王海敏
- 作品数:3 被引量:12H指数:1
- 供职机构:哈尔滨医科大学生物信息学系更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究被引量:12
- 2007年
- 目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。
- 钟国才李强柯尊洪吕莹丽郝晓峰李崇前杨达王海敏王栋郭政
- 关键词:抑郁症基因表达谱GENEONTOLOGY基因功能
- 利用基因芯片观察抑郁症大鼠模型基因表达的变化
- 2006年
- 目的:采用高通量基因芯片观察大鼠抑郁症模型基因表达的变化,结合基因功能分类体系探讨抑郁症的发病机制。方法:实验于2004-04/2005-10在成都康弘集团实验动物中心和哈尔滨医科大学完成。采用Willner法对32只雄性SD大鼠构造大鼠抑郁症模型,应激刺激造模结束后将大鼠分为模型组和正常组,每组各8只。由基因芯片检测8只模型组和8只正常组大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因并注释于GO基因功能分类体系,分析差异表达基因与疾病的相关性。结果:实验纳入大鼠数量为16只,实验中无意外死亡、丢失及补充,进入结果分析大鼠数量为16只。对模型组和正常组,通过t检验筛选得到207个差异表达基因,涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。具有钙调蛋白依赖的蛋白激酶活性基因钙调蛋白依赖的蛋白激酶1、钙调蛋白依赖的蛋白激酶2G、钙调蛋白依赖的蛋白激酶2抑制物α、具有囊泡介导转运功能的基因突触蛋白表达下调也表明这些通路在大鼠抑郁症模型中可能被抑制;有神经肽激素活性的精氨酸加压素表达下调,验证了情感性精神障碍的精氨酸加压素的假说,即抑郁症患者精氨酸加压素功能降低,在躁狂症患者则升高。进一步验证了抑郁症的病理机制所涉及的可能是神经传递功能的多个环节。结论:单胺递质的释放、信号传导以及神经肽调节的表达变化涉及抑郁症的发病机制,提示多种功能通路与抑郁症的发病机制相关。
- 王栋李强杨达郝晓峰李崇前吕莹丽钟国才王海敏郭政
- 关键词:抑郁症基因表达基因
- 根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
- 2007年
- 用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体(GO)功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
- 杨达钟国才李崇前吕莹丽张敏王栋王海敏李强郝晓峰郭政
- 关键词:抑郁症基因本体基因表达谱