质粒,并对其进行测序。序列分析结果表明,8株PCV2分离株ORF2基因与其他PCV2 ORF2基因核苷酸序列同源性为89.7%~100%,氨基酸序列同源性为87.2%~99.6%,进化分析结果表明,其中7株分离株处于同一分支,属于PCV2b-1A/1B,HD01株属于PCV2b-1C。 沈海燕 刘志成 郭慧霞 周恒 朱余军 张春红关键词:猪圆环病毒2型 ORF2基因 抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体及其制备与应用 本发明公开了一种抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体及其制备方法与应用,属于基因工程领域。该RNA干扰载体以pEGFP-C1为骨架载体,包括猪U6RNA聚合酶Ⅲ启动子和干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板。将pEG... 沈海燕 张建峰 郭鹏举 张春红 周恒 朱余军文献传递 鸭坦布苏病毒、产蛋下降综合征病毒和H9亚型禽流感病毒三重荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:4 2017年 参考Gen Bank上已发表的产蛋下降综合征病毒(EDSV)五邻体(penton)基因序列、H9亚型禽流感病毒的HA基因和鸭坦布苏病毒(DTMUV)E基因序列,分别设计了检测EDSV、H9 AIV和DTMUV的特异性引物,扩增目的片段大小分别为110bp、281bp和266bp。通过PCR验证及引物浓度的优化,建立了针对这3种病毒的三重荧光PCR检测方法。特异性试验结果表明,该方法可以同时检测EDSV、H9 AIV和DTMUV,且不与鸭瘟病毒、鹅细小病毒、番鸭细小病毒和大肠杆菌基因组DNA以及鸭甲肝病毒1型、鸭甲肝病毒3型、番鸭呼肠孤病毒和新城疫病毒的RNA发生交叉反应;敏感性试验表明,该方法对EDSV、H9 AIV和DTMUV核酸的检测下限分别为8.0、4.8和1.3个拷贝,该方法比常规PCR方法敏感10倍;该方法重复性良好,对不同批次的样品扩增效果良好。通过标准曲线的建立以及临床样品的检测表明,该方法可以用于EDSV、H9 AIV和DTMUV的定性和定量检测。 孙敏华 李林林 董嘉文 刘志成 孙俊颖 沈海燕 张建峰 张春红p53基因RNA干扰载体的构建及其在ST细胞系中的稳定表达 2016年 利用质粒介导的RNA干扰技术,建立稳定沉默p53基因的ST细胞系。通过改造p EGFP-C1载体,构建了猪源U6启动子启动编码p53 sh RNA序列的载体,将其转染ST细胞,用G418筛选细胞,并分析获得细胞的生长特性。RT-PCR和Western-blot结果显示,质粒介导的sh RNA有效地沉默了p53基因的表达;流式细胞术和细胞生长特性分析结果显示,与对照组细胞相比,p53基因沉默组ST细胞处于S期的细胞数量增多,而且p53基因沉默组ST细胞生长较快。本研究结果证实质粒介导的sh RNA高效、稳定地沉默了ST细胞中p53基因的表达。 沈海燕 张春红 刘志成 孙俊颖 卢宇 张建峰关键词:P53基因 RNA干扰 细胞系 抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体及其制备与应用 本发明公开了一种抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体及其制备方法与应用,属于基因工程领域。该RNA干扰载体以pEGFP-C1为骨架载体,包括猪U6RNA聚合酶Ⅲ启动子和干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板。将pEG... 沈海燕 张建峰 郭鹏举 张春红 周恒 朱余军鸡贫血病毒广州株VP3和VP1基因的克隆与序列分析 2015年 采用PCR方法成功克隆了3株鸡贫血病病毒(CAr)广州株VP3和VPl的部分基因,并进行了核苷酸序列测定。序列分析表明,3株CAV广州株与国内外其他21株CAV毒株的核苷酸序列相似性在89.5%-100.0%之间;推导氨基酸序列的相似性在84.8%-98.2%之间。系统发育进化树分析显示,3株CAV广州株和中国TJBD40、SD22、SD24株都同处于一个分支上,而与马来西亚的SMSC-1株、日本的G6株以及澳大利亚的CAU269/7株的亲缘关系较远。 沈海燕 张建峰 刘志成 周恒 郭翠丽 郭鹏举 张春红关键词:鸡贫血病病毒 分子进化树 鸡毒支原体SYBR Green I荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:5 2015年 为建立鸡毒支原体(MG)的快速定量检测方法,本研究根据GenBank中登录的MG 16S rDNA基因序列设计了一对引物,以MG基因组DNA为模板扩增其16S rDNA基因片段,并克隆于pMD18-T载体中,以纯化的重组质粒作为标准品建立了MG SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法。结果表明,该方法在1.96×10~8拷贝/μL^1.96×10~2拷贝/μL范围内线性关系良好,相关系数为0.999;最低检测限可达1.96×10~1拷贝/μL;与禽类其它呼吸道病原无交叉反应,特异性良好;批内及批间变异系数均低于2%,具有较高的重复性和稳定性。采用该方法抽检30份疑似临床样品,检出率为40%,敏感性明显高于常规PCR(33%)和血清平板凝集试验方法(23%),检测活疫苗可达到精确定量每头份2.0×10~7拷贝/μL。该研究为MG的早期诊断与净化、疫苗质量监测提供了一种新的快速定量检测技术。 孙俊颖 刘志成 孙敏华 李冰玲 沈海燕 张春红 董嘉文 李林林 张建峰关键词:鸡毒支原体 SYBR 荧光定量PCR