吕莹丽
- 作品数：10 被引量：21H指数：3
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 利用基因芯片观察抑郁症大鼠模型基因表达的变化
- 2006年
- 目的:采用高通量基因芯片观察大鼠抑郁症模型基因表达的变化,结合基因功能分类体系探讨抑郁症的发病机制。方法:实验于2004-04/2005-10在成都康弘集团实验动物中心和哈尔滨医科大学完成。采用Willner法对32只雄性SD大鼠构造大鼠抑郁症模型,应激刺激造模结束后将大鼠分为模型组和正常组,每组各8只。由基因芯片检测8只模型组和8只正常组大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因并注释于GO基因功能分类体系,分析差异表达基因与疾病的相关性。结果:实验纳入大鼠数量为16只,实验中无意外死亡、丢失及补充,进入结果分析大鼠数量为16只。对模型组和正常组,通过t检验筛选得到207个差异表达基因,涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。具有钙调蛋白依赖的蛋白激酶活性基因钙调蛋白依赖的蛋白激酶1、钙调蛋白依赖的蛋白激酶2G、钙调蛋白依赖的蛋白激酶2抑制物α、具有囊泡介导转运功能的基因突触蛋白表达下调也表明这些通路在大鼠抑郁症模型中可能被抑制;有神经肽激素活性的精氨酸加压素表达下调,验证了情感性精神障碍的精氨酸加压素的假说,即抑郁症患者精氨酸加压素功能降低,在躁狂症患者则升高。进一步验证了抑郁症的病理机制所涉及的可能是神经传递功能的多个环节。结论:单胺递质的释放、信号传导以及神经肽调节的表达变化涉及抑郁症的发病机制,提示多种功能通路与抑郁症的发病机制相关。
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- 关键词：抑郁症基因表达基因
- 基因芯片数据的预处理方法对基因表达谱后续分析的影响
- 利用基因芯片技术，研究人员能够同时检测数万个基因的mRNA转录表达水平。基因芯片这一强大的技术手段改变了生物学家认识、研究生物的方式，从传统的研究单个基因的表达水平转变为在转录组尺度上研究整个基因组表达水平的变化模式。这...
- 吕莹丽
- 关键词：基因表达谱疾病分类奇异值
- 文献传递
- 安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究被引量：12
- 2007年
- 目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。
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- 关键词：抑郁症基因表达谱GENEONTOLOGY基因功能
- cDNA芯片中重复检测值的处理方法对差异表达基因选择的影响
- 2008年
- 采用六套cDNA数据,两种常用的方法处理表达谱中对应同一条Unigene的多条克隆的表达值,分析对利用SAM和T-test筛选差异基因的影响。结果显示:表达谱中对应同一条Unigene的多个克隆之间的相关性不高,并存在许多负相关;两种处理重复检测值的方法对差异表达基因的选择有很大的影响。
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- 关键词：差异表达基因基因表达谱
- 浅析中国医患关系现状,培养医学生医患关系意识被引量：6
- 2013年
- 医患关系是社会关系的缩影。目前,由于医患关系紧张,没有妥善得到解决,所以导致医患矛盾激化,影响了社会的安定与团结。所以,需在医生和患者之间搭建一个共融、和谐、支持的平台。首要提高医务人员自身素质,同时把医患关系教学贯穿于医学生的整个学习过程中,逐渐培养学生的医患关系意识,为构建和谐的医患关系打下良好的基础。
- 吕莹丽
- 关键词：医患关系沟通技巧
- cDNA芯片缺失值处理对基于基因表达谱的疾病分类的影响被引量：3
- 2006年
- 选取了4套cDNA芯片数据,分别运用补零和K近邻的方法,对有检测缺失的基因进行了补缺失值处理,分析了不同处理对支持向量机、K近邻分类器、决策树三种分类器分类效能的影响.结果显示： 在cDNA基因表达谱数据中,对检测缺失率不高于5%的基因补缺失值是一种较好的策略,这样可以保留较多的基因供后续的功能分析,同时仍然能够保持很高的疾病分类效能.
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- 关键词：基因表达谱缺失值
- Oligo基因芯片的异常值处理对有监督疾病分类的影响
- 2008年
- 基因芯片实验产生的表达谱数据中存在大量不合格的检测点,对异常值的不同处理,对于有监督疾病分类结果的影响很大。针对此问题,在Oligo芯片数据中,在表达水平层面,通常对检测值做最大值和最小值的预处理后,进行后续分析。本研究选取了四套Oligo芯片数据集,采用不同限定芯片数据中最大值和最小值的方法,考察支持向量机、K近邻、决策树三种分类器对分类疾病样本效能的影响程度。结果显示:Dudoit等限定最大值和最小值分别为16000和100是一种合理的策略,可以达到很好的分类效果。同时发现对于小于100的检测值较多的数据集,采用限定最小值为10的策略同样能得到很好的分类效果,并可以为后续分析保留更多的原始数据。因此,合理限制Oligo芯片中的异常值,对于提高疾病分型是一种较好的策略。进一步采用功能表达谱方法,构造反映功能结点中全部注释基因的总体表达状态的均值或中值指标,利用构建的功能表达谱进行分类分析。发现不同异常值的限定方法对基于功能表达谱进行分类得到的准确率的影响较小,可以获得较稳定的分类结果。
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- 关键词：基因表达谱
- cDNA芯片重复探针检测值的一致性分析
- 2009年
- 通过SOURCE数据库对4套cDNA数据的探针进行了注释,分析了对应同一条Unigene的多个探针的检测值(即重复检测值)之间的相关性。采用两种常规方法处理了重复检测值,比较了这两种处理方法对筛选差异表达基因的影响。结果显示:Unigene的重复检测值之间存在一定比例的负相关;更新探针注释数据后的重复检测值之间的低相关比例减少,高相关比例显著提高;重复点样探针之间的相关性高于其它重复检测值,但是仍有很多低相关;两种处理重复检测值方法对于用基因表达差异显著性分析方法(SAM)与T检验方法筛选差异表达基因影响不大。
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- 关键词：差异表达基因相关系数探针
- 根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
- 2007年
- 用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
- 杨达钟国才李崇前吕莹丽张敏王栋王海敏李强郝晓峰郭政
- 关键词：抑郁症基因本体基因表达谱
