张靖
- 作品数：15 被引量：19H指数：2
- 供职机构：中国医学科学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础性工作专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- nPTB基因座上T-uc.33在小鼠神经系统发育中的功能被引量：1
- 2016年
- 目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-uc.33的RNA转录本全长;用实时荧光定量PCR检测T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织发育及神经干细胞分化不同时间点的表达谱;用siRNAs转染细胞法检测T-uc.33对n PTB所起的调控作用。结果筛选并鉴定了n PTB基因座上的T-uc.33为真实转录的超保守长非编码RNA,全长为807 nt;T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织中的表达呈显著正相关(P<0.01),并随着脑组织发育从胚胎到成年期呈现先升高后降低的趋势,在体外神经干细胞分化过程也存在差异表达;敲低T-uc.33可显著降低n PTB的表达(P<0.01)。结论 T-uc.33为n PTB基因座上的超保守长非编码RNA,对n PTB起到正向调控作用,潜在地影响小鼠脑组织发育和神经干细胞的分化过程。
- 朱丽媛赵阿妮张靖侯琳阴彬彭小忠
- 关键词：神经发育
- T波形态学分析心室复极不一致性在黑龙江省中老年人群分布特点被引量：2
- 2010年
- 目的了解心室复极不一致性T波形态学分析指标人群分布特征和相关影响因素的关系。方法分析2 514人（35~81岁,男性42.8%）的十二导联10 s数字心电图。心室复极不一致性指标包括Bazett校正QT间期（QTcB）、Frideric ia校正QT间期（QTcF）和T波形态学分析指标总QRS/T夹角余弦（TCRT）、T波形态学变异（TMD）、T波主成份比值（PCA ratio）以及相对T波残余（rTWR）。考察其年龄、性别和血压分布,利用多元回归分析进行多因素分析。结果女性QTcB、PCA ratio、TCRT、TMD和rTWR高于男性（P〈0.05）。高血压人群的QTcB、QTcF、TMD、PCA ratio和rTWR的值高于血压正常人群（P〈0.05）。多元回归显示,年龄、性别和收缩压是所有心室复极指标的影响因素,Sokolow指数仅对T波形态学分析指标有影响。结论T波形态学分析指标受年龄、性别、血压和心肌肥厚程度影响,对心室复极评价独立于QT间期。
- 杨啸林张靖韩少梅张正国朱广瑾
- 关键词：心电图心室复极
- 基因间长非编码RNA:T-UCRs转录活性的验证
- 2015年
- 目的选择小鼠大脑皮层胚胎发育阶段转录的一类非编码RNA,即基因间区的T-UCRs作为研究对象,探究小鼠基因组上基因间超保守区域的转录活性。方法 1)利用UCSC数据库(NCBI37/mm9)通过生物信息学预测筛选在小鼠14.5 d胎脑中可能表达的基因间UCR;2)Coding Potential Assessment Tool(CPAT)和Coding Potential Caculator(CPC)对筛选结果进行编码能力预测;3)RT-PCR对筛选结果进行验证;4)Real-time PCR分析T-uc.62在不同组织中的表达差异以及在小鼠不同发育阶段脑组织中的表达变化。结果 1)通过UCSC网站上的RNA-seq数据库筛选得到16个可能在小鼠E14.5脑组织中表达的基因间UCRs;2)通过CPAT和CPC分析,16个UCRs均不具有蛋白编码能力,提示可能是非编码RNA;3)经过RT-PCR验证发现有15个是可以表达的;4)以T-uc.62为例,其主要在小鼠发育阶段的脑组织中高表达,而在小鼠的成年组织中低表达甚至不表达。结论基因间超保守区域可以转录生成长非编码RNA,其中,T-uc.62主要在小鼠发育阶段的脑组织中高表达;其可能在大脑发育过程中发挥重要功能。
- 王瑞雨张靖朱丽媛彭小忠
- 关键词：UCR
- 小鼠脑皮质神经干细胞体外培养及miRNAs影响其分化能力被引量：6
- 2011年
- 目的系统建立小鼠脑皮质神经干细胞(NSCs)体外培养的技术平台,并探索一组microRNA对NSCs分化能力的影响。方法胎鼠(E14)脑皮质分离NSCs进行体外培养;免疫荧光法检测NSCs向神经元和星型胶质细胞的自然分化;Real-time定量PCR筛选一组分化前后表达水平有显著性差异的microRNA;应用新一代脂质体高效转染NSCs,将该组microRNA或其抑制物导入NSCs;Western blot检测导入的RNA序列对NSCs分化能力的影响。结果基于小鼠NSCs体外培养模型,筛选出一组NSCs分化前后表达水平存在显著性差异的microRNA(miR-124,137,128)。Western blot结果显示miR-124的反义链能够明显下调β-tubulinⅢ的表达(P<0.01),过表达miR-137和miR-128后β-tubulinⅢ的表达量有所升高。结论脂质体转染技术能够将miRNAs高效导入NSCs中;microRNA-124,137,128能够影响NSCs的分化。
- 赵祥宇舒鹏程张靖阴彬彭小忠
- 关键词：神经干细胞脂质体转染分化
- 基于大规模人群调查的心电数据库的构建被引量：4
- 2010年
- 建立基于大规模人群调查的心电数据库是心电研究中一项重要的基础性工作。本研究依据"中国人生理常数调查研究和数据库"的心电数据,建立了一个以10s十二导联同步心电信号为主要内容的关系型数据库。该数据库包含波形数据、心电可视化图形、多类心电测量数据、诊断结果、人口学信息和基本健康资料,并提供便捷的数据查询、更新和管理服务。目前该数据库记录的样本总量已达25821人,人口覆盖我国四省15个县市,涉及多个民族。该数据库的建立为心电信息学的研究提供了丰富的资源。
- 杨啸林张靖徐铖王志刚李心雅韩少梅朱广瑾张正国
- 关键词：心电图数据库
- 神经干细胞定向分化过程中编码基因表达谱分析被引量：1
- 2014年
- 目的探索小鼠神经干细胞定向分化为神经元及胶质细胞过程中重要发育基因的表达变化。方法 1)神经干细胞培养及定向分化诱导培养;2)分化神经元、星形胶质细胞的流式分选;3)针对编码基因表达谱芯片的生物信息学分析,包括基因功能聚类、通路分析等。结果 1)经细胞分选获得神经干细胞、神经元、星形胶质细胞;2)Sox2、Nestin等神经干细胞、神经元及星形胶质细胞的标志性基因表达谱式明显;3)Wnt通路、Insulin通路、P53通路活性的改变在定向分化细胞类群中存在细胞特异性。结论神经干细胞的分化过程是一个多基因通路综合变化的复杂网络。
- 张靖朱丽媛阴彬侯琳彭小忠
- 关键词：神经干细胞定向分化WNT通路P53通路
- 心肌缺血中心率变异性的符号动力学分析被引量：1
- 2010年
- 目的基于心率变异性（HRV）研究，分析心肌缺血发生过程中心率的动态变化特性以探讨自主神经活动的变化和影响。方法从长时ST段一T波终点（Long．term ST-T）数据库中，选取13个记录中共193个心肌缺血时段及其前后各5min的对照时段。选用符号动力学方法分析不同时段的RR间期序列，利用重复测量的方差分析对缺血前和缺血中以及缺血后结果进行检验；以线性拟合的方式，分析心肌缺血时自主神经响应模式随缺血持续时间的分布。结果较之心肌缺血前后，心肌缺血过程中0v％的显著增加和2UV％的显著减小反映了交感神经活性的增加和迷走神经活性的减弱，但这种自主神经平衡向交感神经更占优移动的趋势随着缺血持续时间的延长而减小，提示可能存在的对心脏的保护作用。结论符号动力学分析为研究心肌缺血中自主神经的调制提供了一个敏感的工具。
- 张靖李心雅李心雅
- 关键词：心率变异性心肌缺血符号动力学自主神经系统
- 自然反义转录物Lmo4as对神经系统重要编码基因Lmo4的调节作用
- 2014年
- 目的探索小鼠神经系统重要编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对该编码基因的表达调控功能。方法 1)使用c DNA末端快速扩增(RACE)与RT-PCR技术,验证Lmo4as是否具有多聚腺苷酸(poly A)尾,克隆Lmo4as的全长序列;2)使用实时定量PCR和原位杂交技术确定Lmo4as及相应编码基因的时空表达谱;3)使用荧光素酶报告基因实验在体外验证Lmo4as对Lmo4是否具有调控作用。结果 1)Lmo4as是一个具有多聚腺苷酸(poly A)尾的非编码RNA转录本,获得其RNA全长信息;2)Lmo4as与相应编码基因转录Lmo4的丰度在时间上具有协同性,而在空间表达上具有明显不同的分布;3)Lmo4as对Lmo4在转录后水平具有负性调节作用,另外miR-124也能够抑制Lmo4的表达。结论编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对其转录后水平的负性调节与microRNA的调节共同发挥作用。
- 张靖吴朝朱丽媛阴彬侯琳彭小忠
- 关键词：原位杂交转录后调控
- 神经接头蛋白Dok6下游作用蛋白的鉴定及初步功能分析
- 2013年
- 目的 Dok6下游作用蛋白的鉴定和初步功能分析。方法利用anti-Dok6的抗体进行免疫共沉淀实验,然后通过Western blot,银染分析,质谱鉴定以及后续的生物信息学预测及分析其潜在的生理功能。结果本实验得到了26个可能与Dok6发生直接或间接相互作用的蛋白,这些蛋白分别参与了体内众多的生理过程。为了缩小研究范围,选取了与神经系统发育及细胞内信号传导相关的9个蛋白作为研究对象进行后续的功能研究。结论通过质谱鉴定以及生物信息学综合分析得到的潜在Dok6下游蛋白将给研究Dok6的生理功能及阐述其相关分子机制提供重要的依据。
- 潘艳芳李玮琦杨彬张靖阴彬彭小忠
- 关键词：免疫共沉淀质谱鉴定功能分析
- PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
- 2013年
- 目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。
- 赵阿妮朱丽媛吴朝刘雪梅阴彬张靖
- 关键词：ESTS生物信息学分析LONG表达谱分析
