宋欣
- 作品数：6 被引量：23H指数：3
- 供职机构：四川农业大学动物医学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 利用超声波图像活体预测北京黑猪肌内脂肪含量被引量：11
- 2012年
- 本研究旨在利用超声波图像来活体预测北京黑猪背最长肌肌内脂肪含量。试验选用382头北京黑猪开展活体测定,性状包括体质量、10～11肋间眼肌面积、背膘厚和眼肌深度,并且采集猪左侧9～13肋之间距离背中线5cm处纵向超声波图像2张,在每张图像10～11肋间选定1个大小为80×80像素的区域作为研究对象,利用图像分析软件(matlab)分别获取了灰度梯度、灰度共生矩阵、小波变换3类图像参数。屠宰后立刻取胴体左侧10～11肋间背最长肌肉样,利用石油醚抽提法测定肌内脂肪含量(IMF)。以实际测定肌内脂肪含量(IMF)为因变量,体质量、背膘厚、眼肌面积、眼肌深度和图像参数为自变量,通过逐步回归分析法建立预测肌内脂肪含量(PIMF)的模型。重新选择112头北京黑猪利用实测肌内脂肪含量与预测肌内脂肪含量的相关分析进行模型验证。回归分析结果表明,有9个自变量达到显著水平(P<0.05),包括背膘厚、眼肌面积和7个图像参数。预测模型的决定次数(R-Square)和均方误差根(Root MSE)分别为0.305 8和0.006 5。相关性分析结果得到皮尔逊积矩相关系数(Pearson Correlation Coefficients)和斯皮尔曼相关系数(Spearman Correlation Coefficients)分别为0.553 4和0.627 2(P<0.000 1)。结果表明,利用超声波图像活体预测猪肌内脂肪含量是一种可行的方法,可为北京黑猪的育种工作提供一个技术基础。
- 马小军程笃学王立刚刘欣宋欣梁晶张龙超颜华王立贤陈来华谢蜀杨
- 关键词：北京黑猪肌内脂肪
- 影响猪免疫性状的单倍型关联分析被引量：3
- 2013年
- 旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因。分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著;8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因。结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究。
- 罗维真陈少康陈少康程笃学程笃学颜华李勇王立刚宋欣马小军刘欣李稳梁晶赵克斌
- 关键词：免疫性状单倍型
- 大白猪×民猪F2设计资源群体CD4+白细胞功能性状全基因组关联研究
- 随着养猪业规模化、集约化的不断完善及猪育种工作的持续开展,养猪带来的经济效益在我国经济发展中起到了越来越重要的作用。但随着猪生长速度越来越快,其抗病性也逐渐下降,日益增高的发病率造成了极大的经济损失。因此,针对抗病性状、...
- 宋欣
- 关键词：全基因组关联研究CD4+
- 文献传递
- 猪红细胞生成素受体基因突变与血常规性状关联分析被引量：6
- 2012年
- 本研究旨在探索红细胞生成素受体基因(EPOR)影响红细胞相关性状的分子机理。对EPOR基因第1内含子和第4内含子突变位点g.705G>T和g.2373C>T,以飞行时间质谱进行个体基因型分型,在构建的大白猪×民猪F2代资源群体内开展其与6种血常规性状(红细胞压积、血红蛋白、平均红细胞血红蛋白量、平均红细胞体积、红细胞计数及红细胞分布宽度)的关联分析。结果表明,第1内含子突变位点g.705G>T未发现与血常规性状显著关联;第4内含子突变位点g.2373C>T群体内只发现2种基因型,其中CT基因型个体的红细胞压积显著高于CC基因型个体(P<0.05),但并未发现与其他性状显著关联。结果显示,EPOR基因突变可显著影响红细胞压积,说明该基因可作为影响红细胞压积的主效候选基因开展深入研究。
- 宋欣曹随忠张龙超程笃学王立刚李勇刘欣马小军梁晶陈少康罗维真颜华赵克斌王立贤
- 关键词：免疫性状SNP
- 利用大白猪×民猪F2设计资源群体开展猪瘦肉量性状全基因组关联研究
- 本研究以大白猪×民猪F2资源群体为研究对象，采用猪SNP 60KGenotyping BeadChip技术，开展胴体瘦肉量GWAS研究，为进一步鉴别显著影响胴体瘦肉量的主效基因奠定基础。
- 张龙超刘欣梁晶赵克斌王立贤程笃学罗维真颜华李勇王立刚宋欣马小军陈少康
- 关键词：全基因组胴体瘦肉量
